Внутри страны жестоко преследовались исламские противники Насера из числа «Братьев-мусульман», прозападная оппозиция, местные евреи. Многие из них, особенно после провала акции «Гошем» и неудачного покушения на Насера в 1954 г., погибли в застенках допросног о центра «Мукхабарат-Элам», которым руководили Хаким и Аль-Нашер (он же Глейм). Насеровцы не церемонились и с критиками своих действий в верховных сферах государства. Бывший министр иностранных дел Кихиа, примкнувший к оппозиции, тайно похищен контрразведчиками из отеля в Каире и подвергнут пыткам в «Мукхабарат-Элам».
Большая волна арестов в египетской политической элите прошла в 1965 г. после раскрытия израильской шпионской сети Л отца, выдававшего себя за германского коммивояжера. В числе добровольных или невольных информаторов Лотца изобличены и сотрудники тайных служб Салаам, ФавзщСабри. За потерю бдительности Насер снял с постов начальника «Мукхабарат-Элам» Аль-Гахураба и руководителя Военной разведки Османа, также посещавших светские рауты в клубе верховой езды Лотца.
В годы правления Насера установлены связи с зарубежными группами арабских террористов ООП, НФОП, «Сайка». Впоследствии бойцы египетского спецназа «Саака» даже организовывали личную охрану председателя ООП Арафата в террористический период его политической жизни. Военные разведчики и спецназовцы Насера помогали коммунистическим партизанам Йемена и Омана, здесь ими руководил будущий глава Генштаба генерал Шаазлгк Позднее египетские инструкторы будут задействованы при подготовке бойцов исламского сопротивления в Ливане и моджахедов в Афганистане, но эго будет уже после Насера. В 1956 г. представители египетской разведки у палестинских террористов Хафес и Аль-Тлалак были убиты при ответной диверсии. израильтян, приславших им бомбу в почтовой бандероли.
В постнасеровскую эпоху дружба Египта с арабскими террористами резко пошла на убыль, более того, сам Египет несколько раз становился жертвой терроризма. В 1978 г. при неуклюжей попытке египетских военных коммандос и группы «Саака» отбить у палестинцев египетский лайнер на Кипре произошла настоящая бойня, погибли все террористы НФОП, несколько десятков заложников и 15 бойцов группы захвата из «Сааки». Египетский спецназ и в дальнейшем продолжал действовать столь жестоко и непрофессионально, создав себе репутацию самого кровавою спецназа в мире. В 1985 г. очередной египетский самолет был захвачен палестинскими террористами и посажен на Мальте, при этом из четырех вооруженных агентов «Мукхабарат-Элам» на борту лишь один попытался оказать сопротивление угонщикам, но был тяжело ранен. «Саака» ворвалась в салон, забрасывая его гранатами, от взрывов, пуль и начавшегося пожара вместе с террористами поглибли 59 пассажиров, самолет сгорел дотла. «Саака» потерь не понесла, отделавшись ранеными, но этот случай все антитеррористические подразделения мира по сей день изучают как образец бездарно организованного штурма.
Спецслужбы Египта известны жесткими акциями против своих эмигрантов и перебежчиков, выкрадывая их из стран Европы, а для их поимки вторгаясь через границу в Судан. Сбежавший военный летчик Хилми был выслежен египетской разведкой в Аргентине. Красивая египтянка после «случайного» знакомства привела Хилми в некую квартиру, здесь мукхабаратовцы схватили его и силой доставили в посольство Египта, а затем, накачав наркотиком, вывезли в Каир, где Хилми был казнен за измену. В 1974 г. перебежчика Дахана (бывшего израильтянина-предателя Лоука) египетские агенты во главе с резидентом в Италии Аль-Сайядом похитили прямо на улице Рима и попытались пронести на самолет в большом чемодане. Только бдительность итальянской таможни спасла Дахапу— Лоуку жизнь: обнаружившие его итальянцы выдали многократного предателя Израилю, и вместо пули в затылок в Каире он получил тюремный срок в Тель-Авиве.