После генерала отъ артиллеріи Капцевича были последовательно генералъ-губернаторами Западной Сибири и командирами Отдельнаго сибирскаго корпуса: генералъ-лейтенантъ Вельяминовъ, генералъ-лейтенантъ Сулима и генералъ отъ инФантеріи князь Горчаковъ. Въ 1851 году начальникъ І3-й пехотной дивизіи, генералъ-лейтенантъ Густавъ Христіановичъ Гасфордъ, назначень исправляющпмъ должность генералъ-губернатора Западной Сибири и командующимъ Отдѣльнымъ сибирскимъ корпусомъ, въ 1853 году, утвержденъ въ этихъ должностяхъ, съ производствомъ въ генералы отъ инфантеріи; а 13 января 1861 года, назначенъ генералъ-губернаторомъ Западной Сибири и командиромъ Отдѣльнаго сибирскаго корпуса, сенаторъ, генералъ-лейтенантъ Александръ Осиповичъ Дюгамель. Въ Восточной же Сибири по учрежденію 1822 года, были постепенно: первымъ генералъ-губернаторомъ Восточной Сибири – тайный совѣтникъ Ловинскій. Въ 1834 году, но соединении власти гражданской съ властью военной – генералъ-лейтенантъ Сулима, съ назначеніемъ и Командующимъ войсками, въ Восточной Сибири расположенными. Въ 1836 году – генералъ лейтенантъ Броневскій. Въ 1838 году – генералъ-лейтенантъ Руппертъ. Съ 1847 году – генералъадъютантъ, генералъ отъ инФантеріи, граФъ Николай Николаевичъ Муравьевъ Амурскій; а съ 19 февраля 1861 года, назначенъ исправляющимъ должность генералъ-губернатора Восточной Сибири и Командующаго войсками въ оной расположенными, бывшій дотоле помощникомъ графа Муравьева, свиты Его величества генералъ-майоръ Михаилъ Семеновичъ Корсаковъ.
Какъ же развивалась, рядомъ съ гражданскимъ и воинскимъ устройствомъ, сибирская Церковь? Завоеватель Ермакъ, въ походъ свой въ Сибирь (1580 – 1581), имѣлъ при своей дружинѣ подвижную часовню. Изъ часовни его хранился въ Тобольской архіерейской ризницѣобразъ св. Николая Чудотворца, съ серебрянымъ позолочениемъ вѣнцомъ. Эта историческая святыня увезена въ 1826 году, архіепископомъ Тобольскимъ и Сибирскимъ Евгеніемъ, въ Москву и поднесена имъ императору Николаю Павловичу. За казаками Ермака пришли въ Сибирь стрѣльцы Московские. Ими съ мечемъ въ рукѣ внесенъ и крестъ. Съ завоеваніемъ шла шагъ за шагомъ и евангельская проповедь. Первыми церквами въ Сибири были Тюменскія: – Рождество – Богородицы – летняя и св, Николая, съ придѣломъ Ѳеодора Стратилата, – зимняя, обѣ деревянныя и воздвигнутыя въ 1586 году. Въ 1587 г., при основаніи Тобольска, построена и въ немъ первая церковь св. Троицы, на мысѣ Алтынъ-Аргинакъ. Въ 1595 г. воевода князь Петръ Горчаковъ воздвигаетъ первыя церкви въ Пелымскомъ краѣ: въ Табарахъ и Пелыме, обѣ во имя Рождества Богородицы. Въ 1600 г. построена въ Обдорскѣ первая церковь во имя св. Василія. Въ 1601 г. въ Туринскѣ (Епанчинѣ городкѣ) – первая церковь св. мучениковъ Бориса в Глеба.. Въ 1602 году, въ Кодскомъ городе (Кондійскѣ на Оби) – первая церковь, во имя св. Савватія и Зосимы, Соловецкихъ Чудотворцевъ. Въ 1605 г. – въ Березовѣ, первая церковь, во имя Воскресенія Христова. Въ 1608 г. въ городкѣ Мангазеѣ (уже въ Туруханскомъ краѣ, нынешней Енисейской губерніи) – первая церковь, во имя св. Николая Чудотворца. Такъ, въ 22 года проникло уже далеко духовное просвѣщеніе вглубь Сибири. Вмѣстѣ съ построеніемъ первыхъ церквей основываются всюду и первые монастыри, эти проводники цивилизаціи и молитвы. За дружинами царя земнаго идутъ дружины Царя небеснаго, водружая крестъ, сооружая святыя обители, научая дикія племена исламическія и языческія не только догматамъ Веры Христовой, но и труду сельскому, разчищая леса, вспахивая нови, распространяя просвѣщеніе и гражданственность. Уже въ 1601 году, т. е. спустя лишь 20 летъ по завоеваніп Сибири, основывается въ Тобольске, у стараго устья реки Тобола, мужескій монастырь, во имя св. Савватія и Зосимы Соловецкихъ Чудотворцевъ; въ 1604 г., – въ Туринске Покровскій мужескій же; а въ 1661 г. въ Тюмени – Преображенскій тоже мужескій, пришедшимъ изъ Казани монахомъ Нифонтомъ. По устройству, это ныпѣ лучшая обитель въ Западной Сибири.
