В 1680–1687 гг. в Богоявленском монастыре располагалась школа, которой руководили греки Иоанникий и Софроний Лихуды. Впоследствии она была переведена в Заиконоспасский монастырь и преобразована в Славяно-греко-латинскую академию. 31 мая 2007 г. в память о просветителях у ограды храма установлен памятник братьям Лихудам. В соборе частично сохранилось великолепное убранство, созданное итальянским мастером Д.М. Фонтана и его учениками в начале XVIII в. Это – три рельефа «Коронование Божией Матери», «Рождество» и «Крещение». На протяжении нескольких веков в Казанском храме с массивными столпами и низким потолком хоронили высшую московскую знать. На надгробных плитах можно было прочитать имена бояр и князей Голицыных, Шереметевых, Юсуповых, Салтыковых, Долгоруких. Надгробия собора были выполнены Ж.-А. Гудоном и другими выдающимися скульпторами XVIII в. (после закрытия храма перевезены в Михайловскую церковь Донского монастыря).
В 1920-е гг. монастырь был закрыт, уничтожены колокольня, Афонская часовня и монастырские строения, выходившие на Никольскую улицу. 1929 г. собор закрыли и вывезли из него все церковное убранство. В 1991 г. храм вернули общине верующих. Нижний храм был освящен во имя Казанской иконы Божией Матери с приделом святителя Алексия митрополита Московского, а верхний – во имя Богоявления с приставным престолом священномученика Владимира митрополита Киевского. При храме действуют Московская регентско-певческая семинария, Музыкальный педагогический лицей и воскресная школа.
Богоявления Господня в Дорогомилове церковь (уничтожена).
Первые документальные сведения о Богоявленском храме в Дорогомиловской ямской слободе, с приделом святителя Николая, относятся к 1620-м годам. В 1733 г. выстроили новое церковное здание. В 1835 г. к трапезной пристроили придел в честь иконы Божией Матери «Утоли моя печали». В 1862 г. храм капитально переделали, с северной стороны пристроили придел святителя Тихона Задонского, с южной – преподобного Сергия Радонежского, колокольня выросла на один ярус. В 1898 г. храм частично был разобран, и на его месте к сентябрю 1908 г. выстроили огромную церковь с четырьмя приделами (архитектор В.Е. Сретенский). Храм и его приделы украшали роскошные резные вызолоченные иконостасы оригинального рисунка, сооруженные П.А. Сизовым. В них и на стенах было размещено много икон XVIII века и высокохудожественные образа середины XIX века, исполненные иконописцами Палеха. Прихожанами особо почитался больших размеров Животворящий Крест Господень с изображением распятия, созданный мастером Е. Елкиным в XVII веке.
К середине 1920-х годов, после закрытия Чудова монастыря и передачи обновленцам храма Христа Спасителя, Богоявленская церковь в Дорогомилове стала кафедральным собором.
В начале 1930-х годов в нем был рукоположен в иеродиакона, а затем и в иеромонаха будущий патриарх Пимен (Извеков). Храм был закрыт и снесен во 2-й половине 1930-х годов. На его месте выстроили многоэтажное жилое здание (улица Большая Дорогомиловская, дом № 21). Новым кафедральным собором стала церковь Богоявления Господня в Елохове.
Богоявления Господня в Елохове собор (Спартаковская улица, дом № 15).
Церковь в селе Елох была построена в 1722–1731 гг. на средства царевны Прасковьи Иоанновны, племянницы Петра I. В 1799 г. в этом храме был крещен А.С. Пушкин, о чем свидетельствует обнаруженная во второй половине XIX в. запись в метрической книге. Современное церковное здание на месте более древнего храма возвели в 1835–1845 гг. по проекту архитектора Е.Д. Тюрина. Внутренняя отделка продолжалась еще в течение нескольких лет, и полное освящение храма состоялось в 1853 г. Купол и аттик над трапезной соорудили в 1889 г. (архитектор П.П. Зыков). Огромный классицистический храм, вмещающий несколько тысяч молящихся, имеет кубическую форму и увенчан пятью главами. Колокольня первой половины XIX в. имеет четыре яруса. Главный престол храма – во имя Богоявления Господня; приделы – во имя Благовещения Пресвятой Богородицы (южный) и во имя святителя Николая Чудотворца (северный; создан в 1912 г., стены расписаны известным иконописцем В.П. Гурьяновым). В соборе находится пятиярусный иконостас.