В 70-х годах XVIII века и вплоть до 1826 года масонство было популярным среди офицеров и генералов армии и флота Российской империи. В 1774 году была открыта военная ложа "Марс" в частях русской армии, которые находились в Яссах в Молдавии (в ходе русско-турецкой войны), а вскоре и военная ложа "Минерва" в Сагодурах (Молдавия). В масонских ложах состояли офицеры гвардии, армии и флота, вплоть до фельдмаршала Н. Репнина и адмиралов: С. Грейга, Н. Мордвинова, А. Шишкова, П. Пустошкина (возможно, и Ф. Ушакова).
Полковник Михаил Илларионович Голенищев-Кутузов (будущий главком русской армии и победитель армии Наполеона) был приобщен к таинствам Ордена масонов в 1779 году в Регенсбурге, в ложе "К Трем Ключам". Он вошел также в ложи Франкфурта и Берлина, получив орденское имя — "Зеленеющий лавр". Как и Суворов, Кутузов всю жизнь, был необыкновенно предан ордену и масонской идеи.
Среди православных верующих бытует легенда об отлучении масонов от православной церкви. Но масонство подвергалось религиозным гонениям только в католических странах. В 1738 году Булла Римского Папы объявила масонство "ересью". До 50-х годов XX века католичество активно боролось против масонства, обличая его во всех грехах. Положение изменилось после Второго Ватиканского Собора (1958–1965 гг.). С 1983 года пребывание в масонстве не ведет к отлучению от католической церкви. Сейчас страсти поутихли, однако католицизм сохраняет опасения относительно масонов. В то же время масонские лидеры заявляли о поддержке "нового курса" Папы Иоанна Павла II.
Враждебна масонам была и немецкая Лютеранская церковь, несмотря на масонство некоторых отцов-основателей церкви (другие направления протестантизма весьма либерально относятся к масонству и не порицают участие в масонских ложах своих верующих). О. Соловьев считает, что масонство наиболее близко к англиканству…
В то же время Русская Православная Церковь официально никогда не проклинала и публично не обличала масонов. Русское масонство в конце XVIII века защищало православную веру от нападок антиклерикальных организаций, вольтерьянцев и материалистического обскурантизма. Масонская мораль оказала благотворное влияние на российское общество, выступая против модных тогда течений атеистической скептической мысли (в дальнейшем и против марксизма).
Историк Павел Милюков назвал масонство "толстовством" XVIII века. В Российской империи оно стало первой идеалистической философией, распространившейся в широких общественных кругах и подтолкнувшей процесс формирования общественного мнения и слоя интеллигенции.
Необходимо отметить, что подавляющее большинство русских масонов были людьми истинно верующими и православными (Суворов, Кутузов, Воронцов…). Русское масонство знало о скептицизме французского масонства в отношении католической церкви, но не поддерживало сходную точку зрения в отношении православия.
В 1785 году Митрополит Московский Платон испытал в вере идеолога масонства Николая Новикова и признал его "хорошим христианином", митрополит ответил, что он "молит Бога, чтобы во всем мире христиане были таковы как Новиков". Адепты масонства молились "на всяком месте и при всяком деле" не исключая и "моления с Христианскою братиею своею во Храмах, которое много может споспешествовать к созиданию благочестия". Один из главных философов-масонов начала XIX века Семен Иванович Гамалея жил аскетом, поучая Священному Писанию и проповедуя христианские истины. В русском масонском "Катехизисе" XVIII века (приведенном Сенатором Российской империи И. В. Лопухиным) пишется, что главная цель масонства "…тоже, что и цель истинного Христианства" и "последование Иисусу Христу". Масоны уделяли особое внимание вопросам соотношения масонского понимания религии с официальной православной церковью. Ложи пропагандировали так называемое экуменическое "истинное христианство" — христианский гностицизм, но считали его "дополнением" к христианству традиционному.
По мнению Михаила Сперанского, "истинный христианин представляет собой человека, который, пройдя путь очищения и обновления, ищет соединения с Христом и восприяет его в себя так, чтоб Он в нем жил, действовал, располагал и управлял его мыслями, движением, волею, — словом, чтоб Христос был в нем и он во Христе". Масоны создали в Петербурге "Дом призрения для малолетних сирот", собирали средства на оплату обучения и воспитания детей неимущих дворян и талантливых разночинцев. Масон Квавдистрия жертвовал большие сбережения на строительство православных церквей.