Однако японские войска продолжали оставаться на территории Монголии, военное руководство Японии планировало новые наступательные операции. Таким образом, очаг конфликта в районе Халхин-Гола сохранялся.
8 июля японская сторона вновь начала активные боевые действия, начав наступление на восточном берегу Халхин-Гола, но 11 июля в результате контратаки советских танков и пехоты, японские войска были отброшены на исходные позиции.
23 июля японцы после артиллерийской подготовки вновь начали наступление на правобережный плацдарм советско-монгольских войск. Однако после двухдневных боев, понеся значительные потери, им пришлось отойти на исходные позиции.
Наступление советско-монгольских войск, начавшееся 20 августа, оказалось полной неожиданностью для японского командования. Бронетанковые и механизированные войска Южной и Северной групп советско-монгольских войск к исходу 26 августа соединились, завершив полное окружение 6-й армии противника. После чего началось ее дробление отсекающими ударами и уничтожение по частям. Попытки японского командования провести контратаки и деблокировать окруженную группировку закончились неудачей. К утру 31 августа территория Монгольской Народной Республики была полностью очищена от японских войск.
4 и 8 сентября японские войска предприняли новые попытки проникновения на территорию Монголии, однако они сильными контрударами были отброшены за линию государственной границы.
15 сентября 1939 г. было подписано соглашение между Советским Союзом, МНР и Японией о прекращении военных действий в районе реки Халхин-Гол, которое вступило в силу на следующий день.
Поражение на реке Халхин-Гол не позволило японцам осуществить на практике создание в конце 30-х годов буферного государства на Советском Дальнем Востоке. Оно несколько охладило воинственный пыл японских милитаристов, и вынудили их проводить более осторожную политику по отношению к СССР. Однако это не означало окончательного отказа Японии от своих планов. Штаб Квантунской армии просил Генеральный штаб увеличения в Маньчжурии японских войск путем введения воинской повинности для местного населения и ввода новых частей с островной Японии. Особое внимание обращалось на авиацию, танковые и артиллерийские части, улучшение технического оснащения дислоцирующихся в Маньчжурии соединений.
24 марта 1941 г. состоялась встреча Сталина с министром иностранных дел Японии Мацуоко, который объяснил причины, по которым он просил принять его. Сообщил, что собирается посетить Германию и Италию. После своего возвращения из поездки хочет еще раз посетить Москву с целью улучшения японо-советских отношений.
Сталин ответил, что желание Мацуока остановиться на обратном пути в Москве будет приветствоваться. Улучшение отношений между СССР и Японией вполне возможно, и если новая встреча необходима, то он готов встретиться еще раз.
Мацуока рассказал, что, в Японии верховная власть находится в руках императора (Тенно). Однако, это не совсем верно, ибо в Японии уже давно коммунизм. Мацуока, назвал его моральным коммунизмом. Англосаксонские традиции нанесли ущерб Японии, а промышленной переворот затормозил развитие морального коммунизма. Однако сейчас, продолжал Мацуоко, создалась группа лиц, правда, незначительная, которая стремится распространить свои принципы на все великое азиатское пространство, и которая называет принцип своей политики японским словом Хаккоицю, что в переводе означает всемирный мир, основанный на справедливости. Мацуока заявил, что если Сталин понимает, что он хочет сказать, и если у советской стороны будет соответствующее понимание и желание идти вместе, то Япония готова идти рука об руку с Советской Россией.
Касаясь японо-китайской войны, Мацуока отметил, что Япония ведет войну не с китайским народом, а с англосаксами, т. е. с Англией и Америкой. Япония ведет войну с капитализмом и индивидуализмом, а Чан Кай-Ши является слугой англосаксонских капиталистов. Поэтому японокитайский конфликт нужно рассматривать под этим углом зрения. В связи со сказанным, Мацуока просил учесть намерения Японии в Китае.
В ответ Сталин сказал, что какова бы ни была идеология в Японии или даже в СССР, это не может помешать практическому сближению двух государств, если имеется взаимное желание обеих сторон[137].
12 апреля того же года состоялась вторая встреча Сталина с министром иностранных дел Японии Мацуоко, в ходе которой он заявил, что за время своего пребывания в СССР хотел заключить пакт о нейтралитете, но без всяких условий в порядке дипломатического блицкрига. Он считал, подписание пакта о нейтралитете будет полезным и целесообразным не только для Японии, но и для СССР. Однако констатировал, что его желание не увенчалось успехом. Он уезжает с сожалением, что пакт не подписан. Мацуока напомнил, что он пригласил Молотова посетить Японию. Личные визиты, а также ответные визиты могут способствовать сближению двух стран, и это могло бы иметь положительный результат для японо-советских отношений.