И вот в 1806 году, когда браку Жозефины исполняется десять лет, приходит беда. Неверность Наполеона — это не секрет, и более или менее скрываемые шалости не влекут за собой последствий. Но в 1806 году император заводит роман с Элеонорой Денюэль де ла Плень, подругой своей сестры Каролины, которая рожает сына, графа Леона; новость получила огласку, и последствия ее были тяжелые: стало ясно, что пара бездетна не по вине императора. Наполеон воюет с австрийцами и русскими, а Жозеф тем временем подливает масла в огонь: комментарии, которые он пишет брату, весьма опасны для его невестки. Ненависть к императрице расползается, у нее много противников, среди которых Фуше, ярый сторонник развода; транжирство императрицы, ее постоянные долги, заказы туалетов, наносящие вред бюджету, становятся предметом строгих замечаний со стороны мужа. Но война сейчас важнее развода или выговоров.
Жозефина же страстно желает присоединиться к мужу и сопровождать его в походах; в 1805 году она ждет возвращения его величества в Страсбурге, потом устраивается в Майнце, как можно ближе к месту военных действий. До нее доходит очень мало новостей, лишь несколько коротких записок, и она вновь мучается неизвестностью; в 1806 году он приглашает ее присоединиться к нему в Берлине, потом просит подождать: «Не тревожься». Война — удобная отговорка: пребывание императора в Варшаве затягивается, хотя боевые действия стихают. Поступает завуалированный приказ: «Меня очень трогает твоя нежность, но нужно подчиниться обстоятельствам. Из Майнца до Варшавы очень длинный путь». Она настаивает, и тогда он отвечает грубее: «Возвращайся в Париж и проводи зиму там. Живи в Тюильри, устраивай приемы и делай все, что привыкла делать, когда я рядом. Это приказ». Вернуть Жозефину в Париж теперь, после битв при Йене и Эйлау, означает также успокоить парижан, которые волнуются в связи с затянувшимися военными кампаниями и людскими потерями. За легким тоном писем первых месяцев 1807 года сквозит приказ: «Ты должна успокоиться», «Люби меня и будь мужественной», «Запрещаю тебе плакать… Будь веселой и никогда не сомневайся в моей дружбе», «Я люблю тебя и хочу знать, что ты весела и довольна».
Пока Жозефина проводит благотворительные балы и обделывает мелкие финансовые операции, Наполеон в Варшаве влюбляется в изысканную Марию Валевскую; это не мимолетное увлечение, а искренняя привязанность. С возвращением Наполеона в Париж приключение не заканчивается, хорошенькая полька умеет быть желанной. Они вновь встретятся в Шенбрунне в 1809 году.
1807 год, год подписания Тильзитского мира, — это апогей императорской власти. Осталось победить лишь Англию. Тем не менее в наиболее информированных кругах зреют сомнения — так ли прочна гигантская империя. Несмотря на победные реляции и гимны, в 1808 году чувствуется тревога. В парижских салонах и министерствах все чаще встает вопрос о наследнике, и слухи о разводе набирают обороты. Семья Бонапарт не ослабляет давления; Мюрат, как и многие, убежден в необходимости подготовить будущее, потому что империя может закончиться вместе с уходом императора. Что касается Фуше, то он берет на себя ужасную миссию убедить императрицу в необходимости принести себя в жертву; несчастная слушает его и протестует, не зная, что это — распоряжение хозяина или же политическая инициатива министра полиции…
Что на самом деле на душе и в голове Наполеона? Он в нерешительности. Он больше не выносит жалоб Жозефины и прислушивается к аргументам Фуше. Хотя он нередко относится к женщинам с недоверием и презрением, сердце у него не каменное; в первый момент он даже прослезился. В 1806 году, отправляясь в армию и прощаясь с Жозефиной, Наполеон так расчувствовался, что у него едва не случился нервный срыв, началась рвота и спазмы желудка; по словам мадам де Ремюза, его усадили и напоили апельсиновой водой. В своей манере Наполеон, это «колоссальное я», как называл его Шатобриан, которого ранит любое сопротивление, по старой памяти продолжает любить свою жену, и у нее достаточно средств, чтобы поддерживать в нем это чувство; летом 1808 года она больна, и Наполеон проводит время у ее изголовья, в том числе по ночам. Этот мужчина, столь сильный на поле боя, удивляется собственным реакциям. Когда наступает время объяснений, у него начинается нервный срыв и приступ тошноты; в течение всей ночи он мечется и горюет. Растрогавшись, он целует ее: «Бедняжка Жозефина, я никогда не смогу тебя покинуть!» Под воздействием эмоций он снова заключает ее в объятия, хочет, чтобы она легла рядом с ним; по словам Жозефины, «он залил постель слезами». Она остается женщиной, которую он любил, и в то же время он не может забыть ее кокетства и чересчур свободного поведения. Часом позже он уже ее избегает, тон его разговоров почти сух.