Приморские полки участвовали и в сражении у Бабадача в конце войны, когда в составе сухопутного корпуса они атаковали турок, обратившихся в бегство после непродолжительного сопротивления. Война с турками завершилась подписанием Ясского договора 1791 г.
Воспользоваться началом боевых действий между Россией и Турцией решил шведский король Густав III, который вознамерился вернуть Выборг и Карелию. В первый день марта 1788 г. на одном из военных советов он принял решение нанести удар по Петербургу, а именно с помощью флота совершить высадку крупного десанта на Ижорской возвышенности. При этом командующие как корабельным, так и шхерным флотами заявляли о неготовности к ведению войны в обозримом будущем. Король проигнорировал их заявления и в апреле объявил военные сборы.
Боевые действия начались вторжением шведской армии (36 тыс. чел.) в Финляндию и осадой крепости Нейшлот. В начале июля разыгралось Готландское морское сражение (недалеко от Кронштадта), в результате чего шведы вынуждены были отступить к Свеаборгу. Морские пехотинцы корабельного и гребного флотов не принимали участия в этих событиях. Правда, 1 роту морских солдат отрядили в распоряжение адмирала Грейга, однако непосредственно в столкновениях со шведами она задействована не была.
В июле же под Выборг были переброшены 500 чел. Адмиралтейского батальона, а также чины Сводного гренадерского батальона Его Высочества Цесаревича Павла Петровича, но на первых порах они не привлекались в действующие флот и армию.
Только через год морской пехоте довелось участвовать в столкновениях с неприятелем. 13 августа 1789 г. состоялось Роченсальмское сражение между русским гребным флотом (при поддержке нескольких кораблей) под командой вице-адмирала К. Нассау-Зигена и гребными судами шведского адмирала Эренсверда. Солдаты гребных батальонов, отвечая огнем на огонь противника, сумели прорваться на рейд и поучаствовали в разгроме шведского флота. В бою сражались и гренадеры Его Высочества.
В сентябре удачные операции совершили десантные группы в составе галерных и армейских солдат и матросов. Благодаря их вылазкам были разбиты 2 отряда шведской пехоты и драгун, захвачены 2 вражеские батареи.
1790 г. складывался для русских флотов не столь удачно, и гребная эскадра П.Б. Слизова потерпела поражение в начале мая у Фридрихсгама. Правда, шведов удалось запереть в Выборгском заливе и основательно потрепать. В постоянных стычках с неприятелем проявили себя галерные и корабельные солдаты, которые неоднократно атаковали его позиции на берегу и участвовали в нападениях на вражеские суда. Несмотря на превосходящие силы русских, шведам удалось, правда, не без потерь, вырваться в открытое море, а 28 июня во втором Роченсальмском сражении разгромить русские силы; вскоре после этого военные действия завершились.
Занимательный сюжет в истории морской пехоты связан с экспедицией в Средиземное море выдающегося флотоводца Ф.Ф. Ушакова, последовавшей через несколько лет после окончания второй русско-турецкой войны.
Павел I, обеспокоенный активностью Бонапарта, захватившего Мальту (русский император считался Великим Магистром Мальтийского ордена), а также угрозой заключения союза между турками и французами, в результате чего эскадра последних могла появиться в Черном море, и испытывая страх перед установлениями Французской революции, направил Ушакову Высочайший Указ от 25 июля 1798 г. В нем предписывалось отправиться в крейсерство в Дарданеллы, далее войти в Босфор и действовать совместно с турками против французов, причем боевые операции русского флота не возбранялось проводить и «далее Константинополя». Получив указ 4 августа в Севастополе, Ушаков тотчас приступил к сборам. Его эскадру составили 6 линейных кораблей, 7 фрегатов и 3 посыльных судна. На борту кроме матросов и артиллеристов находилось 1700 морских пехотинцев черноморских батальонов. 13 августа эскадра снялась с якоря.