В ответ 1 сентября 1991 г. был создан женский забастовочный комитет во главе с Галиной Андреевой. Женщины Тирасполя перекрыли железную дорогу на Молдову. Требование было одно — выпустить арестованных депутатов на свободу.
18 сентября в районе села Терновка, возле ресторана «Фоишор», молдавскими полицейскими под командованием заместителя министра внутренних дел Республики Молдова Константина Анточа была предпринята попытка взять в заложники начальника Управления внутренних дел ПМССР Ю.И. Гроссула (бывшего заместителя министра внутренних дел Молдовы и уволенного из органов министром внутренних дел СССР В.В. Бакатиным за несогласие с действиями последнего при передаче вооружения и техники молдавской полиции) с целью в дальнейшем склонить его работать против ПМССР. В ходе инцидента два человека получили ранения (Просул и Чарыев), а Олег Костев был захвачен в плен.
В сентябре 1991 г. планировалось подписание договора между Россией и Республикой Молдова. Верховный Совет России, который должен был ратифицировать договор, направил в Молдову депутата Верховного Совета РСФСР С. А. Кравченко — главного разработчика документа. Условием его подписания должно было стать подтверждение того, что в Молдове не нарушаются права русскоязычного населения.
Молдавские власти устроили в селе Кочиеры встречу с представителями русскоязычного населения. Сюда съехались представители Народного фронта со всей Молдовы. Они заверили С.А. Кравченко, что их никто здесь не притесняет, хотя именно в это время уже сидели в кишиневской тюрьме И.Н. Смирнов и другие депутаты Верховного Совета Молдовы, увольняли людей с работы по национальному признаку. По возвращении в Россию Кравченко заявил, что в Молдове все нормально. Никто никого не притесняет. А недовольство идет от кучки «партократов» и коммунистов из крупных городов: Тирасполя, Дубоссар…
Но не всех убедили слова С.А. Кравченко. В Приднестровье поехал председатель Демократической партии России Н.И. Травкин. Его никто в Молдове не ждал. Он увидел то, что на самом деле происходило и в Приднестровье, и в Молдове.
Невзирая на то что он был депутатом Верховного Совета СССР и РСФСР, то есть лицом, пользующимся депутатской неприкосновенностью, 24 сентября по дороге из Дубоссар в Рыбницу его арестовали представители МВД Молдовы, посадили в самолет и отправили в Москву. Травкин, вернувшись в Москву, выступил на заседании ВС РСФСР с объективным докладом, после чего ратификация договора стала невозможна.
25 сентября совершено второе нападение полиции Молдовы на г. Дубоссары. Снова применено оружие против мирных жителей. Опять были раненые. Молдавский ОМОН, численностью до 400 человек, захватил Дубоссары и Григориополь. Противостояние жителей захваченных городов и вооруженных сил РМ подходит к опасной черте. В Дубоссары на помощь сторонникам ПМССР прибыли добровольцы из других районов республики. Действия Молдовы вызывали резко отрицательную реакцию в России и в мире.
В сентябре 1991 г. по приказу начальника Генерального штаба СССР была вывезена большая часть оружия и боеприпасов из городов Унгены (3–4 колонны по 12–15 машин, под руководством полковника В.Н. Чернобривого), Бельцы и Флорешты (5–6 колонн по 20–25 машин, руководили полковники Г.М. Акифьев, В.В. Попов, В.И. Нефедя, В.Н. Франкин) на территорию Украины (в село Загнидково и город Первомайск соответственно).
В августе — сентябре были вывезены ядерные боеприпасы к ракетным комплексам оперативно-тактических (ОТР) и тактических ракет (ТР), а также к 152-мм орудиям из подвижно-ремонтной технической базы в городе Сарата (Украина) на территорию России.
1 октября результаты рельсовой войны на левом берегу и возмущение общественности в Республике Молдова дали свои результаты. В Молдове были освобождены арестованные депутаты Приднестровья И.Н. Смирнов, В.Л. Боднар и Г.Н. Попов. Из Григориополя и Дубоссар выведены молдавские омоновцы.
14 ноября Республика Молдова объявила своей собственностью военные городки, базы, вооружение, средства передвижения, технику и другое имущество частей Советской армии. Министром обороны назначен генерал Тудор Дабижа.
Объявив о создании национальных вооруженных сил, руководство Молдовы поначалу не спешило форсировать вопрос с «приватизацией» оружия, объектов и частей бывшей Советской армии. Они словно прикидывали, что необходимо им оставить в своем распоряжении, а от чего отказаться. Но такая линия их поведения начала резко меняться в начале 1992 г. 30 декабря 1991 г. представитель Молдовы на минской встрече глав государств СНГ многозначительно подчеркнул, что Кишинев «будет распоряжаться своими вооруженными силами самостоятельно» и не намерен пока связывать себя какими-либо обязательствами перед СНГ. В начале 1992 г. молдавские власти резко ужесточили свои требования на причитающуюся им долю вооружений, техники, боеприпасов, неприкосновенных запасов.