Поспешное свертывание работы комиссии Уоррена только усилило слухи о заговоре.
Наиболее популярной была версия, связанная с заговором мафии кубинских националистов и представителями военно-промышленного комплекса. Возможно, истина никогда не станет известна, но в 49-м катрене четвертой центурии Нострадамус явственно намекает, что на свете существует человек, которому известна правда о трагедии Кеннеди. Возможно, он жив и по сей день.
Быть может, за сотни лет до гибели президента Кеннеди Нострадамус уже знал скрытые подробности относительно третьей пули. Он пишет в 37-м катрене шестой центурии:
Старинные труды будут завершены,
и с кровли зло обрушится на великого человека.
Из-за смертей они обвинят в этом деянии невиновного,
виновный же скрылся в туманных лесах.
Оба брата Кеннеди находились в состоянии войны с лидером мафии Сэмом Джанканой и его «правой рукой» Джимми Хоффой, главой одного из самых влиятельных объединений Америки. Роберт Кеннеди, занимавший пост министра юстиции в правительстве своего брата, объявил, что его первоочередная цель в борьбе с преступностью — подпольная империя Сэма Джанканы. Джимми Хоффа был приговорен к тюремному заключению за вымогательство, и после суда кое-кто слышал, как он сказал, имея в виду Роберта Кеннеди: «Надо бы сбить спесь с этого наглеца…» У мафии были прочные связи с Кубой, и не исключено, что эта преступная организация помогла кубинским агентам убить президента в отместку за планы ЦРУ убить Фиделя Кастро. Шеф ФБР Эдвард Гувер, не испытывавший особой симпатии к своему начальнику, министру юстиции Роберту Кеннеди, возможно, помог замести следы убийства.
В 1978 году выборная комиссия по расследованию убийств предприняла повторное расследование. Свидетели показали, что слышали третий выстрел с травяного пригорка; объясняли, что скрыли эту информацию от комиссии Уоррена, поскольку ФБР угрозами заставило их молчать. Выборная комиссия пришла к заключению, что, хотя свидетельства указывают на возможность заговора, представить доказательства этого достаточно сложно.
Совершенно очевидно, что Ли Харви Освальд был связан с Джеком Руби и кубинцами, но остаются серьезные сомнения в том, что именно он убил Кеннеди. По данным проверки голоса, сделанной на основании записи интервью Освальда с прессой, подозреваемый говорил правду, утверждая, что президента убил не он.
Известно, что Джек Руби был агентом мафии и работал под контролем Сэма Джанканы. Слова Нострадамуса «старинные труды завершены» могут подразумевать, что Руби убил Освальда по приказу мафии. Но можно найти и более широкое толкование этой фразы, вспомнив о влиянии тайных обществ вроде масонов, «Сионского Приората» или иллюминатов на правительство.
Когда Нострадамус писал: «…они обвинят в этом деянии невиновного», он, вероятно, имел в виду Ли Освальда. По поводу настоящего убийцы Кеннеди провидец говорил: «виновный же скрылся в туманных лесах». В видении, поведавшем ему об этом событии, Нострадамус, возможно, видел смутный, «туманный» образ человека под деревьями на пригорке, целящегося из винтовки из-за деревянного забора. В таком случае, вероятно, это был весьма «туманный», воссозданный при помощи компьютера фотопортрет, который приводит журналист-исследователь Билл Куртис в своем сенсационном документальном телефильме «Человек, который убил Кеннеди».
Аналогичные теории заговора окружили смерть Роберта Кеннеди в 1968 году. В ружье убийцы Сирхана Сирхана было только восемь зарядов, но в коридоре отеля «Амбассадор» прогремело десять выстрелов. Роковую пулю выпустили с расстояния в четыре дюйма, а Сирхана Сирхана отделяло от Роберта Кеннеди расстояние от двух до пятнадцати футов. Согласно показаниям матери Сирхана Сирхана, за восемь месяцев до убийства он связался с незнакомцами, которых она не одобряла. Личности этих незнакомцев так и не были установлены. Лица, предположительно ответственные за организацию обоих заговоров — Джимми Хоффа и Сэм Джанкака, — в настоящее время мертвы. Первый, как утверждают, был убит после освобождения из тюрьмы, а второй застрелен в Нью-Йорке.
За три года, прошедшие после убийства президента Кеннеди, умерло семнадцать свидетелей этого события: двое покончили жизнь самоубийством, трое погибли в автокатастрофе, трое — от сердечных приступов, шестерых застрелили, одного нашли с перерезанным горлом, а еще один скончался от каратистского удара по шее. Лишь одну смерть из этих семнадцати можно приписать естественным причинам.