Такимъ образомъ, до учрежденія архіерейской каѳедры для Сибирскаго края, – сѣмена Вѣры и гражданственности быстро развивались по этимъ необозримымъ пустынямъ, отъ предгорій Урала даже до Енисея. Благочестіе древнихъ царей Руси не замедлило этимъ учрежденіемъ. Едва лишь смуты между царствія минули и Домъ Романовыхъ восшелъ на престолъ Русскій, – 8 сентября 1621 года уже хиротонисанъ въ Московскомъ Успенскомъ соборѣ, святѣйшимъ патріархомъ Филаретомъ Никитичемъ (родителемъ царя Михаила), первый архіепіскопъ Тобольскій и Сибирскій Кипріанъ, изъ архимандритовъ древняго Хутынскаго монастыря, близь Новгорода, гдѣ ньнѣ почилъ великій «пѣвецъ Бога» Державинъ. Еще до этого хиротонисанія перваго архіерея сибирскаго, цари, съ Ѳеодора Іоанновича, уже присылали новосозидаемыхъ церквамъ далекой Сибири книги, ризы, иконы и утварь церковную. Даже въ 1593 году, лишь 12 лѣтъ послѣ завоеванія Сибири, явился въ Сибирь «вѣчный ссыльный», знаменитый набатный колоколъ угличскій, возвѣстившій народу убіеніе последней отрасли Дома Рюрикова, св. царевича Димитрія, Угличскаго Чудотворца (15 мая 1591 года). Этотъ колоколъ заслужилъ «опалу», т. е. опалень былъ гнѣвомъ самодержца, «битъ кнутомъ, съ усѣченіемъ уха» по народному преданію. Святитель Кипріанъ, а послѣ него четыре архіепископа: Макарій (1625 г.), Нектарій (1636 г.), Герасимъ (1640 г.) и Симеонъ (1651 г.) – постепенно распространили христіанство до Байкала и Лены. 25 мая 1668 года – шестой архіепископъ Корнилій, хиротонисанный въ 1664 г., возведенъ на степень митрополита Тобольскаго и Сибирскаго. Ему даны при томъ бѣлый клобукъ, трикиріи для осѣненія и саксосъ съ омофоромъ и предоставлено право носить митру съ крестомъ на верху. Право это осталось у преосвященныхъ Тобольскихъ до настоящего времени. Вмѣстѣ съ тѣмъ Сибирская митрополія въ іерархическомъ отношеніи получила четвертое место послѣ Новгородской, Казанской и Астраханской. Въ 1707 году учрежденъ викаріятъ сибирской митрополіи въ Иркутскѣ, гдѣ первымъ епископомъ Иркутскимъ былъ преосвященный Варлаамъ. Съ учрежденіемъ 25 января 1721 года Святейшаго Правительствующего Синода, значеніе митрополитовъ (какъ это было при патріаршествѣ) во многомъ изменилось; а въ 1769 году, но смерти Сибирскаго митрополита Павла II, былъ уже назначенъ въ Тобольскъ только епископъ (Варлаамъ). Ныне Тобольскіе архіереи именуются архіепископами или епископами Тобольскими и Сибирскими, смотря потому, въ какомъ сане пріезжаютъ въ Тобольскъ. Такъ нынешній епископъ Ѳеогностъ не имѣетъ еще архіепископскаго сана и именуется епископомъ Тобольскимъ и Сибирскимъ. Въ іерархическомъ порядке епархій – Тобольская занимаетъ ныне седьмое мѣето после митрополій Новгородской, Кіевской, Московской и Санктпетербургской, архіепископствъ Казанскаго и Астраханскаго и состоитъ во второмъ классе. Но учрежденіемъ Тобольской архіерейской каФедры и ея Иркутскаго викаріата не ограничилось поступательное движеніе православія вследъ за поступательнымъ движеніемъ войска и народа. Въ 1843 году открыта Томская епархія, заключающая въ себе ныне губерніи Томскую и Енисейскую, и первымъ епископомъ ея былъ преосвященный АФанасій, ныне архіепископъ Казанскій и Свіяжскій. Въ 1848 году – епархія Камчатская, въ 1858 году – викаріатъ Якутскій, а въ 1859 году – викаріатъ Новоархангельскій. Обители шли тоже рука объ руку съ просвещающе-духовнымъ движеніемъ впередъ. Въ 1658 году основанъ Троицкій Енисейскій мужескій монастырь. Въ 1679 г. – знаменитый Вознесенскій Иркутскій (где почіютъ мощи св. Иннокентія, епископа и Чудотворца Иркутскаго). Въ 1690 Якутскій мужескій-же, котораго первый архимандритъ Илларіонъ Ламайскій былъ и первымъ начальникомъ Пекинской духовной миссіи въ 1715 году. Въ 1721 Троицкій Посольскій, за Байкаломъ, на крутомъ берегу моря, близъ посольской пристани и на мѣстѣ, где въ 1681 г. убиты русскіе послы Заболоцкій съ товарищами Монголами, при слѣдованіи ихъ въ Китай. Въ 1738 г. – Троицкій Кабанскій, близь Верхнеудинска. Въ 1740 г. – Нерчинскій, гдѣ долго находился въ заточеніи митрополитъ Ростовскій Арсеній, краснорѣчивый витія второй половины XVIII столѣтія, а наконецъ въ 1834 году – Чикойскій Свято-Духовскій, основанный духовнымъ другомъ и утѣшителемъ нашимъ, нынѣ почившимъ схимо-отшельникомъ игуменомъ Варлаамомъ, въ дикихъ и живописныхъ ущельяхъ горъ Чикойскихъ.