В боях на линии Эманыги участвовали два взвода из «Омакайтсе» уезда Петсеримаа и группы из «Омакайтсе» уезда Вырумаа.
В освобождении Северной Эстонии действовали вместе с немцами и группы «Омакайтсе» из Южной Эстонии. Такие подразделения были образованы из людей каждого уезда. В Отеня[43] была сформирована одна рота, участвовавшая в боевых действиях под наименованием «роты капитана Талпак» до занятия города Таллина. Еще можно отметить взвод в составе 38 человек из «Омакайтсе» Петсеримаа под командой лейтенанта Э. Кумар, взвод в составе 40 человек из «Омакайтсе» Вырумаа под командой подполковника А. Тильгре и взвод в составе 38 человек из «Омакайтсе» Ваогамаа. Последний состоял в распоряжении немцев и участвовал также в освобождении Сааремаа. Взвод из «Омакайтсе» Петсеримаа вошел в состав роты капитана Талпак.
Подразделения из «Омакайтсе» Пярнумаа в южной части Ляэнемаа участвовали в боях до занятия города Хаапсалу. В занятии города Таллина участвовал также взвод Тоотси в составе 22 человек под командой младшего лейтенанта запаса А. Оллино. Рота «Омакайтсе» из южной части Пярнумаа в составе 68 человек под командой лейтенанта Э. Томингас участвовала в боевых действиях до занятия города Нарвы. Части береговой охраны также участвовали в десанте на Сааремаа и одна группа в составе 20 человек под командой одного немецкого офицера совершила налет на остров Рухну, где были арестованы 6 латышских коммунистов, оставленных на острове красной армией.
В освобождении Северной Эстонии участвовали и части из уездных «Омакайтсе» Северной Эстонии, хотя не всюду под названием «Омакайтсе». Здесь нужно отметить добровольческий батальон майора Хане Хирвелаан и части «Полка Харью» под руководством полковника Э. Лейтхаммель.
Наконец, нужно отметить, что 11 человек под командой младшего сержанта Реэпалу из 2 батальона «Омакайтсе» Харьюмаа 5 декабря участвовали вместе с немецкими войсками в занятии острова Осмусааре.
Кроме прямых боевых действий и наряду с ними действовали члены «Омакайтсе» при немецких частях в качестве путеводителей и разведчиков. Во многих местах «лесные братья», явившись из тыла Красной Армии через фронт, давали хорошие разведывательные данные. Многие члены «Омакайтсе» ходили через фронт в тыл Красной Армии на разведку.
Не имеется полных сводок о боевой деятельности частей «Омакайтсе». По существующим данным, было более 100 боев, в которых участвовали подразделения от взвода до батальона. При этом «Омакайтсе» имела потери в виде 61 убитых, 8 умерших от ран, 55 раненых и 6 без вести пропавших. Из потерь неприятеля установлено 1482 убитых, 19 раненых и 209 пленных. Трофеи были обильны, но были переданы немецким частям и поэтому не зарегистрированы.
«Омакайтсе», как организация самозащиты народа, нашла сразу полное признание со стороны немецких военных и полицейских властей. Возникло отношение взаимного доверия, что способствовало содействию при достижении общих целей.
Немецкими военными властями организации «Омакайтсе» была поручена чистка ближнего и отдаленного тыла от остатков Красной Армии, собирание и охрана брошенной материальной части, интернирование коммунистических деятелей, конвоирование и охрана военнопленных, военная охрана шоссейных и железных дорог и несение караульной службы при разных объектах военного значения и при общественных предприятиях. К перечисленным задачам добавились береговая охрана на взморье и закрытие границы на бывшей восточной границе Эстонии.
Самостоятельно и вместе с немецкими военными и полицейскими частями «Омакайтсе» арестовало и передало всего 4919 коммунистических деятелей.
Для ликвидации остатков Красной Армии, скрывающихся людей из истребительных батальонов и милиции, «Омакайтсе» провела по территории всего 5033 облавы, причем, количество участников было очень разное, доходя от десятков до сотен. Длительность облав была также разная. Некоторые облавы длились без перерыва по нескольку дней. Больше всего предпринимали облав в уезде Тартумаа — 1917, за ним следует уезд Вирумаа — 345 и уезд Вырумаа — 398. Разбирая по месяцам, на первом месте был август с 1557 облавами. Затем следует сентябрь с 1360 и октябрь с 707 облавами. Проведение облав оказалось очень необходимым, так как в лесах скрывалось много красноармейцев, которые терроризировали местных жителей. Посредством облав задержали 14 парашютистов, 5632 партизан и 20989 красноармейцев. Всего 26635 человек, действовавших в интересах Красной Армии. При сопротивлении на облавах было убито 2657 и ранено 54 красноармейцев, людей из истребительных батальонов или милиции. Потери «Омакайтсе» при этом были: 84 убитых, 3 умерших от ран и 102 раненых.