Третий этап охватывает январь и первую половину февраля 1944 г. В этот период войска Волховского фронта во взаимодействии с Ленинградским фронтом и при поддержке Краснознаменного Балтийского флота и авиации дальнего действия провели крупную наступательную операцию по завершению разгрома немецко-фашистских войск под Ленинградом. Частью этой стратегической операции была Новгородско-Лужская наступательная операция, которую в основном осуществили войска Волховского фронта.
В ходе январского наступления войска Ленинградского и Волховского фронтов нанесли новое тяжелое поражение врагу: блокада Ленинграда была полностью снята и был освобожден Новгород. В результате значительно улучшилась обстановка на всем северо-западном направлении. Наступление советских войск под Ленинградом и Новгородом положило начало проведению целой серии наступательных операций 1944 г. Разгром немецко-фашистских войск южнее Ленинграда оказал огромное влияние на союзника фашистской Германии — Финляндию и в значительной мере содействовал выходу ее из войны.
В целом Волховский фронт, выполняя задачи, возлагаемые Ставкой Верховного Главнокомандования, провел девять фронтовых операций: одну из них оборонительную (Тихвинскую) и восемь наступательных. В течение 856 дней и ночей войска Волховского фронта во взаимодействии с Ленинградским и Северо-Западным фронтами и при поддержке Краснознаменного Балтийского флота и авиации дальнего действия вели наступательные бои с врагом, срывая и упреждая его намерения штурмовать город Ленина — колыбель Великой Октябрьской социалистической революции. Их заслуги неоднократно отмечались в приказах Верховного Главнокомандующего. Войска Волховского фронта проявляли в боях большое упорство, высокое боевое мастерство и массовый героизм. Подвиги многих тысяч солдат, сержантов, офицеров и генералов были отмечены высокими наградами Родины, 36 из них были удостоены высокого звания Героя Советского Союза. За боевые успехи 70 частей и соединений получили почетные наименования.
Волховский фронт имел и неудачи. Самой крупной из них явилось поражение 2-й Ударной армии в ходе Любанской операции, приведшее к большим потерям в людях, вооружении и боевой технике, что явилось прежде всего следствием измены Родине и предательства ее бывшего командующего А. А. Власова. Но это не может бросить тени на честь воинов армии, которые в тяжелейших условиях не пали духом и решительно боролись против гитлеровских захватчиков.
Все боевые действия войск Волховского фронта протекали в тесном взаимодействии с войсками Ленинградского фронта, силами Краснознаменного Балтийского флота, в первую очередь с Ладожской военной флотилией, при поддержке авиации дальнего действия и партизан.
Менялась обстановка и изменялись задачи войск Волховского фронта, происходили изменения и в его составе. Но основной руководящий состав управления фронта на протяжении войны был довольно стабильным. С самого возникновения фронт возглавил генерал армии К. А. Мерецков, членом Военного совета фронта был назначен армейский комиссар 1 ранга А. И. Запорожец, начальником штаба — комбриг Г. Д. Стельмах и политуправления — дивизионный комиссар П. И. Горохов, помощником командующего фронтом — генерал-майор П. И. Ляпин.
24 апреля 1942 г. решением Ставки в интересах объединения всех усилий войск, действовавших под Ленинградом, Волховский фронт был слит с Ленинградским. Некоторое время войска Волховского фронта составляли Волховскую группу Ленинградского фронта, которым в то время командовал генерал-лейтенант М. С. Хозин. В связи с этим генерал армии К. А. Мерецков получил назначение на должность заместителя главнокомандующего войсками Западного стратегического направления. Однако ход событий показал целесообразность восстановления Волховского фронта. 8 июня 1942 г. он был восстановлен и действовал до 15 февраля 1944 г. Командующим войсками фронта был снова назначен генерал армии К. А. Мерецков. На занимаемых ранее должностях остались армейский комиссар 1 ранга А. И. Запорожец и генерал-майор Г. Д. Стельмах. В дальнейшем в командовании фронта произошли некоторые изменения. 8 октября 1942 г. на должность члена Военного совета прибыл корпусной комиссар (с 6 декабря того же года генерал-лейтенант) Л. З. Мехлис, а 17 апреля 1943 г. его сменил генерал-майор (с 24 августа того же года генерал-лейтенант) Т. Ф. Штыков. 5 октября 1942 г. начальником штаба был назначен генерал-лейтенант М. Н. Шарохин, а 26 июня 1943 г. на эту должность прибыл генерал-лейтенант Ф. П. Озеров. С 20 июня 1942 г. начальником политуправления стал бригадный комиссар (с 6 декабря того же года генерал-майор) К. Ф. Калашников.