Святые сени — невысокое длинное помещение под сводами — также лишилось первоначальной внутренней отделки. Существующая их роспись выполнена на старые сюжеты в 1847 г. художником Ф. Завьяловым. Сделанный над сенями тайник был рассчитан на то, чтобы дать возможность женской половине царской семьи, которой не полагалось присутствовать на церемониях в Грановитой палате, наблюдать за происходившим.
Дворцом Ивана III, построенным Алевизом Фрязиным, пользовался и следующий московский князь, Василий III, но первому венчанному на царство их преемнику, Ивану IV, старых масштабов становится недостаточно. В 1560 г. возводится по его указу особый двор для царских детей — «на взрубе позади Набережные большие палаты» (на запад от Благовещенского собора) — с церковью Сретения, просуществовавшей до конца XVIII в. Почти одновременно на старом дворцовом здании надстраивается еще один кирпичный этаж, в котором разместится обслуживавшая различные потребности дворцового быта Мастерская палата.
На располагавшейся в непосредственной близости к Успенскому собору так называемой Княгининой половине дворца XV в. для царицы Ирины Годуновой, супруги Федора Иоанновича, возводится Царицына, иначе — малая Золотая палата. Предназначенная, подобно Грановитой палате, для наиболее торжественных дворцовых церемоний, связанных с женской половиной царской семьи, второе свое название она получила, по-видимому, из-за золотого фона стенописи.
Занимавшие стены и своды первоначальные фрески 1580-х гг. представляли сцены из жизни прославившихся своей мудростью или добродетелями цариц прошлого. Так, один из сохранившихся фрагментов представляет победу воинов грузинской царицы Динары над персами.
Опять-таки подобно Грановитой, Золотая палата имела вход через сени, получившие название Жилецкой палаты. Здесь располагались несшие придворную службу дворяне-жильцы. О внешнем виде оказавшейся почти со всех сторон застроенной Золотой палаты сегодня можно судить только по небольшой части восточного ее фасада с белокаменными наличниками и частью карниза. Жилецкая палата также сохранила от XVII в. окна и двери с белокаменными наличниками и порталами.
Опустошения, причиненные дворцовым постройкам во время польско-шведской интервенции, были увеличены пожарами 1613 и 1629 гг. Кремль нуждался в самых широких восстановительных работах. Ради них из Голландии выписывается кирпичный мастер Р. Мартыс, который налаживает большой кирпичный завод у Даниловской слободы. Но первый из Романовых, царь Михаил Федорович, не хочет отказываться от традиционного царского дворца. В 1635—1636 гг. на его основе начинают строиться опять-таки для царских детей «зело пречудные палаты», получившие название Теремов или Теремного дворца. В нем остался в виде подклетов дворец Алевиза. Осталось помещение Мастерской палаты, перестроенное и в центральной своей части послужившее основанием для трех новых жилых этажей, выведенных из кирпича.
Работы эти вели каменных дел подмастерья Бажен Огурцов, один из строителей Спасской башни Трефил Шарутин, в начале 1640-х гг. украсивший Москву новым зданием Печатного двора по лицевой линии Никольской улицы, Антип Константинов и Ларион Ушаков.
Казалось бы, связанные уже существовавшей постройкой, ее формами и параметрами, строители, тем не менее, находят совершенно новое и независимое решение, образ удивительно нарядного, праздничного, словно всегда пронизанного красками щедрого лета жилья. Новые этажи возводятся, отступая от старых стен и образуя открытое гульбище. Этот прием повторяется еще раз с верхним этажом, вокруг которого возникает открытый балкон — Верхний каменный двор. В своем силуэте дворец обретает сходство с пирамидой, но не замкнутой в себе, а открывающейся окружающему пространству широкими лестницами и крыльцами.
Теремной дворец. Лестница и сторожевые львы
В своем стремлении к ощущению праздничности, точнее — к характерному для барокко разнообразию форм и цветов, зодчие украшают оконные проемы белокаменными резными наличниками, парапеты гульбищ и лестниц — многоцветными изразцами. Из майолики выполнены и сложные, полного профиля карнизы. Эту богатую игру светотени подчеркивают использованный в обрамлении окон мотив двойной арки с подвесной гирькой и заключенные в них узорчатые, некогда слюдяные окошки. Точный и тонкий рисунок объемов дворца нарушается только примкнувшей к верхнему этажу с западной стороны так называемой смотрильной башней, которая была сооружена в 1836 г.