Помимо ООП и «Черного сентября» мишенями израильтян стали лидеры «Народного фронта освобождения Палестины» (НФОП), группы «Сайка», «Палестинского сопротивления», исламисты ХАМАС и «Ислами-Джихад», шииты из «Хезболлах» в Ливане. «Моссад» иногда дружил с другими террористами: сионистскими «Лигой защиты евреев» Кахане и «Лигой обороны» Бар-Хаима, курдами КРП и Демократического фронта в Ираке, друзами и маронитами в Ливане. Однако против арабских и исламских лидеров террор велся беспощадный. Ликвидированы лидеры НФОП Боудиа, Абу-Мустафа (преемник ушедшего в 1998 г. в отставку вожака НФОП Хабаша, взорван в своем офисе в Рамаллахе в 2001 г.), Аль-Карми. Группа бойцов НФОП, захватившая израильский самолет в 1976 г., полностью перебита при штурме в аэропорту угандийского города Энтеббе, при этом израильтяне уничтожили и 30 угандийских солдат, в ходе боя погиб и командир спецназа «Части № 239» Йосси Нетаньяху, брат премьер-министра Израиля Беньямина Нетаньяху. Уничтожены лидеры ХАМАС Хайл, Акель, Айяш («Инженер»), Шериф, в 1995 г. от пыток в «Шин-Бет» скончался руководитель ХАМАС Харазиа. В 1995 г. на Мальте выстрелом в голову с проезжавшего мотоцикла убит главарь «Ислами-Джихад» Шкаки.
Особая статья — операции против руководителей шиитской «Хезболлах». Первый лидер «Хезболлах» шейх Обейда захвачен и вывезен в Израиль, в 1992 г. он убит «Шин-Бет» в тюрьме. Затем рейд спецназа по ливанским тылам в ходе операции «Весенняя молодость». В 1992 г. ракетой с вертолета уничтожен новый лидер «Хезболлах» шейх Мусови, при этом погибла и его семья, включая несовершеннолетних детей. Таким же образом убиты шейхи Ясир и Селами, похищен и вывезен в 1995 г. в Израиль шейх Алаик. В 1994 г. из Ливана вывезли лидера «Палестинского сопротивления» Айдерами и пятерых сирийских разведчиков, которых затем обменяли на сбитых над Ливаном израильских летчиков. Группа «Эгоз» постоянно действует вблизи ливанской границы, только за один 1996 г. ею ликвидировано по другую сторону границы десять активистов «Хезболлах», а в 1997 г. возле ливанской Сайды разгромлена база другой шиитской группировки — «Амаль», в бою убито и 11 бойцов «Эгоз».
При антитеррористических операциях по освобождению заложников, подобных рейду в 1976 г. на Энтеббе, израильские спецслужбы и спецназ проявляют несоразмерную жесткость к уже обезоруженным террористам. Примером может служить дело 1984 г., когда при освобождении автобуса с заложниками в израильском Ашкелоне двух уже обезвреженных арабов сотрудники «Шин-Бет» через пять минут застрелили по приказу подъехавшего к месту событий начальника «Шин-Бет» Шалома. Шалом, его заместитель Хазак, глава антитеррористического отдела Радаи и начальник оперативного отдела Малка отправлены в отставку. В начале 2002 г. в Хадере арестованный араб, застреливший шестерых евреев в кафе, убит на месте «Шин-Бет».
В 1969 г. члены группы Яимана похитили французские военные катера из порта во Франции, так как необходимо было вооружать еврейский флот в обход эмбарго. А члены группы Аллона планировали угнать из Швейцарии военный истребитель, но ограничились похищением его чертежей, на базе которых в Израиле создали боевой самолет «Крир». В ЮАР группой «Кидон» застрелены двое местных бизнесменов, продававших оружие палестинцам.
В 50-е годы «Моссад» и «Аман» помогали французским спецслужбам в охоте на алжирцев из союза освобождения ФИО и поддерживали контакты с террористами французской ОАС. Военная разведка Израиля в мае 1956 г. получила информацию о людях, которые совершенно не интересовали Израиль, но нужны были французам. Речь шла о лидерах восставших алжирцев. Среди них был и Ахмед Бен Белла. Сотрудники израильской военной разведки выясняли маршруты передвижений Бен Беллы и его людей, пути доставки оружия алжирским повстанцам.
В Западной Европе «Моссад» готовил крупную операцию по ликвидации международного террориста венесуэльца Карлоса, связанного с палестинцами НФОП и ранившего при покушении израильского посла в Лондоне. Как рассказал бывший сотрудник «Моссад» Островский, проживающий в США, в последний момент «Кидон» потеряла во Франции след террориста. Тот же Островский рассказал, что некоторые фанатики-сионисты внутри «Моссад» в 1991 г. в тайне от своего правительства планировали покушение на президента Буша на конференции в Мадриде, которое собирались списать на палестинцев. План отменили в связи с утечкой информации.