После серии совершенных сетью «Гошем» терактов египтяне сумели вычислить их организаторов и исполнителей. Арестованные агенты «Моссад» Беннет и Марзук скончались от пыток в египетской контрразведке. Была арестована и известный агент-нелегал Ниньо, но ее сумели обменять на арестованных в Израиле арабов, как впоследствии обменяли и нелегала Лотца, внедренного в высшее общество Египта, автора мемуаров «Шпион в шампанском». Главные организаторы акции «Гошем» Фрэнк, Беи Яир, Коген и Дар успели выехать из Египта, все они и в дальнейшем были задействованы в операциях израильтян. Особенно прославлен в Израиле Эли Коген, «еврейский Зорге», как его именовали коллеги. Коген сумел организовать сеть диверсантов в Сирии, в 1965 г. он был раскрыт сирийцами и повешен в Дамаске. Фрэнк продолжал работать против Египта, но во время выполнения задания от «Аман» в ФРГ его перевербовали египетские разведчики, по возвращении в Тель-Авив он разоблачен израильтянами и осужден к длительному заключению. Провал акции «Гошем» стоил должности главе «Аман» Гибли; его сменил талантливый военный разведчик Харкаби.
Операций, подобных египетской и сирийской, проводилось «Моссад» и «Аман» множество. Диверсионной сетью в Ираке руководил Бен Порат, здесь в 1966 г. израильтяне организовали серию взрывов, а позднее для провокации взорвали католический собор в Багдаде. В Йемене работал Мизрахи, арестованный йеменцами, но в отличие от Когена обмененный Израилем на арабских узников. В Иордании — сотрудница «Моссад» Муфти, внедренная в палестинскую ООП. В Египте — другая нелегалка «Моссад», Хармор, агентурный псевдоним «Габай», затем работавшая резидентом в Испании. В Северной Африке — Кимчу (агент «Шарон»), позднее работавший в Центральной Африке против арабов, помогавший в перевороте диктатора Амина в Уганде. В Эфиопии — будущий шеф «Шин-Бет» Ахетув. В Марокко — Гутман и Карош, затем заместитель начальника «Моссад». Все подобные акции 50—60-х годов курировал в «Моссад» четвертый спецотдел тайных дел и ликвидаций «Гидон», возглавляемый Итаном. К ним же привлекался аналогичный «политический отдел» в «Шин-Бет» во главе с Гуриелем, Рабиновичем, Эйтаном, Малчином.
Отдельной страницей истории стала эпопея противостояния ядерным устремлениям арабов. Узнав о работе группы ученых-физиков из Западной Германии на насеровский Египет, шеф «Моссад» Харель приказал начать операцию по срыву этой программы, акция получила название «Каир». На сотрудничавших с Насером немцев начали охоту. Присланной по почте бомбой ранен германский ученый Пильц, затем покушения совершены на Клейнвахтера и Герке, а позднее и на египетского куратора этой программы генерала Азиза. Немецкий физик Крюг был похищен и убит израильтянами. Кончилось дело тем, что запугивавшие в Европе немецких физиков бомбами-посылками моссадовцы Бен Гал и Йоклик были арестованы в Швейцарии местными спецслужбами. Международный скандал и возмущенная нота правительства ФРГ вынудили в 1963 г. нового главу Израиля Леви Эшколя уволить неприкасаемого ранее директора «Моссад» Хареля. Правда, его тут же назначили советником Эшколя по безопасности, а во главе «Моссад» встал бывший руководитель военных разведчиков «Аман» Меир Амит.
С уходом Хареля акции против арабских государств стали тоньше и изощреннее; как правило, израильтяне свое авторство почти всегда отрицали. В 1966 г. завербованный «Моссад» иракский летчик Редфи угнал в Израиль новый истребитель. В 1967 г. израильские диверсанты попали в плен к египтянам при попытке диверсии в порту Александрии. В 1969 г. в ходе операции «Булмус» спецназовцы «Части № 269» захватили египетский Зеленый остров в Суэцком проливе. Вторжения групп спецназа в Египет, Сирию, Иорданию, Ливан происходили регулярно, как, например, при акции «Литани» на территории Ливана в 1978 г., где было убито более десятка палестинцев из ООП. В 1970 г. боевые пловцы «Флотилии № 13» взорвали на острове в Красном море египетскую радиостанцию. В 1985 г. таким же образом уничтожены два ливийских корабля в порту Триполи. Во время массированного вторжения в Ливан, именуемого в Израиле «Операция Мир Галилее», группы спецназа «Кидон», «Шакет», «Ямам», «Эгоз» вели настоящую охоту на палестинских руководителей и лично на председателя ООП Арафата, едва не застреленного израильским снайпером у своего бункера в Бейруте. Не чувствовали себя в безопасности и другие главы арабских государств, покушения готовились и на Насера в Египте, на Каддафи в Ливии, на Асада в Сирии, акция по убийству иракского президента Хуссейна «Прыжок гюрзы» отменена по техническим причинам в последний момент, когда ликвидационная группа «Кидон» уже проникла в Ирак. В том же Ираке в 1981 г. взорвали ядерный центр в Озираке.