Центркомдезертир состояла из председателя, назначаемого приказом РВСР, представителей Всероглавштаба, Политуправления РВСР и Народного комиссариата внутренних дел РСФСР. К совместной с ней деятельности привлекались представители других учреждений, необходимые по ходу работ комиссии, с правом совещательного голоса. Постановления комиссии выносились простым большинством голосов и публиковывались в установленном порядке. В случаях, затрагивающих компетенцию других ведомств, требовалось предварительное соглашение с последними.
При Центральной комиссии создавалось Управление делами (секретариат), на которое возлагались выработка и представление на утверждение комиссии проекта мероприятий по борьбе с дезертирством; организация ее заседаний; ведение протоколов; проведение в жизнь ее постановлений путем их издания, опубликования и поддержания связи с соответствующими учреждениями. Управление делами (секретариат) должно было сноситься с окружными, столичными, губернскими и уездными комдезертирами196.
Председателем Центркомдезертира был назначен И.Л. Дзевялтовский – польский революционер, участник Октябрьской революции, комиссар Всероглавштаба.
Распоряжением Центркомдезертира в январе 1919 г. учреждались полевые, губернские и уездные комиссии по борьбе с дезертирством.
Полевые комдезертиры должны были создаваться при штабах фронтов, армий и дивизий в составе представителей особых отделов, политотделов и комиссаров штабов. В прифронтовой полосе для борьбы с дезертирством создавались заградительные отряды. Организовывались также пункты принятия жалоб красноармейцев на плохое снабжение продовольствием, обмундированием, недостаточное обеспечение их семей пособием. Полевые комиссии подчинялись реввоенсоветам армий и фронтов и носили временный характер.
Тем же распоряжением учреждались окружные комиссии (окркомдезертиры) при окружных военных комиссариатах в составе председателя – представителя окружного военкомата, представителя культурно-просветительного отдела окружного военкомата, представителя отдела управления губисполкома. Представители утверждались Центркомде-зертиром197. При окркомдезертире находился секретариат, в функции которого входило инструктирование всех низших комиссий с правом наложения на них взысканий за «неправомерные действия»198.
Окружная комиссия должна была распубликовывать по округу распоряжения Центркомдезертира, инспектировать и инструктировать все нижестоящие комдезертиры, с правом наложения на них дисциплинарного взыскания за бездействие или неправильность действий, предоставлять Центркомдезертиру периодические сводки работы по борьбе с дезертирством по губерниям округа199.
Губернские комиссии (губкомдезертиры) должны были создаваться при губернских военкоматах в составе председателя – представителя губернского военкомата, представителя культурно-просветительного отдела губернского военкомата, представителя отдела управления губисполкома. Представители утверждались Окркомдезертиром. Губкомдезертиры издавали постановления и распоряжения.
Губкомдезертиры должны были проводить в жизнь все постановления центральной и окружных комдезертиров, руководить работой уездных и волостных комиссий с правом наложения на них, в особых случаях, дисциплинарных взысканий200. В функции губернских комиссий входили также наблюдение и инструктирование эшелонов при отправке их на фронт. В целях агитации с эшелонами отправлялись коммунисты.
На губкомдезертиры возлагалась непосредственная борьба с дезертирством губернии, проведение в жизнь постановлений и распоряжений Центркомдезертира и Окркомдезертира, руководство работой уездных и волостных комиссий.
Меры, применяемые губкомдезертиром, разделялись на предупредительные и карательные. Предупредительные меры включали в себя развитие и углубление политической сознательности и общего культурного уровня рабоче-крестьянских масс, главным образом красноармейцев, путем пропаганды и агитации о вреде дезертирства и невозможности для дезертиров скрываться, посредством устройства митингов и лекций. Карательные меры включали в себя производство облав в домах, местах скопления и увеселений, в волостях и селах, высылку пикетов для проверки документов, проверку отношения к отбыванию воинской повинности служащих в учреждениях и предприятиях, в подотделах учета и распределения рабочей силы. Карательные меры осуществлялись при содействии местных властей, команд, милиции, войсковых частей ВЧК и других воинских сил.