В ходе строительства р. Неглинная была переведена в ров, расположенный приблизительно там, где ныне решетка Александровского сада, а ее русло засыпано землей, после чего там были возведены бастионы, которые были снесены лишь в 1819 - 1823 гг.
В конце XVII в., в 1696 - 1697 гг., в селе Преображенском на р. Яузе возник новый большой Хамовный двор. Производство приняло широкий размах, причем был введен ряд важнейших новшеств, среди которых отметим применение впервые в текстильной промышленности водной энергии, для чего на Яузе была построена плотина 80 сажень в длину и 8 сажень в ширину. Берега Яузы в это время быстро заселялись и застраивались, образуя новый промышленный район. В 1690 г. здесь строится пильная мельница, в 1701 г. - кожевенный двор, в 1705 - 1707 гг. - бумажная мельница в селе Богородском. На Воробьевых горах строится зеркальный завод, использовавший местную белую глину, а у Андреевского монастыря - кирпичные заводы.
Чтобы усилить роль Москвы как торгово-промышленного центра, Петр I предполагал соединить Москву-реку с Волгой. План сооружения канала Москва - Волга относится к последним годам царствования Петра I (1721 - 1722 гг.). Было предложено три варианта.
Первый: от Москвы-реки вверх по Яузе до впадения Лихоборки, затем по Лихоборке к Коровьему Врагу, откуда прокоп в 8 верст до Клязьмы, затем по Клязьме до с. Воскресенского, где предполагался прокоп на протяжении 1,5 версты до речки Каменки. Далее вниз по Каменке до Волгуши, по Волгуше до Яхромы п вниз по Яхроме до Дмитрова. Проект предусматривал 123 шлюза на протяжении 128 верст.
Второй: от Москвы-реки до Истры, по Истре до р. Катыш, вверх по Катышу до ручья Подоры. Дальше прокоп длиной в 3,5 версты до р. Сестры и по Сестре до Рогачевской пристани - 123 шлюза на протяжении 228 верст.
Третий: от Москвы-реки вверх по Яузе до с. Мытищи, из Яузы через Работный буерак надлежало прокопать 8 верст до р. Клязьмы, затем по Клязьме до р. Учи, где снова прокоп в 8 верст, далее по Уче в р. Вязь, по Вязи в р. Дубровку, от Дубровки через Быковское болото прокоп в 3 версты до р. Икши, далее вниз по Икше - в р. Яхрому и по Яхроме до Дмитрова - 41 шлюз на протяжении 103 верст.
Первый и третий варианты близки к современной трассе канала. Современный канал им. Москвы короче и имеет всего 7 шлюзов. Тогдашний уровень техники не позволял производить большие земляные работы, и поэтому авторы проектов выбирали наиболее оптимальные варианты с наименьшими затратами на земляные работы. В дальнейшем к мысли о постройке канала возвращались неоднократно. В 1844 г. был даже построен участок канала между Истрой и Сестрой, но далее дело не пошло.
Начало XIX в. было для истории Москвы, как и России в целом, тяжелым временем - война с Наполеоном. При восстановлении Москвы после пожара 1812 г. улицы местами выравнивались, были упорядочены бульвары, площади по Садовому кольцу, пруды и речки. Однако Москва сохраняла прежние черты феодальной столицы - неровные улицы, извилистые коленчатые переулки, одичавшие уединенные сады, пруды. С начала 30-х до 40-х годов XIX в. Москва значительно обстроилась. Промышленные предприятия восстановились.
Быстрое развитие капитализма в России после отмены крепостного права вызвало крупные изменения в социальном облике городов. Москва во второй половине XIX в. превратилась в один из важнейших индустриальных центров страны и приобрела типичные черты крупного капиталистического города. Характерной особенностью Москвы в пореформенное время является сравнительно быстрая застройка ее коренной территории в пределах Камер-Коллежского вала и заметное расширение фактической границы города за счет прилегающих к нему окраин.
Еще в 60-х годах XIX в. застроенные участки занимали меньше трети города, и больше половины территории Москвы составляли сады, пруды и реки. Московские пустыри, существовавшие с времен пожара 1812 г., быстро застраивались многоэтажными домами.
Вид Каменного моста и его окрестностей с деревянного мостика, что у наугольной башни. 1796 г.
Ж. Делабарт. Офорт
Уже в 1882 г. пустыри занимали только 8% земли в пределах Камер-Коллежского вала, а площадь под садами и бульварами сократилась до 16%.
Развитие фабрично-заводской промышленности в капиталистической Москве сопровождалось перемещением промышленных предприятий из центра на окраины города. Возникли рабочие кварталы за Преображенской заставой - с. Черкизово, за Семеновской заставой - у Хапиловского пруда, Измайловская мануфактура, Даниловская мануфактура, кирпичные заводы за Калужской заставой, на Воробьевых горах, фабрики на Потылихе и др.
На расширение территории Москвы оказало некоторое влияние развитие подмосковных дачных поселков. В конце 80-х годов XIX в. под Москвой насчитывалось свыше 100 дачных поселков: Петровский парк, Петровское-Разумовское, Останкино, Сокольники и т. д.