В 1995 г. начался сложный процесс возрождения космодрома, но уже на качественно новом уровне, определенном в первую очередь передачей объектов из военного ведомства администрации города и Федеральному космическому центру «Байконур», руководителем которого является Евгений Моисеевич Кушнир.
Уже передано более 800 объектов, среди которых стартовые и технические комплексы ракет космического назначения «Союз», «Зенит», «Восток», «Циклон», «Энергия». Сейчас космодром поделен на секторы ответственности. Городская инфраструктура, в том числе водо и электроснабжение всего комплекса, находится в руках главы администрации. Часть объектов — технические и стартовые комплексы — по указу Президента переданы Росавиакосмосу. Значительная часть объектов осталась за Министерством обороны. В связи с передачей объектов контингент военнослужащих в несколько раз уменьшился, но объем выполняемых задач остался практически тем же.
Байконур, созданный военными и для военных, понемногу «снимает погоны». Всего осталось 7 тысяч военнослужащих.
1-й ЦИП КС в 1998 г., передав предприятиям Росавиакосмоса стартовые и технические комплексы, продолжает выполнять задачи по подготовке и запуску РКА различного назначения (это делают 240 инженеров-испытателей). Опыт и умение организовать испытания служат надежной гарантией того, что еще долгие годы офицеры центра будут входить в совместный боевой расчет.
2-й ЦИП КС в настоящее время выполняет основной объем всех космических программ, реализуемых с космодрома. Две пусковые установки PH «Протон» принадлежат военным и эксплуатируются ими самостоятельно. Уровень подготовки специалистов позволил в течении последних 6 лет произвести более 60 пусков самой тяжелой ракеты «Протон». Во многом космический престиж России поддерживается благодаря самоотверженному труду офицеров 2 центра.
4-й ЦИП КС, измерительный комплекс — выполняет задачи измерений при подготовке РКИ на технических и стартовых комплексах, а также при осуществлении запусков. В настоящее время альтернативы специалистам центра в структуре Росавиакосмоса нет.
В настоящее время все виды обеспечения запусков возложены на Министерство обороны, т. е. в/ч 11284 полностью отвечает за безопасность запусков (поисковые и аварийно-спасательные работы, метеорологическое и метрологическое обеспечение, связь и др.).
8-е испытательное управление продолжает выполнять задачи, напрямую связанные с обеспечением безопасности России. В 1999 г. личный состав Управления впервые произвел боевой баллистической ракетой запуск международного космического аппарата «УоСАТ-12». Эта программа имеет хорошие перспективы.
Части обеспечения и обслуживания продолжают выполнять свои специфические задачи несмотря на недофинансирование и нерегулярные поставки материально-технических средств.
Таким образом, говорить о том, что военные полностью уходят с космодрома, пока рано. Сегодня и сторонники, и противники демилитаризации признают, что потребуется несколько лет для того, чтобы подготовить специалистов, способных заменить военных инженеров.
Пока основу испытателей предприятий Федерального космического центра «Байконур» составляют офицеры запаса. Но, к сожалению, за ними никого нет. Если раньше молодой лейтенант, проходя ступени служебного роста, мог через 10–15 лет стать специалистом высочайшего класса, то теперь такого контингента в гражданских структурах нет.
Конечно, проводить реформы всегда не просто, а тем более в испытательных работах. Но только военные способны точно и в срок выполнить приказ. В частях космодрома остаются настоящие патриоты Байконура, которые в сложных условиях продолжают беззаветно выполнять свой воинский долг, решая при этом непростые социально-бытовые вопросы. Офицеры космодрома достойны того, чтобы о них рассказывали в любой публикации о Байконуре.
В мае 2001 г. космодром вновь вошел в состав космических сил страны, что должно придать новый импульс в его развитии.