В ноябре 1929 г. памятник XVII века с замечательным внутренним убранством – церковь святителя Алексия на Глинищах – передали под зернохранилище. А спустя пять лет снесли, выстроив на его месте жилой дом.
Алексия, митрополита Московского, святителя в Зачатьевском монастыре часовня (2-й Зачатьевский переулок, дом № 2).
Находится при входе в монастырь, под надвратным храмом Спаса Нерукотворного Образа, справа от ворот. Место ее на фасаде храма отмечено иконой святителя Алексия, митрополита Московского. Зачатьевский монастырь был основан святителем Алексием, митрополитом Московским в 1360 г. Его первыми насельницами были родные сестры святителя игуменья Иулиания и монахиня Евпраксия. До закрытия монастыря в 1927 г. и разрушения монастырского собора Рождества Пресвятой Богородицы в нем существовал придел во имя святителя Алексия. Богослужения в монастыре были возобновлены в 1993 г. Часовня во имя святителя Алексия была устроена в 1999 г. Святые врата и своды часовни расписаны художником Александром Царенковым.
Алексия, митрополита Московского, святителя, в Ольгинском приюте церковь (уничтожена).
Детский приют был основан в 1844 г. и с согласия великой княжны Ольги Николаевны, дочери Николая I (впоследствии – королева Вюртембергская), назван Ольгинским. Он находился сначала в Хамовниках, а позже переехал в собственный дом на Преображенской улице. В начале XX века в нем содержалось 70 мальчиков, которые обучались в 1–3 общих классах и в 4-м, где преподавались черчение и рисование. Окончившие курс воспитанники могли поступать в техническое училище, принадлежавшее Совету детских приютов.
В 1910–1911 гг. в ознаменование рождения наследника престола цесаревича Алексея к приютскому зданию с западной стороны пристроили в виде обширной залы церковь святителя Алексия митрополита Московского. Ее освятили 28 сентября 1911 г. В ней находился двухъярусный, художественной работы иконостас. Храм закрыли в 1918 г., а уничтожили вместе со зданием приюта в начале 1930-х гг. На этом месте позднее выстроили семиэтажный дом.
Алексия, митрополита Московского, святителя, при психоневрологическом интернате № 26 церковь (Косинская улица, дом № 8).
Домовый храм святителя Алексия, митрополита Московского освящен 7 октября 1999 г. в приспособленном для этого помещении психоневрологического интерната № 23. Посвящение храма святителю Алексию, митрополиту Московскому было избрано жребием у чудотворного образа Косинской иконы Божией Матери четырехлетним мальчиком Николаем Кузмичевым. Храм приписан к церкви Успения Пресвятой Богородицы в Косине.
Алексия, митрополита Московского, святителя, в Рогожской слободе церковь (Николоямская улица, дом № 60).
Церковь получила название по южному приделу, а ее главный престол освящен во имя Феодоровской иконы Божией Матери, северный придел – во имя святителя Николая. Впервые эта церковь упоминается в 1625 г. В 1701 г. был возведен каменный храм, который сгорел в середине XVIII в. Новый храм был построен по проекту известного зодчего Д.В. Ухтомского в 1748–1751 гг. в редком для Москвы стиле елизаветинского барокко. Роспись стен в 1778–1779 гг. выполнил иконописец Сергей Нехлебаев. В четырехъярусном с вызолоченными деревянными резными статуями иконостасе находилось двадцать восемь икон. Особо почитался прихожанами чудотворный Феодоровский образ Божией Матери в серебряном окладе, богато украшенный жемчугом и бриллиантами. Предание гласило, что перед этим старинным списком начала XVII века с Костромской Феодоровской иконы Богородицы, находившейся еще в старом храме, молился государь Алексей Михайлович со свитой. Исторический интерес представляла также икона святителя Алексия, митрополита Московского, начала XIX века, изображающая его на фоне Московского Кремля. В начале XX века были проведены ремонт храма и реставрация иконостаса и икон по рекомендациям художника А.М. Васнецова и под наблюдением архитектора Ф.Ф. Горностаева. Храм закрыли в 1929 г. и передали под склад чая. Часть изъятых тогда икон ныне хранится в Третьяковской галерее. Ценнейший иконостас разобрали, его Царские врата и колонки ныне хранятся в Московском объединенном музее-заповеднике. В 1991 г. церковь возвращена верующим, в храме ведуться реставрационные работы.