Кампания вышла неудачная, а королевскую семейку в Англии не праздновали. Естественно, общественное мнение сделало козлом отпущения Фридриха-Августа. Даже песенка появилась весьма обидного содержания. Тем не менее, 3 апреля 1795 года герцог Йоркский становится Главнокомандующим британскими сухопутными силами.
Герцог, конечно, полководцем был не ахти каким, что доказала кампания 1799 года, когда всё в той же Голландии сорокапятитысячное войско под его началом потерпело жестокое поражение от двадцати тысяч французов, но его таланты, как выяснилось, лежали в иных областях. Герцог Йоркский был одарённым администратором.
Корень всех бед крылся в плачевном состоянии английской армии. Наблюдатели союзников отмечают безобразное поведение офицеров, их пьянство и небрежение обязанностями. Устаревшие уставы, кавардак в снабжении, практически полное отсутствие медицинской помощи, старомодная униформа крайне низкого качества, удивительно ли, что дисциплина и нижних чинов оставляла желать лучшего?
Войска нуждались в переменах, и с 1795 года по 1803 герцог Йоркский при поддержке премьер-министра Пита провёл в армии реформу, которую сэр Джон Фортескью называл самой значимой реформой в истории английских вооружённых сил.
Задача перед герцогом Йоркским стояла сложнейшая, но и он сдаваться не привык.
Были пересмотрены уставы и руководства. Поведение офицеров и унтер-офицеров стало строго регламентироваться. Медицинская служба подверглась изменениям (не пошедшим, впрочем, ей на пользу), а замшелый Корпус Интендантов и Возчиков был преобразован в соответствии с требованиями девятнадцатого, а не восемнадцатого века. Отдельного внимания герцога удостоилась униформа. Он основал также военносиротское заведение в Челси и военное училище в Сандхерсте. Именно Фридрих-Август в 1803 году создал специальное управление военных знаний, которое должно было, наряду с изучением опыта прошлых войн и составлением карт, заниматься также изучением иностранных армий, в том числе и на основе информации, получаемой от специальных агентов за рубежом. Управление постепенно превратилось в разведывательный департамент военного ведомства.
Надо заметить, что мечта о военных лаврах никогда не оставляла герцога Йоркского. После первых успехов Веллингтона в 1808 году Фридрих-Август начал домогаться поста командующего контингентом в Португалии и Испании. Может, ему, в конце концов, что-то и обломилось бы, хотя его «успехи» в Голландии были ещё свежи в памяти, но тут, весьма некстати, разоткровенничалась его бывшая любовница. С мадам Кларк, сменившей в его постели законную супругу, герцог полюбовно расстался в середине 1808 года. Спустя семь месяцев денежное содержание, обещанное брошенной метрессе, иссякло, а, когда госпожа Кларк обратилась к герцогу за объяснениями, тот пригрозил ей позорным столбом и тюрьмой. С кем-то другим номер, может, и прошёл бы, но мадам Кларк была тётенька хваткая. Она выложила всё, что ей было известно о грязных делишках герцога, члену Палаты Общин полковнику Уордлу. 27 января 1809 года полковник на заседании парламента выступил с предложением «назначить комиссию для расследования деятельности главнокомандующего относительно производства в чины и перемещений в армии». Поднялась шумиха, да какая! Мелкое озорство герцога, вроде махинаций на скачках или неуплаты карточных долгов, обычно затмевалось скандальными выходками его старшего брата, но теперь принц Уэльский был прочно забыт. У всех на устах был Фридрих-Август. Выяснилось, что с его благословения госпожа Кларк открыто торговала офицерскими патентами по сниженным ценам. Так, майорский чин вместо положенных 2600 ф.ст. она продавала за 900, капитанский – за 700 вместо 1500. В Сити существовала целая контора по продаже званий по «демпинговым» ценам, причём её служащие не считали нужным скрывать, что являются поверенными могущественной фаворитки. Были преданы огласке случаи, когда Главнокомандующий переводил офицеров на половинный оклад, принуждая совершить сделку с его любовницей; когда мальчики, не окончившие школу, получали звания лейтенантов; полковыми лекарями становились господа, далёкие от медицины, впрочем, их предполагаемым пациентам это ничем не грозило, ибо новоиспечённых докторов на месте службы ни разу не видели. Сладкая парочка не ограничивалась военными должностями, за умеренную плату желающие могли раздобыть себе сан епископа или настоятеля. 20 марта 1809 года герцог был вынужден подать в отставку с поста Главнокомандующего в обмен на прекращение расследования его шалостей в военном ведомстве.