На выступе Голгофского придела находится керамический портал, который в 1680-х годах был заложен белокаменными плитами с высеченной на них стихотворной летописью Воскресенского Новоиерусалимского монастыря. Под Голгофой два придела. В одном из них - приделе Усекновения главы Иоанна Предтечи - сохранилось простое белокаменное надгробие над могилой патриарха Никона. Рядом с надгробием белокаменная плита со стихотворной эпитафией.
Сильную продольную вытянутость сооружения при взгляде с юга частично нейтрализовала группа вертикально ориентированных объемов - крестово-купольная часть, ротонда и колокольня. На западе в композиции здания главенствует монументальный объем ротонды с высоко взметнувшимся шатром.
В облике собора Новоиерусалимского монастыря найдено органичное сочетание монументальности и декоративности. В этом исключительно велика роль керамического или, по терминологии того времени, ценинного убранства. В XVII веке Воскресенский собор снаружи и внутри был украшен полихромной керамикой - изразцами. Изразцовые пояса, расположенные по периметру здания согласно его членению на ярусы, объединили все объемы в единое целое. Херувимы фриза второго яруса символизировали ангельские чины. На уровне третьего яруса собора располагался фриз «павлинье око». В сочетании с керамическими балясниками кровельных ограждений он виделся широким красочным подзором с фестончатыми подвесками.
«Павлинье око» - единственный крупномасштабный фриз собора. Свое название он получил из-за сходства основного мотива его орнамента - стилизованного цветка граната - с глазком на пере павлина. У этого орнамента двойная символика. Гранат - символ мученической смерти, символ кровавой жертвы. Павлин - «священная райская птица» - символ воскресения. Повторяющийся мотив орнамента составлен из 18 крупных изразцов. Ширина фриза с подвесками - 150 см. «Павлинье око» сохранилось лишь на стенах апсиды Воскресенского собора снаружи и внутри. Впервые исполненный для украшения этого храма, орнамент стал одним из самых популярных в московской архитектуре XVII века.
Большое значение в оформлении фасадов Воскресенского собора в XVII веке имели многочисленность и многообразие керамических оконных наличников. Сложными наличниками в виде двухколонных портиков выделялись окна алтарей. Особую роль играли перспективные, с полуциркульным завершением оконные проемы второго яруса. Опоясывая здание по периметру, они сообщали его частям единый торжественный ритм. Пышные ордерные, с полукруглыми фронтонами обрамления окоп, освещающих центральное пространство собора, должны были подчеркнуть объем крестовой части и рассчитаны были на восприятие с дальних точек.
На стенах изразцовые композиции располагались по двум принципам: конструктивному и иерархическому. Керамика, использованная как активный формообразующий элемент, придавала цельность грандиозному, разнообразному по формам и объемам зданию, создавала гармонию отдельных элементов и целого, подчеркивала архитектонику сооружения. Одновременно она выделяла наиболее важные с точки зрения символики храма части - главы, центральный объем, Голгофский придел, главу подземной церкви.
Изразцам Воскресенского собора в XVII веке принадлежала решающая роль не только в декоре фасадов, но и в оформлении интерьеров. Собор - единственный памятник русской архитектуры XVII века, который имеет керамические иконостасы. Из десяти уникальных иконостасов XVII века сохранилось в настоящее время семь. Остальные были разобраны из-за плохой сохранности в XVIII веке. Особенно интересны восьмиметровые трехпролетные иконостасы трех заалтарных приделов и пятипролетный иконостас придела Успения Богоматери.