К счастью, существовали и другие категории партизан, действовавшие по совершенно иным инструкциям. Кроме “местных”, партизанские отряды формировались прежде всего из перешедших на положение партизан истребительных отрядов, в меньшей степени из окруженных и не сдавшихся бойцов Красной Армии, часто во главе с командирами, из бежавших пленных, из заброшенных в тыл противника разведчиков и диверсантов 4-го управления и территориальных органов НКВД, бойцов ОМСБОН, агентурно-боевых групп (АБГ) погранвойск, оперативных диверсионных пунктов РУ, в марте 1942 года преобразованных в 6-е (диверсионные) отделения разведывательных отделов штабов фронтов. Именно эти отряды, в дальнейшем вобравшие в себя местных жителей и организовавшие их, стали действительной силой партизанского движения. Однако в начальный период и они не могли претендовать на существенный вклад в борьбу с противником, поскольку хотя и исчислялись десятками, но не имели ни баз, ни иной организованной системы снабжения, зачастую были лишены радиосвязи, а их автономность по продовольствию и боеприпасам составляла 2–3 недели. В результате даже такие полупрофессиональные группы оказались достаточно уязвимыми и зачастую быстро уничтожались охранными частями противника.
Первые попытки организовать централизованное руководство партизанским движением относятся к концу 1941 года. По предложению заместителя наркома обороны Н. Н. Воронова был подготовлен проект создания Центрального штаба партизанского движения (ЦШПД), подобран его личный состав, однако на данном этапе в процесс вмешался нарком внутренних дел Берия. Он сфабриковал дело по обвинению будущих работников штаба и репрессировал почти всех из них, после чего вопрос о ЦШПД на время отпал. Тем не менее, весной следующего года насущная необходимость в объединенном органе для координации действий, централизованного снабжения партизан и разработки методического руководства ими стала уже очевидной. ГКО своим постановлением от 30 мая 1942 года № 1837сс распорядился создать при Ставке Верховного Главнокомандования (ВГК) Центральный штаб партизанского движения под руководством П. К. Пономаренко. В нем имелся разведывательный (2-й) отдел, позднее преобразованный в информационно-разведывательный, а впоследствии в управление. К оперативным органам ЦШПД примыкали отдел связи с радиоузлом, отдел диверсионной техники и тактики, секретный и шифровальный отделы. Утвержденное 23 декабря 1942 года Положение о Центральном Штабе партизанского движения устанавливало следующие задачи начальника его разведывательного отдела: