Через некоторое время Нифон вместе с Иоасафом тайно ушли из Ватопедского монастыря и, никем не узнанные, пришли в монастырь Дионисиат, в котором, как говорят, ктитором был установлен следующий обычай. Желающий стать монахом в обители должен был поработать погонщиком мулов, или носить дрова, или исполнять другие послушания столько времени, сколько назначит настоятель. Только тогда его принимали в монастырь и постригали. Если же желающий уже был монахом, то его сразу записывали в число братии. Итак, никем не узнанный Нифон пришел в монастырь под видом бедного монаха. Когда настоятель спросил, согласен ли он исполнять все послушания, Нифон положил поклон и согласился. Как раз в это время, пока он еще оставался неузнанным, в монастырь пришли посланцы из Великой Церкви Христовой, которые искали Нифона, чтобы снова возвести его на Вселенский Престол по указу султана. Не найдя его, они ушли.
Однажды святого Нифона назначили быть на наблюдательном пункте на высокой горе напротив монастыря, ибо в то время на Святую Гору внезапно нападали пираты, обращали многих в рабство и похищали все, что могли. Посреди ночи, когда святой стоял на молитве на этом наблюдательном пункте, некоторые добродетельные монахи, бдевшие ночью, увидели столп огня, восходивший от земли на небо. Один же из братий, несший послушание вместе со святым, проснувшись, увидел, что святой был весь в огне. Испугавшись, он прибежал в монастырь и рассказал о своем страшном видении первым старцам обители. То же самое рассказали и другие монахи. Тогда, собравшись в церкви, они стали молиться Святому Богу, чтобы Он открыл им, кто же этот человек, которого сопровождают такие знамения. И услышал Господь их моление, открыв тайну следующим образом. Игумен монастыря увидел во сне, что он стоит посреди храма и видит божественного Иоанна Предтечу, который сказал:«Собери всю братию, и выходите встречать патриарха Нифона. Достаточно и того смирения, которое он показал, став погонщиком мулов, иначе потеряете великого иерея». Проснувшись, игумен оцепенел в изумлении. Придя в себя через некоторое время, он стал стучать в било и, созвав всех братьев, поведал им о сне, который видел. Только тогда они узнали, что бедный монах был патриархом Нифоном. Когда же блаженный, погоняя мулов, вечером возвращался в монастырь, ему навстречу вышли все братья со свечами и фимиамом, и встретили его с большой торжественностью. Как только дивный Нифон увидел эту процессию, он бросился на землю и стал обливать ее слезами. Сотворив поклон, игумен облобызал его святые руки и сказал:«Хватит, о вселенский светильниче, испытывать твое терпение, хватит переносить крайние мучения, которые ты терпишь по своей воле. Достаточно того смирения, которое ты уже показал, а мы, убогие, и не подозревали о том». И все братья плакали, а особенно те, кто по неведению опечалили его; они припадали к его священным ногам и просили прощения.
Тогда со многими слезами святой сказал:«Отцы и братья мои, для того Господь скрыл меня в этом душеспасительном месте, как я просил Его, чтобы избавиться мне от забот мирских, и получить милость на Страшном Суде, ибо если мы не отречемся от родителей, родных и любой человеческой славы и привязанностей мира сего, как Сам Он нам заповедует, то будем недостойны следовать за Ним. Если мы приобретем весь мир, а душе нашей повредим, какая от этого польза?«Тем же, кто просил прощения, он сказал:«О чада мои и братья! Те, которые подвизаются в добродетели, должны иметь кротость и любовь к ближнему, не гневаться на них, если и тысячу зол от них потерпят, ибо все мы люди, и никто из нас не чист». Наставив их так, чтобы они не делали зло другим, но без гнева и ропота исполняли каждый свое послушание, посильно помогая друг другу, он благословил их и облобызал.
Затем святой вернулся в монастырь и невозможно описать, какие подвиги и труды понес блаженный. Хотя Нифон был уже стар и крайне утомлен опасностями и ссылками, он служил обители во всех нуждах, как один из последних монахов. С его помощью в обители было возведено множество построек, он посещал больных, утешал скорбящих и много раз, когда я (иеромонах Гавриил) приходил к нему ради его душеполезных поучений, видел, как он копался в саду, помогал на мельнице, спускался к монастырской пристани, когда приходили корабли, и трудился вместе с прочими послушниками, чтобы они не роптали и не потеряли награды от своих трудов. Но ненавистник добра диавол не переставал воевать на святого, ибо и в монастыре находил некоторых монахов, которые, по его наущению, поднимались против Нифона, осуждали и оскорбляли его, называя лицемером и болтуном. Промыслом Божиим ему были открыты козни сатаны и он просил Бога укрепить его, чтобы вынести все искушения, а обидчиков простить и спасти, по Его человеколюбию. В таком смирении, терпении, тесноте и вольной нищете подвизался присноблаженный, нисколько не обращая внимания на свой архиерейский сан и на то, что был Вселенским Патриархом, но всю эту человеческую славу считал несущественной.