Затем происходит терминация (окончание) синаптического цикла. При этом большой объём выделенного медиатора выходит за пределы синаптической щели, действует на пресинаптические рецепторы и прекращает дальнейшее выделение медиатора до прихода следующего импульса.
Терминация может быть обратимой, когда медиатор не разрушается, и необратимой, когда требуется его разрушать (и заново синтезировать для следующей синаптической передачи).
Процесс терминации выполняет и вторую задачу — очистку синаптической щели от медиатора и устранение, таким образом, постсинаптического потенциала. Медиатор может быть разрушен в синаптической щели (при необратимой терминации) или поглощён путём обратного захвата пресинаптическим окончанием с помощью специальных белков-насосов. Тогда медиатор будет разрушен в пресинаптическом окончании (при необратимой терминации), либо используется повторно (при обратимой терминации), что более экономно. Но нейротрансмиттер может всасываться и в окружающие синапс глиальные клетки и разрушаться в них (при необратимой терминации).
У одного и того же медиатора могут быть химически разные рецепторы, и взаимодействие с ними вызывает разные эффекты. Электрофизиологически они могут быть противоположны: в одном случае эффектом будет деполяризация, т. е. ВПСП, возбуждение, в другом гиперполяризация, т. е. ТПСП, торможение. Следовательно, важен не только сам медиатор, но и место его воздействия — рецептор.
Тип рецептора определяется по веществу, связывающемуся с этим рецептором, и по эффекту, вызываемому связавшимся веществом. Если вещество вызывает эффект, аналогичный медиатору, т. е. сходный с физиологическим, то оно называется агонистом. Если этот агонистический эффект проявился при непосредственном химическом связывании с рецептором медиатора, то это вещество называется миметиком. У одного рецептора может быть несколько миметиков, и они могут вызывать различающиеся эффекты. Различия связаны с местом приложения вещества, вызывающего эффект, с местом нахождения рецептора.
Если вещество вызывает эффект, противоположный медиатору, если оно уменьшает или устраняет действие агониста, то оно называется антагонистом или литиком, а если антагонистическое действие проявилось при связывании с теми же рецепторами, с которыми связываются агонисты, то это уже будет проявление конкурентного антагониста или блокатора. Блокатор занимает, блокирует место на связывающем локусе рецептора, и агонисту некуда сесть на рецепторе, место занято и проявление специфического эффекта становится невозможным. Антагонист может связаться и с другим участком рецептора, не мешая медиатору связываться с рецептором, но подавляя специфический эффект информона непрямыми, окольными путями. В зависимости от аффинности блокатор может вытеснять информон из рецептора и прекращать эффект, если действие блокатора начинается позже воздействия агониста. Если же в этой ситуации блокатор попадает в организм до миметика, то он, антагонист, предотвращает физиологический эффект информона.
Имеются природные агонисты и антагонисты — плоды эволюции, в ходе которой у одних организмов возникли вещества, защищающие их от других организмов или служащие им оружием (яды змей и пауков). Люди используют эти природные соединения на практике, в частности, в качестве лекарств. Кроме того, на основе знаний о работе рецепторных механизмов химиками синтезированы искусственные вещества и специалистами созданы новые препараты.
Таким образом, эффект информона, действующего на рецептор, зависит не только от него самого, от его химической структуры, но и от места его приложения, от рецептора, на который он действует, от местонахождения этого рецептора. Кроме того, как мы увидим дальше, эффект зависит и от функционального состояния «мишени», на которую действует информон.
Одна и та же нервная клетка может содержать разные нейропередатчики. Такие синаптические посредники, характеризующиеся совместной локализацией, называются сопутствующими, сосуществующими, медиаторами (комедиаторами, котрансмиттерами). Синаптические пузырьки, в которых они депонируются, могут быть разными, но нейрон один. Высвобождаются в синаптическую щель такие сопутствующие медиаторы часто не совместно при одиночном потенциале действия, а в результате разряда пресинаптических импульсов. Нервную клетку, её «ергичность» называют по основному медиатору: холинергический, адренергический, ГАМКергический нейрон.