В январе 1992 г. назначен командующим 14-й гвардейской армией. В июле 1992 г. — командующим армией в Приволжском военном округе.
25 января Молдова объявляет о введении своей национальной валюты — лея. На территории ПМР лей не признается и не имеет хождения.
15 февраля президент Республики Молдова Мирна Снегур издал указ о передаче комплекса зданий и сооружений Главного командования войск Юго-Западного направления Министерству обороны Молдовы. Затем Кишинев представляет в Москву список частей и объектов бывшей Советской армии, которые немедленно должны отойти молдавской стороне. Все это явно указывало на то, что Молдова форсированными темпами стремилась «накачать военные мышцы», имея далеко идущие планы.
1 марта спецслужбы Молдовы совершают убийство начальника отдела милиции города Дубоссары майора И.С. Сипченко. В ответ на эту провокацию казаки Черноморского казачьего войска захватывают здание полиции и арестовывают 27 молдавских полицейских.
2 марта отряд полиции особого назначения Республики Молдова, переодевшись в гражданскую одежду, переходит по льду через водохранилище Дубоссарской ГЭС и захватывает полк гражданской обороны в селе Кочиеры.
В заложниках оказались офицеры полка и их семьи. Полк официально в состав 14-й армии не входил, а подчинялся Вооруженным силам СНГ. Командующий 14-й армией генерал-майор Ю.М. Неткачёв категорически отказался вмешиваться в этот конфликт. Он послал туда разбираться начальника штаба армии генерал-майора В.И. Ситникова, начальника разведки армии полковника С.Ф. Харламова и своего помощника по воспитательной работе полковника A.M. Баранова.
Опоновцы их продержали под обстрелом полтора часа и разговаривать с ними не стали.
Больно и стыдно было наблюдать, как на защиту офицеров полка и их семей выступили не части 14-й армии, а гвардия ПМР во главе с майором В.А. Воронковым. Во время этого боя он и еще три гвардейца погибли (прапорщик Л.А. Толстенко, сержант СВ. Титовский, рядовой СИ. Шинков), 21 человек был ранен. Семьи офицеров и прапорщиков были освобождены и вывезены из военного городка.
3 марта на трассе между населенными пунктами Ташлык и Григориополь ночью обстреляли машину скорой помощи, которая везла из молдавского села Спея в больницу роженицу. Погибла акушерка, получила множественные ранения сама роженица и водитель.
На следующий день И.Н. Смирнов обвинил в случившемся молдавских волонтеров и ввел чрезвычайное положение в Дубоссарском районе.
В 1993 г. выступая по местному независимому телевизионному каналу «АСКЕТ», свидетель случившегося Р. Сабиров, бывший рижский омоновец, сообщил, что машину по «ошибке» расстреляли приднестровские чекисты В. Никитенко и С. Бубнов.
7 марта у штаба 14-й армии в Тирасполе проводится пикет забастовочного женского комитета. Женщины требовали снять с должности командующего Ю.М. Неткачёва за бездействие и перевести армию под юрисдикцию ПМР.
Приднестровские власти не теряли времени даром. Все, что говорилось в штабе 14-й армии на совещаниях, все приходящие шифровки, конфиденциальные беседы и совещания в кабинете командующего моментально становились известны руководству ПМР и Республики Молдова. Неткачёв поставил задачу особому отделу армии найти, откуда происходит утечка информации. И нашли. В штабе армии работала уборщицей незаметная женщина, такая «серая мышка», которая и установила подслушивающие устройства в кабинете командующего армией и зале заседаний Военного совета армии. Но это — был один из «ручейков».
Оставалось еще много офицеров и прапорщиков, которые понимали, что центральная власть их предала в угоду собственных амбиций. А им предстоит жить на этой земле вместе со своими семьями. Поэтому для Ю.М. Неткачёва не являлось секретом то, что большинство военнослужащих симпатизировали ПМР и были готовы ей всячески помогать.
11 марта в Дубоссарах полицейскими Молдовы были захвачены старший помощник прокурора В. Ливоненко и следователь И. Сачинский.
13 марта подполковник В.И. Жерегеля, командир эскадрильи военно-транспортной авиации Вооруженных сил СНГ, вылетел на разведку погоды. В районе сел Моловата и Кочиеры его самолет был обстрелян опоновцами Молдовы. Один двигатель был поврежден, и его самолет еле дотянул до аэродрома в Тирасполе.
В период с 3 по 16 марта Вооруженным силам Молдовы удалось захватить на левом берегу р. Днестр населенные пункты Новая Маловата, Кочиеры, Пырыта и Кошница, а в районах населенных пунктов Роги и Дороцкое два участка дороги Тирасполь — Рыбница. Сообщение по трассе Рыбница — Тирасполь было прервано. Но в результате ответных действий со стороны приднестровцев дорогу удалось отбить.