Восставшие протестанты в Чехии избрали свое правительство и установили связи с союзниками в Австрии, Венгрии, а также с вождем Евангелической унии Фридрихом Пфальцским. Одновременно ими велись переговоры с лантагом Моравии о восстановлении государственного единства и образовании вместе с Силезией и Лужицами конфедерации по образцу нидерландских Соединенных провинций. Заявив об отказе признать права эрцгерцога Фердинанда на чешскую корону, сейм в августе 1619 г. избрал королем Фридриха Пфальцского. При его содействии и материальной помощи Венеции и Савойи в Германии был завербован и отправлен в Чехию двухтысячный отряд наемников. Другие протестантские князья заняли выжидательную позицию. В конце ноября 1619 г. чешские повстанцы и их союзник князь Трансильвании Габор Бетлен с большим войском соединились под Веной, начав ее осаду. В этот трудный для австрийских Габсбургов момент венгерский магнат Другет Гомонаи во главе отрядов польской шляхты ударил Бетлену в тыл и трансильванцам пришлось срочно снять осаду и отступить. Позже Бетлен, стремясь воспользоваться затруднениями Австрии для восстановления независимого венгерского государства, еще несколько раз предпринимал походы в Моравию. Восстание в Чехии и Моравии привело к временному примирению внутренних разногласий в католическом лагере. Максимилиан Баварский согласился принять участие в подавлении восстания, за что новый император Фердинанд II (1619–1637) обещал ему владения Фридриха Пфальцского и его курфюршеский сан, а также право оккупировать Верхнюю Австрию, пока Бавария не получит возмещения военных издержек. За обещание получить Силезию и Лужицы на сторону Габсбургского дома перешел протестантский курфюрст Саксонии. Папа удвоил финансовые дотации имперской казне, раскошелились Тоскана и Генуя. Испания прислала Фердинанду II семь тысяч неаполитанских солдат. Содействие императору обещал король Речи Посполитой Сигизмунд III. В такой ситуации Евангелическая уния отступилась от своего предводителя и от чехов – в июле 1620 г. его члены подписали с Католической лигой соглашение о ненападении.
8 ноября 1620 г. армия Лиги под командованием И. Тилли вместе с имперскими войсками в битве у Белой горы, недалеко от Праги, разбила значительно уступавшее им чешское войско. Католические войска заняли Чехию, Моравию, Силезию и Лужицы. Чешское королевство лишилось политической независимости, на ее землях начался конфессиональный террор. Фридрих Пфальцский, злосчастный чешский «король одной зимы», бежал в Бранденбург. Он был подвергнут императорской опале, а его звание курфюрста передано Максимилиану Баварскому. Армия Тилли вступила в Северную Германию. Немецкие католические государи принялись сводить старые счеты с протестантами, сталкиваясь лишь с разрозненным сопротивлением. К тому же еще в сентябре 1620 г. под предлогом восстановления власти императора в Нижнем Пфальце на Рейн явился главнокомандующий испанской армии А. Спинола с 25-тысячной армией. Оставив часть своих войск в Рейнском Пфальце, Спинола двинулся к нидерландской границе. Здесь вскоре возобновились военные действия между Испанией и Соединенными Провинциями. Заключив союз с последними, войну на морях с Испанией начала Англия (1625–1630).
В антигабсбургскую коалицию вошла и Дания. Появление войск Лиги в Северной Германии, в непосредственной близости от Балтики, представляло для ее интересов непосредственную угрозу. Серьезные опасения вызывала и судьба находившихся на юге Ютландского полуострова Шлезвига и Гольштейна, которые были связаны личной унией с датской короной, но входили в состав Священной Римской империи в качестве ленника императора. В то же время датский король Кристиан IV (1588–1648) хотел приумножить свои северогерманские владения. При помощи англо-голландских денежных субсидий Кристиан набрал армию и весной 1625 г. направил ее против Тилли в междуречье Эльбы и Везера. К датчанам присоединились нижнесаксонские княжества.
Для борьбы с новыми противниками Фердинанду II требовались крупные военные силы и большие финансовые средства. Рассчитывать лишь на войска Католической лиги император не мог – Максимилиан Баварский, которому они подчинялись, все больше склонялся к проведению самостоятельной политики. В такой ситуации Фердинанд принял предложение богатейшего моравского магната Альбрехта Валленштейна – новый союзник был объявлен генералиссимусом императорских войск, а армию сформировал за собственный счет. Валленштейн проявил себя как талантливый организатор и выдающийся полководец. За короткий срок он собрал 30-тысячную армию наемников (позже она выросла до 100 тыс.), которую держал в суровой дисциплине, уделяя большое внимание профессиональному воинскому обучению. В армию набирали солдат любой национальности, но большинство офицеров были убежденными протестантами. Свои затраты Валленштейн быстро и многократно перекрыл за счет налагаемой огромной контрибуции и налогов с территорий, которые занимали его войска, не считаясь при этом с местными правителями. Армия Валленштейна вместе с армией Тилли нанесла ряд сокрушительных поражений датчанам и их немецким союзникам, заняла Померанию, Макленбург и вторглась в Ютландию. Валленштейн стал хозяином в Северной Германии. Кристиан IV бежал из Копенгагена и вынужден был просить мира, который и был заключен в 1629 г. в Любеке на весьма мягких для Кристиана условиях: ничего не утратив территориально, Дания обязывалась впредь не вмешиваться в германские дела.