Военно-воздушные силы приграничных округов, за исключением Одесского военного округа, не были в достаточной степени подготовлены к отражению внезапных налетов авиации противника и к выходу из-под удара. Первые налеты врага на аэродромы приграничной полосы нанесли большой урон нашим летным частям. В результате нечеткой организации выхода самолетов из-под ударов вражеской авиации и отражения ее налетов противнику удалось и повторными ударами по аэродромам нанести нам существенный урон. Авиационные части не имели запасных аэродромов и в течение нескольких дней были вынуждены оставаться на ранее занимаемых ими аэродромах, подвергаясь повторным ударам. В связи с тем что врагу удалось вывести из строя значительное количество наших самолетов, условия выполнения боевых задач, поставленных советским летчикам, были весьма трудными.
Первые дни войны показали, что авиационные полки 4-эскадрильного состава были громоздкими. Полк базировался на 2–3 аэродромах, вследствие чего терялось оперативное руководство подразделениями. Управление самолетами по радио и скрытое управление были недостаточно отработаны. Слабо было организовано взаимодействие авиации с наземными войсками, в результате чего последние не получали своевременной поддержки со стороны авиации. Сигналы, обозначающие свою авиацию и наземные войска, были установлены лишь к концу июня. Первые дни войны показали также, что не все наши летчики в достаточной степени учитывали тактику действий авиации противника.: полеты мелкими группами и одиночными самолетами на малых высотах; стремление истребителей, не вступая в воздушный бой, отвлечь наших истребителей в сторону от прикрываемых ими объектов и тем самым облегчить действия своих бомбардировщиков; широкое использование облачности в целях маскировки полета и др.
Отдельные недостатки были вскрыты и в использовании авиации в системе противовоздушной обороны. В пунктах противовоздушной обороны в некоторых случаях не было необходимого взаимодействия между зенитной артиллерией и истребительной авиацией. Не весь личный состав наземных средств ПВО хорошо знал силуэты самолетов как своих, так и противника. Поэтому хотя и редко, но были случаи, обусловливаемые сложностью обстановки, когда наши зенитные орудия обстреливали и даже сбивали свои самолеты.
Беззаветной стойкостью, мужеством и высоким мастерством в начале войны отличалась боевая деятельность советских моряков. В эти трудные для нашей Родины дни Флот был верным помощником Советской Армии. При наступлении противника на приморских направлениях моряки ставили минные заграждения и содействовали сухопутным войскам в разгроме вражеских группировок противника и срыве его наступления. Содействие Флота сухопутным войскам выражалось в выделении части сил для действий на сухопутном фронте, в артиллерийской поддержке огнем корабельной и береговой артиллерии, а также в ударах морской авиации по наземным целям. Наряду с действиями на суше советские моряки героически отражали атаки вражеских кораблей на море. Особенно ожесточенные бои в первые дни войны развернулись за удержание военно-морских баз на побережье Балтики. Обороняя морские рубежи нашей Родины, советские моряки нанесли большие потери врагу и показали высокие образцы доблестного выполнения поставленных боевых задач.
