Первые книги, напечатанные в России новым, гражданским шрифтом, были подчинены насущным задачам русского общества и отвечали его повышенному интересу к достижениям западноевропейской науки, техники, культуры. В период правления Петра I были изданы (или подготовлены к изданию и выпущены при его преемниках) многочисленные учебники, книги по военному искусству, математике, архитектуре. Как правило, они снабжались множеством гравюр, носящих сугубо прикладной характер: схемами, чертежами, планами крепостей. В фондах музея хранятся «Новейшее основание и практика артиллерии» Э. Брауна и «Новое крепостное строение» М. Кугорна (1710), напечатанные в 1733 году «Мемории или записки артиллерийские» П. С. де Сен-Реми.
К числу безусловных раритетов первой половины XVIII века принадлежит «Описание коронации Анны Иоанновны» (1730), издание альбомного типа с роскошными гравюрами. Весьма популярен в российском быту был гравированный «Брюсов календарь» (музей располагает изданием XVIII века).
В музее собрана значительная коллекция изданий типографии Академии наук. В 1740 году в ней был выпущен подготовленный Антиохом Кантемиром десятилетием ранее перевод труда Б. Фонтенеля «Разговоры о множестве миров», который вызвал протесты со стороны Синода. Автор в довольно популярной форме излагал учение Коперника и некоторые передовые философские системы. В обширном примечании переводчика впервые для отечественного читателя разъяснились многие научные понятия, что было попыткой создания русской научно-философской терминологии. В дальнейшем типография Академии наук выпустила первые издания русских летописей, оригинальные сочинения русских историков, описания России, сделанные известными учеными-путешественниками П. С. Палласом, С. Г. Гмелиным, Г. Ф. Миллером, издания трудов математика Л. Эйлера, медика Л. Гейстера, естествоиспытателя 5К. Л. Бюффона. Из книг, вышедших в других типографиях, выделяется известный труд И. И. Георги «Описание всех в Российском государстве обитающих народов» (1776 - 1777) с серией из 90 раскрашенных гравюр, который до сих пор не потерял своего научного значения. Достаточно полно собраны издания трудов М. В. Ломоносова.
Особую коллекцию составляют книги, характеризующие передовую общественную мысль в России XVIII - начала XIX века. Это прежде всего издания виднейшего деятеля русского просвещения Н. И. Новикова. Значительной редкостью является его сатирический журнал «Трутень» за 1770 год, когда он был запрещен правительством Екатерины II. Музейный экземпляр журнала в XIX веке принадлежал известному коллекционеру и издателю П. А. Ефремову, подготовившему переиздание текстов «Трутня». Публикации источников по русской истории (прежде всего «Древняя российская вивлиофика»), переводы произведений европейских авторов; периодические издания, находящиеся в фондах музея, достаточно полно представляют размах издательской деятельности Н. И. Новикова. В эту же коллекцию входят напечатанные в других типографиях работы французских энциклопедистов, оригинальные сочинения и переводы русских просветителей Н. Н. Поповского, Я. П. Козельского, Д. С. Аничкова.
Коллекция книг первой половины XIX века не может считаться значительной и систематической. В ней отсутствуют многие наиболее интересные издания этого периода. Тем не менее музей располагает прижизненными изданиями литераторов начала XIX века:
Н. М. Карамзина, И. И. Дмитриева, К. Ы. Батюшкова, В. А. Жуковского, А. А. Бестужева-Марлинского. В коллекции находятся отдельные выпуски журналов, некоторые альманахи, в том числе и выпуски с публикациями произведений А. С. Пушкина («Новости литературы» за 1825 год, «Новоселье» 1833 года), а также первое собрание сочинений А. С. Пушкина, первые номера издававшегося им журнала «Современник». До» вольно полно подобраны сочинения по русской истории (Н. М. Карамзин, С. Н. Глинка), издания древних текстов, подготовленные видными археографами этого времени.
В музее активно комплектуется коллекция марксистской литературы. Значительную ценность представляют издания переводов работ К. Маркса, Ф. Энгельса, сочинения русских марксистов конца XIX - начала XX века. Заметно выросло собрание изданий периода первой русской революции.
Особое место в фондах музея занимают прижизненные издания работ В. И. Ленина. Музей хранит несколько дореволюционных изданий, книги, вышедшие в первые годы Советской власти, первое Собрание сочинений В. И. Ленина (1920 - 1926). Эти книги являются ведущими экспонатами на выставках, посвященных истории Московской области.
Собрание книг 1917 - 1980-х годов численно велико, поскольку оно включает книги, комплектуемые филиалами музея. Собраны коллекции но истории городов Подольска, Клина, Павловского Посада, издания военных лет, обширная мемуарная литература.