В музее экспонируются две одинакового размера иконки «Гурий, Самон и Авив». Эти святые считались покровителями домашнего очага, к ним обращались с молитвами о благополучии семьи. Их изображения каноничны и на первый взгляд очень схожи. Но в одной иконе фигуры святых приземистые, крепкие, с энергичными жестами и поворотами. В другой - изящно вытянутые, единообразные и статичные. Первое произведение исполнено волевой силы, внутреннего движения, второе - созерцательности и покоя. Несмотря на различие художественных приемов и цветовой гаммы, оба произведения близки московской живописи.
Местные школы иконописи, возникновение и расцвет которых связаны с периодом раздробленности Руси, начинают терять свое значение уже в XVI веке. В процессе образования единого Московского государства складывается общерусское искусство. Однако и в памятниках XVII столетия можно проследить особенности местных художественных традиций. Они ощущаются в большой храмовой иконе «Рождество Христово» конца XVII - начала XVIII века, вывезенной из Ярославля. В целом памятник более архаичен, чем знаменитые произведения ярославской живописи этого времени. Сюжет представлен в кратком иконографическом изводе, без жанровых и повествовательных деталей. Но трактовка фигур волхвов и пастухов, ниспадающие завитками-раковинами края одежд Иосифа в сцене купания младенца, ярко-голубой цвет, вкрапленный в темную гамму красно-вишневых и желто-коричневых тонов имеют прямые аналоги в иконах и фресках поволжских мастеров.
Иконопись XVIII века представлена в собрании музея как отдельными памятниками, так и небольшими комплексами. Среди произведений петровского времени выделяется «Алексей человек божий в житии». Икона делится на средник с полуфигурным изображением святого и клейма со сценами его жития. Подобные произведения создавались на основе литературных источников. «Житие Алексея» появилось в V веке в Сирии. Один из исследователей назвал его «восточным романом». Ярко выраженное демократическое начало способствовало популярности этого жития на Руси. В XVII - XVIII веках появились стихотворные варианты его, исполнявшиеся народными певцами и сказителями.
В житии повествуется о сыне богатого римского вельможи, который, оставив семью и невесту царского рода, добрался до Месопотамии и поселился в притворе Эдесского храма. Посланные на розыски слуги не узнали изнуренного постами и молитвами Алексея и подали ему милостыню как «убогому». Слава о благочестивом нищем распространялась по городу. Тяготясь почестями, он покидает Эдессу. Буря заносит корабль в Рим, где Алексей встречает отца и, неузнанный, просит приютить его. 17 лет он живет под видом странника в родительском доме, смиренно снося притеснения слуг. Перед кончиной Алексей пишет историю своей жизни и умирает, сжимая в руках «хартию», из которой родители и невеста узнают наконец о его судьбе. Икона «Алексей человек божий» привлекает добротностью ремесленного исполнения, отвечавшего, очевидно, вкусу заказчиков, чьи соименные святые представлены на полях. Наряду с традиционностью композиционных схем, статичностью фигур, простотой цветовых сочетаний в иконе присутствуют элементы искусства нового времени, сказавшиеся в объемных, с резкими переходами от света к тени ликах, в детализации городских пейзажей. Средник и клейма в иконе «Алексей человек божий» обрамлены рамками барочных очертаний. Иногда, особенно для иконостасов, иконы писали и на досках в форме картуша. В центре помещали изображение, а поля украшали резьбой. В музее экспонируется превосходный образец такого картуша со сценой «Богоявления» второй половины XVIII века. В некоторых памятниках иконописи этого времени заметно влияние декоративно-прикладного искусства. Примером может служить небольшая, очень изящная иконка «Богоматерь Курская». Ее средник имеет необычное живописное решение. Одеяние Марии не вишневое, как того требует традиция, а песочно-желтое, с золотыми высветлениями и коричневыми прорисями складок. Фон золотой, окаймленный серебряной рамкой. Если монохромная живопись средника похожа по колориту на драгоценный оклад, то яркая красочность полей, где в бутонах изображены полуфигурки апостолов, напоминает древнерусское лицевое шитье.