В юго-восточном районе страны, в провинции Юннань, в ее меж-горных долинах, хорошо освоенных под земледелие и густонаселенных, и далее на восток в провинциях Гуандун, Цзянси, Фуцзянь и Чжэцзян в зоне субтропического климата распространено более 10 видов и подвидов крыс, обитающих в диких условиях и ведущих синантропный образ жизни. Там же обитают полевки рода Microtus, полевки рода Eothenomys, а также представители белок, бурундуков и летяг.
Поданным разных авторов, обобщенных М.П. Козловым и Г.В. Султановым, зараженными чумой в естественных условиях в провинции Юннань были обнаружены следующие виды грызунов: желтогрудая крыса R. flavipectus (3,0 % из 26 тыс. исследованных); полевая крыса R. losea (4,6 % из 86), оба вида являются наиболее многочисленными из заселяющих природные биотопы этого региона; серая крыса R. norvegicus (8,3 % из 24); андерсонова крыса R. andersoni (2,5 % из 195); полевая мышь A. agrarius (2,0 % из 48); древесная белка Collosciurum crythoeus (3,7 % из 29); землеройка-бурозубка Crocidura sp. (0,9 % из 209); домовая мышь М. bactrianus (0,4 % из 1737); землеройка-многозубка S. murinus (0,3 % из 262 исследованных); в единичных экземплярах полевки рода Eothenomys и мышь-малютка М. minutus. На всех этих видах грызунов паразитируют в условиях южных районов Китая блохи X. cheopis, составляя в среднем в общих сборах 21,0 %. Кроме того, для полевых и синантропных грызунов общим является еще один вид блох Ceralophyllus (Nosopsylla) nicanus. Зараженными чумой в естественных условиях были найдены блохи X. cheopis и L. segnis.
В провинции Гуандун, граничащей на востоке с провинцией Юннань, известно распространение в дикой природе R. rysomis, R. sinesis, R. pniinosus, Dremomys rufigensmelli, D. r. pyrchomorus (южные земляные белки), летяг, ряда видов крыс, обитающих в соседних районах провинции Юннань, а в портовых городах: R. rattus и R. norvegicus.
В провинции Фуцзянь на возделываемых полях, целинных участках многочисленных холмов и между ними обитают преимущественно R. losea, М. bactrianus, S. murinus, а в населенных пунктах и городах синантропные крысы R. rattus и R. alexandrinus. На них паразитируют X. cheopis и С. nicanus, составляя в сборах соответственно до 37,8 и 3,8 %.
В провинции Чжэцзян распространение получили R. rattus, R. norvegicus, М. bactrianus, R. confacianus, A. agrarius, D. pemyi, C. erythacus и другие виды, общие для провинций Южного Китая. И в этой провинции на грызунах, как в полевых условиях, так и в населенных пунктах, паразитируют блохи X. cheopis.
М.П. Козлов и Г.В. Султанов указывают на то, что для юго-восточных районов Китая, в которых природная очаговость чумы поддерживается в популяциях диких крыс, во время эпидемических проявлений основной формой была бубонная чума. Поэтому, несмотря на столь внушительные цифры случаев заболеваний чумой каждый год, все они складываются из спорадических случаев заболеваний и отдельных небольших вспышек чумы в многочисленных небольших деревнях, разбросанных по холмам между рисовыми полями. Заражение чумой людей в этом энзо-отичном районе осуществляется крысиными блохами. Человек как источник распространения возбудителя чумы не играет в очагах сколько-нибудь заметной роли, основным источником являются синантропные крысы. Чума на юго-востоке Китая регистрировалась до 1952 г.
Низкие индексы блох X. cheopis продолжительное время на юге Китая являются главным препятствием для распространения чумы и активных и продолжительных эпизоотий во вторичных очагах чумы.
В 1990-х заболеваемость чумой в Китае оставалась низкой, но вспышки чумы не прекращались. Максимум заболеваемости (98 больных чумой) пришелся на 1996 г. Из общего количества заболевших 88 приходятся на 9 округов провинции Юннань. В Синьцзянском автономном регионе зарегистрировано 7 случаев легочной формы болезни. Замечено, что в этом же году, количество активных очагов чумы было большим, чем в предшествующие 40 лет. Вспышки чумных эпизоотий обнаружены в следующих провинциях: Gansu, Qinghai, Xinjiang, Xizang, Юннань и Внутренняя Монголия. На их территориях выявлено 18 новых природных очагов чумы.
В 1997 г. основное количество заболевших бубонной чумой зарегистрировано в провинциях Юннань и Qinghai; о легочных формах болезни не заявлено. Вспышки чумных эпизоотий продолжались в 58 районах провинций Gansu, Qinghai, Xinjiang, Xizang, Sichuan, Юннань и Внутренняя Монголия. В семи районах провинций Внутренняя Монголия, Юннань, Xizang, Sichuan обнаружены новые природные очаги чумы. О вспышках чумы в 1998–1999 гг. не заявлено.