Даниловская икона Божией Матери «Троеручица» — московского письма. Она упоминается впервые в монастырской описи в? 725.
На северо-западном столпе собора находится одна из главных святынь обители — икона преподобного Иоанна Кассиана Римлянина. Этот образ создан в середине XVIII века и пожертвован в монастырь его щедрым благотворителем статским советником Глебом Алексеевичем Владыкиным.
Икона написана маслом в академической манере середины XVIII столетия. Она особо почиталась в семье дарителя и была украшена золоченым серебряным окладом и венцом с разноцветными камнями над головой преподобного. В его левой руке — свиток с духовно-назидательным текстом из собственных сочинений: «Итак, решившись служить Богу, пребывай в страхе Божием и приготовь душу свою не к покою, бездействию и наслаждениям, ибо многими скорбями подобает войти в Царствие Божие…»
Монахиня Митрофания (в 1861–1874 — игуменья Серпуховского Владычнего монастыря) обратила внимание на редкую икону и пожелала поместить ее в иконостасе придела Святого князя Даниила. С этой целью она заказала для нее большую раму и сама расписала ее. На раме изображены икона Божией Матери «Утоли моя печали» и шесть клейм с житием преподобного Кассиана, все они имеют авторскую подпись. Выбор сюжетов говорит о глубоком проникновении в сущность аскетических подвигов святого.
Из современных вкладов в монастырь выделяется икона Живоначальной Троицы (вторая половина XVI века). Она была пожертвована в 1986 жителем Москвы.
О происхождении этой иконы, к сожалению, ничего неизвестно. Ее развернутая архаичная иконография включает изображения Авраама и Сарры, а также юноши-слуги, закалывающего тельца. Однако рисунок ангелов близок образу «Святой Троицы» письма преподобного Андрея Рублева. В колорите иконы преобладают плотные, насыщенные цвета с обилием яркой киновари. Все это позволяет предположить, что образ происходит из северных областей Средней Руси, где влияние московской живописи сочеталось с местными иконописными традициями.
Икона с изображением преподобного и благоверного князя Даниила находится на левом центральном столпе собора, над ковчегом со святыми мощами князя. Она была написана в 1985 протоиереем Вадимом Смирновым (ныне игумен Никон, настоятель Афонского подворья в Москве) специально для восстанавливаемого храма. На иконе князь с воздетыми руками отечески ходатайствует пред Господом за всякого приходящего и молящегося здесь.
На правом центральном столпе расположена парная икона — святого благоверного князя Александра Невского (1220–1261), под ней — ковчег с довольно большой частицей его мощей, переданной из Московского Кремля. Великий князь Александр Невский — отец основателя обители, святого князя Даниила Московского, защитник рубежей России, покровитель воинов, канонизирован в 1547.
В Даниловом монастыре всегда особо чтили преподобного Сергия, игумена Радонежского. В Троицком соборе обители (в северном приделе) находятся две иконы святого. Большую храмовую икону преподобного Сергия Радонежского (конец XIX века), написанную в Сергиевом Посаде, пожертвовал архимандрит Герман (Красильников), настоятель Казанского храма в селе Шеметове Московской епархии. Отец Герман долгие годы окормлял духовных чад последнего настоятеля Данилова монастыря архиепископа Феодора (Поздеевского) и после открытия Даниловой обители передал в нее много икон, книг и исторических ценностей. В малую аналойную икону (XIX столетия) вложена частица честных и многоцелебных мощей игумена Радонежского.
