В ходе скоротечной «бархатной революции» 1989 г. все. эти планы попытались реализовать в Праге. По приказу последнего шефа СТБ Выкипела агент СТБ в студенческом движении Зифчак спровоцировал студентов на прорыв полицейских кордонов, а сам притворился убитым в толпе, что позволило применить для разгона спецназ «Красных беретов». Но это не спасло режим.
В начале 90-х по стране прошли суды над последними руководителями СТБ и ВБ Выкипелом и Кинцлем, вместе с ними были осуждены Зифчак и офицеры СТБ, наиболее рьяно разгонявшие митинги и применявшие насилие (Бечварж, Шипек, Оудра, Гребенчик и др.). За старые грехи, в основном в ходе событий 1968 г., арестованы бывшие шефы СТБ Чарда, Жлабек, Клима, Бокр, Штроугал. Главный вдохновитель репрессий 1968 г. и тогдашний руководитель СТБ Шлагович повесился в Праге в 1990 г., не дожидаясь ареста. Бывшему разведчику Минаржику припомнили его планы по взрыву на радио «Свободная Европа» и в 90-е привлекли к суду за подготовку теракта. Хотели предать суду и знаменитого главу СТБ начала 80-х Лоренца, но его, ставшего в 1993 г. гражданином независимой Словакии, Праге не отдали. В Братиславе Лоренц консультировал новые словацкие спецслужбы и написал книгу мемуаров об СТБ «Министерство страха? Нецензурйрованные записки генерала Лоренца».
Так была перевернута последняя страница социалистического периода в истории чехословацких спецслужб.
В 1990 г. в Чехословакии была создана новая федеративная республика — ЧСФР во главе с президентом Гавелом, бывшим диссидентом, преследовавшимся СТБ. Ничего удивительного, что на месте СНБ возник ряд новых децентрализованных спецслужб. Это были:
БИС — Служба безопасности и информации (B1S — Bezpecnostni Informacni Sluzba), созданная в 1990 г. и до 1991 г. называвшаяся УОУД (Управление охраны конституции и демократии). БИС занималась контрразведкой и внутренней безопасностью, безопасностью экономики, антитеррором и контролем за политическими партиями;
УЗСИ — Управление разведки и информации (UZS1 — Urad pro Zahranicni Styki a Informace), подчиняющееся МВД и занятое только внешней разведкой;
ВОЗ — Военная разведка (Vojenske Obranne Zpravodajstvi) при Генштабе;
Военная контрразведка при Генштабе.
Все эти четыре спецслужбы после распада ЧСФР остались с 1993 г. в независимой Чехии. Сохранены и спецназы в виде группы А и спецбригады № 4 в армии, а также при БИС создана группа антитеррора УРН во главе с Квашняком.
В период ЧСФР за различные нарушения президент Гавел одного за другим отправлял в отставку руководителей БИС Форманека, Румла, Новотны, Бачински. Румла (кстати, известного в ЧССР диссидента) уволили после ряда неосторожных выступлений, но затем, в независимой Чехии, сделали главой МВД. Сменившего его Новотны президент Гавел уволил после прямого обращения к нему делегации офицеров БИС Башты, Когота и Брета, обвинявших шефа в полном непрофессионализме. Правда, сразу вслед за Новотны в 1991 г. уволили и самих жалобщиков. Следущий глава БИС, Бачински, самовольно опубликовал в прессе списки тайных информаторов СТБ, объяснив, что так ему велела поступить гражданская совесть. Бачински тоже уволили, но и он не пропал, тут же возглавив военную разведку — ВОЗ.
С созданием независимой Чехии скандалы вокруг БИС, УЗСИ и военных разведчиков не утихли. То в БИС арестовывают офицера Валлиса, шантажировавшего служебной информацией бизнесменов и предоставлявшего секретные сведения своему другу — аферисту Коженному. То военные разведчики оказываются причастны к пьяной стрельбе министра обороны Баудыша в служебном самолете. То офицер УЗСИ Вулк теряет в пражской пивной портативный компьютер с секретной информацией по чешской агентурной сети за рубежом и воскрешает в памяти чехов веселые образы времен Швейка. Общий же вывод экспертов не позволяет считать чешские спецслужбы 90-х годов особенно профессиональными, часто они были наводнены случайными людьми. То же касается и руководителей. Глава БИС в независимой Чехии Девяты отправлен в отставку из-за своих неуклюжих высказываний в адрес президента США Клинтона, а его наследник Вултеринь в 1995 г. уволен за коррупцию, что, впрочем, свойственно многим спецслужбам Восточной Европы после краха социализма.