Большую напряженную работу в начале войны провели и наши тыловые части и учреждения. Органы тыла много делали для того, чтобы обеспечить войска всем необходимым для нужд войны. Но многого в тех небывало сложных условиях обстановки они сделать не могли. Поэтому немало недостатков в действиях советских войск в начале войны обусловливалось нечеткой работой тыловых частей и учреждений. Органы войскового, армейского и фронтового тыла, так же как и вся армия вообще, не были приведены в готовность накануне войны. Не была организована система подвоза и эвакуации. Многие склады боеприпасов, ГСМ и др. находились вблизи государственной границы. Вследствие неудач они были уничтожены и частично оставлены противнику. Подвоз боеприпасов и горючего из глубокого тыла в связи с мобилизацией войск и ударами вражеской авиации по железнодорожным узлам и эшелонам был весьма затруднительным и поэтому осуществлялся не систематически. Управление тыловыми частями нередко нарушалось, вследствие этого они часто блуждали. Фронтовые и армейские тылы не были надлежащим образом организованы. Станции снабжения и отделения головных складов, меняя место, иногда те сообщали об этом войскам. В результате этого командование соединений и частей было вынуждено само отыскивать их. В связи с этим боеприпасы, горючее и продовольствие поступали в войска с большим опозданием. Были случаи, когда танки и орудия бездействовали из-за отсутствия горючего и снарядов. Справедливости ради следует отметить, что и некоторые командиры вспоминали о подвозе снарядов и горючего лишь тогда, когда они уже были израсходованы полностью. Подвоз горючего и боеприпасов в войска осуществлялся с большими перебоями. Служба регулирования на маршрутах, как правило, отсутствовала, вследствие этого в узких местах (дефиле, мосты) создавались пробки, которые, не будучи прикрытыми истребительной авиацией и зенитной артиллерией, являлись заманчивыми объектами для авиации противника. В середине июля 1941 г. тыловые части и учреждения фронтов, армий и соединений стали работать более организованно. Недостатки первых дней войны начали устраняться, и войска более или менее систематически получали, хотя порой и в недостаточных количествах, все крайне необходимое для ведения боевых действий.
Одной из причин неудачных действий советских войск в начале войны являлась частая потеря управления войсками со стороны командующих объединениями и командиров всех степеней. Хотя отважные связисты делали все возможное, на что они только были способны, связи между штабами нередко не было. Из-за частых нарушений связи они не могли своевременно получать информацию о действиях противника, о положении своих частей и соединений и оперативно руководить ими. В связи с быстрыми изменениями обстановки требовалось срочное вмешательство командования, чтобы изменить боевые задачи войскам. А так как связь с ними терялась, то приказы приходили с опозданием, не соответствовали сложившейся обстановке и не могли быть выполнены. Из-за отсутствия связи со штабами армий командующие фронтов были вынуждены в таких случаях ставить задачи корпусам и дивизиям, не зная детально сложившейся обстановки в полосах их действий. Командующие армиями, не зная о полученных соединениями задачах, принимали решения в соответствии с ранее полученной от фронта задачей и сложившейся обстановкой. В результате этого войска иногда получали противоречивые приказы и, пока разбирались в том, какую задачу выполнять, терялось драгоценное время, а обстановка вновь изменялась. Были отдельные случаи, когда из-за потери управления некоторые подразделения, части и даже соединения блуждали на поле боя, не зная, какую задачу выполнять и куда следовать. Нужно заметить, что связь с войсками терялась как по вине высших штабов, так и низших начальников, которые не всегда пытались установить ее с вышестоящим командованием. Особенно показательным в этом отношении примером является отход войск 126-й и 188-й стрелковых дивизий 11-й армии через р. Западная Двина. Из-за Потери связи эти дивизии переправлялись в исключительно тяжелых условиях на лодках, плотах и паромах, несмотря на наличие мостовых переправ, которые находились в 7–8 км от их участка переправы.
Управление войсками терялось как из-за нарушений, так и недостатка средств связи. Постоянные провода вдоль границы, на которые должны были базироваться войска, были разрушены авиацией и вражескими диверсионными группами. Чтобы восполнить этот пробел, части и соединения были вынуждены использовать полевые средства связи. В результате вынужденного отхода войск, который проходил в тяжелых условиях, в первые дни войны было потеряно значительное количество комплектов проводной связи и радиостанций. Основным средством связи с первых дней войны стали радио и подвижные средства связи. Радиосвязь работала хорошо, но штабы иногда неохотно и неумело пользовались ею. К середине июля 1941 г., по мере поступления средств связи из тыла, накопления опыта использования их и приобретения навыков командным составом в управлении войсками, все эти недостатки в значительной степени были изжиты. Было налажено твердое и непрерывное управление войсками, благодаря чему боевые действия стали носить более решительный характер.