Во все времена женщины с самого раннего возраста воспитываются как будущие матери, уступчивые жены, в то время как мужчинам отводится роль кормильца и защитника. Эти социально-культурные и физиологические предпосылки зачастую вступали в противоречие с необходимостью самозащиты. В этом плане куноити с детства занимались психотренингом, стремясь разработать эффективные приемы защиты женской психики. Способствовало этому и применение традиционной системы самозащиты психики ниндзя — кудзи (кудзи-ин, кудзи-кири).
Все это, вместе с необходимостью поддержания традиционного образа скромной, учтивой женщины, требовало от куноити при выполнении деликатных заданий использования сугубо женской техники борьбы.
В основе тактики ведения куноити поединка без оружия (тай-дзютсу) лежала разница между маленькой, хрупкой девушкой и мощным агрессором. В этом случае акцент делался на применении техники, позволяющей сгладить указанное несоответствие и выглядевшей порой очень грубо. Но это являлось оправданной необходимостью, поскольку только воздействие на болевые точки, жизненно важные органы (глаза, горло и т. п.) давало куноити шанс выжить в жестком противостоянии с воинами-мужчинами.
Действуя в жестких условиях выживания, ниндзя должны были сами уметь лечить себя. Полученные в бою раны часто не позволяли ограничиться методами точечного массажа и восстановительных упражнений йоги. Не было речи и о помощи со стороны. Ниндзя должны были уметь самостоятельно изготавливать лекарства и знать правила их применения.
Тяжелые раны они лечили с помощью средств растительного происхождения, например, корня козьей ножки или мази «Черный коровий горох», изготовленной из навоза. Применялись также повязки с толченым корнем нарцисса. Порезавшись бамбуком, они накладывали на рану пасту из пшеничной муки, замешанной на воде, которая заметно уменьшала боль. Огнестрельные и гноящиеся раны ниндзя лечили кашицей из толченого лука. Кровотечения от порезов останавливали дымом от тлеющих кусков материи. Смесь на основе танина (дубильная кислота) помогала от ран, полученных при ожоге. Забытый ныне метод остановки кровотечения состоял в следующем: порошок из толченых высушенных листьев Пауловнии смешивали с разжеванными чайными листьями и накладывали полученную кашицу на кровоточащие раны.
Жизнь «ночных демонов» была полна опасностей: не обходилось без ранений мечом, стрелами или ножом. Падения при лазании по стенам и скалам сопровождались серьезными переломами, растяжениями и вывихами. При лазании по деревьям от острых шипов и веток неизбежно возникали глубокие царапины на лице и руках. Все эти проблемы ниндзя решали с помощью растения с названием «Филодендрон амурский». Половину растения они превращали в кашицу, а другую часть оставляли в нетронутом виде. После смешивания с уксусом растение целиком накладывали на опухоль, вызванную вывихом, растяжением или порезом. Если рана сильно воспалялась и возникала угроза заражения крови, то тогда использовали кожу одного из видов рыбы, наклеивая ее на инфицированный участок тела. Регулярная смена данного «компресса» способствовала скорейшему выздоровлению.
В медицинском арсенале ниндзя существовал эффективный и простой способ изготовления противоядий. После употребления отравленной пищи нужно было съесть этот же продукт питания еще раз, обуглив его на костре. Современная медицина в своей практике сегодня пользуется похожим методом: укус змеи лечат противоядием, изготовленным из идентичного яда. Состав прививок содержит те же вирусы, действие которых на организм они должны предотвратить.
В некоторых источниках упоминается, что ниндзя, как это ни удивительно, обладали средствами борьбы с раковыми опухолями. Для этого они брали сок многолетнего дерева Вистерия, если на нем имелись толстые шишковидные образования, превращали его в порошок и перемешивали с водой. Полученную настойку употребляли на протяжении длительного времени, вплоть до выздоровления. Другой вариант лечения рака заключался в следующем: нужно было ежедневно принимать три грамма порошка семени рогульника (лат. Тгара), запивая его водой. Если невозможно было достать это растение, то использовали семена водного каштана.
В качестве спиртосодержащей основы для приготовления лекарственных средств использовали соту (неочищенная рисовая водка — сакэ).
Отправляясь на длительное задание, где необходимо было укрываться в безлюдных местах или скрытно перемещаться в тылу противника, ниндзя не имели возможности пополнять запасы пищи у местных жителей или в заранее приготовленных тайниках. Иногда время года (зима, ранняя весна) и характер местности (пустыня, горы) не позволяли надеяться и на подножный корм в виде ягод или семян растений. В этих случаях ниндзя должны были иметь при себе личный запас пищи, соответствующий предполагаемым энергозатратам.