После Октябрьской революции храм не закрывался. К середине 1930-х годов, после уничтожения патриаршего храма Богоявления в Дорогомилове собор стал кафедральным. В нем часто проводил службы местоблюститель патриаршего престола и впоследствии патриарх Сергий (Страгородский). Богоявленский собор с этого времени стал центром церковной жизни Москвы и Советского Союза. Здесь происходили интронизации патриархов, юбилейные церковные торжества. В 1944 г. в Николаевском приделе был погребен патриах Сергий. В 1948 г. по просьбе патриарха Алексия I (Симанского) в собор из кремлевских музеев перенесли мощи святителя Алексия, митрополита Московского. Среди святынь здесь также находятся: чудотворная Казанская икона Божией Матери, чтимые образа Божией Матери «Взыскание погибших» и Тихвинская, чудотворная икона святителя Николая. В 1991 г. на стене около входа установили мемориальную доску с надписью, что здесь был крещен Александр Пушкин. 9 декабря 2008 г. в соборе был похоронен патриарх Алексий II (Ридигер).
Бориса и Глеба, благоверных князей, на Арбатской площади храм-часовня (Арбатская площадь, дом № 4).
Выстроен за три с половиной месяца по инициативе и на средства Фонда единства православных народов. Освящен храм 6 августа 1997 г. Неподалеку от него находился старинный храм Бориса и Глеба, разрушенный в 1930 г. Приписан к храму Вознесения Господня на Никитской («Большое Вознесение»).
Бориса и Глеба, благоверных князей, на Арбатской площади церковь (уничтожена).
Впервые деревянный храм у Арбатских ворот упомянут в летописи под 1493 годом, а в 1527 г. на его месте возвели каменный.
Перед военными походами царь Иван IV Грозный не раз посещал эту церковь и молился в ней. В конце XVII века один из именитых прихожан Борисоглебского храма граф Иван Алексеевич Мусин-Пушкин, занимавший в Монастырском приказе место главного судьи, пристроил к храму придел Воскресения Господня, ставший со временем домовой церковью Мусиных-Пушкиных, где были погребены члены их рода и служил особый священник.
С 1677 г. известен и другой придел – в честь Казанской иконы Божией Матери, где хоронили представителей другого знатного рода – Бестужевых. Возвращенный из ссылки императрицей Екатериной II государственный деятель граф Алексей Петрович Бестужев-Рюмин объявил, что берется за свои деньги построить новое здание Борисоглебской церкви. Однако потомки И.А. Мусина-Пушкина воспротивились уничтожению придела с гробами их предков. Лишь приехавшая в октябре 1763 г. из Петербурга графиня Алевтина Платоновна Мусина-Пушкина дала разрешение на разборку семейной святыни, а гробницы ее предков перенесли в кремлевский Чудов монастырь, где существовали древние захоронения ее рода.
Новую изящную, с огромным куполом Борисоглебскую церковь с Казанским и Воскресенским приделами освятили 6 декабря 1768 г., и перенесли в нее многие древние святыни старого храма. Архитектором нового храма стал К.И. Бланк.
В алтаре храма был помещен портрет храмоздателя – А.П. Бестужева-Рюмина. Опустошительный пожар 1812 г. пощадил новый храм, и к нему приписали пострадавшие от огня близлежащие Филиппо-Апостольскую, Тихоновскую, Иоанно-Милостивскую, Космодамиановскую и Ризположенскую церкви. Некоторые из них вскоре за ветхостью разобрали, а материал употребили на строительство третьего Ризположенского придела и четвертого – равноапостольной Марии Магдалины. В новые приделы Борисоглебской церкви перенесли многие иконы и церковную утварь из упраздненных храмов. В церкви хранились также особо почитаемые богомольцами святыни: большая древняя икона святых Бориса и Глеба с житием XVI века, икона святого Иоанна Милостивого XVI века, образ святого Нила Столбенского с частицами его мощей. Придельные иконостасы были сооружены из позолоченной бронзы. В феврале 1930 г. из церкви вывезли ее имущество, и к концу года церковное здание было снесено.
Бориса и Глеба, благоверных князей, в Верхних Лихоборах часовня (уничтожена).
Была сооружена в 1884 г. и приписана к Борисоглебскому храму в Дегунине. Вскоре после Октябрьской революции 1917 г. часовню закрыли и приспособили под жилье. В 1964 г. часовню окончательно уничтожили, чтобы выстроить на ее месте 12-этажный жилой дом (Дмитровское шоссе, дом № 64, корпус 2).
Бориса и Глеба, благоверных князей, в Дегунине церковь (Дегунинская улица, дом № 18а).
Село Дегунино известно с 1339 г., вероятно, уже тогда здесь существовал храм. В Смутное время деревянная церковь во имя Бориса и Глеба была сожжена. В 1633 г. храм с приделом Иоанна Богослова выстроили на прежнем месте. В 1762 г. его сменил новый, также деревянный храм. Современное церковное здание выстроено к 1866 г. Храм представляет собой массивный параллелепипед с трапезной и колокольней, с приделами святителя Николая и иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость». Церковь закрыли 25 февраля 1941 г. и передали сначала под швейную фабрику, а потом под склад. Богослужения возобновились с 8 октября 1991 г. Ныне храм окружили многоэтажные дома, и от живописной местности, над которой он раньше возвышался, не осталось и следа.