Из других икон местного ряда в историческом и художественном отношении замечательна Казанская икона Божией Матери, которая поступила в Данилов монастырь из Поволжья. Она состоит из средника и клейм, иллюстрирующих «Сказание о явлении чудотворной иконы Пресвятой Богородицы в городе Казани». Автор сказания — священномученик Ермоген, Патриарх Московский и всея России, чудотворец (умер в 1612).
Икона «Семь Вселенских Соборов» (предположительно, вторая половина XVII века) с конца 1720-х находилась в местном ряду иконостаса церкви Святых Отцов Семи Вселенских Соборов, справа от Царских врат. Она была утрачена после закрытия обители. Благодаря публикации архимандрита Амфилохия современные иконописцы смогли восстановить ее иконографию. Новая икона «Господь Вседержитель и Семь Вселенских Соборов» была написана в 1989 и находится на своем историческом месте, справа от Царских врат. В среднике иконы изображен Иисус Христос — Глава Церкви. В клеймах на ее полях представлены участники Семи Вселенских Соборов, состоявшихся в IV–VIII столетиях. В центре каждого клейма на фоне храма изображен Византийский император, при котором созывался Собор. По сторонам от него — участники Собора, разделенные на группы православных и еретиков (последние — без нимбов). Каждое клеймо включает в себя надпись, содержащую сведения о Соборе.
Для иконостаса в приделе во имя благоверного князя Даниила была использована древняя, почти забытая техника оловянного литого узорочья XVII столетия. Позолоченные металлические пластинки с тонким узором уложены на слюдяную прокладку, под которой — цветной фон. При попадании солнечных лучей на слюду создается «игра света».
Из придела для прихожан открыт доступ к мощам святого благоверного и преподобного князя Даниила. В этом же приделе находится ковчег с частицей мощей святителя Николая, архиепископа Мир Ликийских. Эта святыня была подарена монастырю в 1991. Святых, столь любимых, как святитель Николай, немного, его почитают не только все христиане, но и люди других вероисповеданий. Причина такой любви — в бесчисленных чудесах, которые совершались по его молитвам. Святитель Николай — покровитель всех путешествующих на суше и на море. Угодник Божий сегодня, как и прежде, помогает всем, с верою обращающимся к нему.
К началу XVIII века монастырь полностью оформился в своих границах: территория имела в плане вид трапеции и со всех сторон защищалась каменными крепостными стенами с зубцами (мерлонами). Углы усилили десятигранными башнями, выступающими из стен. У каждой из них были своеобразное шатровое завершение со смотровой площадкой и флюгер на нем. Функциональное назначение башен различалось — проездные, глухие, угловые.
К середине XIX века территория монастыря была настолько заполнена захоронениями, что встал вопрос о ее увеличении именно ради кладбища. В? 869 утвердили проект расширения в западном направлении. Новую стену с двумя угловыми башнями и парой ворот спланировал архитектор В. Н. Корнеев (Карнеев). В результате реконструкции общая площадь обители возросла почти вдвое, еще более вытянувшись в западном направлении вдоль Камер-Коллежского вала (ныне улица Даниловский Вал).
Первым отреставрированным объектом в монастыре стала Новоданиловская башня. Работы провели в кратчайшие сроки — за два месяца. Башня была готова к 15 декабря 1983 и сразу привлекла внимание москвичей своей белизной и медной кровлей, выделившимися на фоне почерневших стен.
К 1990 отреставрировали все стены и башни монастыря. Они получили следующие названия (считая от крайней северо-восточной по часовой стрелке): Новоданиловская, Кузнечная, Алексеевская, Настоятельская, Георгиевская (Никифоровская), Нагорная, Патриаршая, Синодальная.