В природном отношении Наро-Фоминский район разделяют на три физико-географические зоны — Можайскую, Наро-Исменскую и Деснинскую. Можайская, как следует из названия — это район западнее и севернее Вереи, он покрыт суглинками с мощностью пласта до двух метров; рельеф холмистый, волнистый, реже — слабоволнистый или плоский; почвы дерново-подзолистые; леса — еловые и мелколиственные; эрозия, заболачиваемость почв — эти экзогенные процессы характерны для Можайской зоны.
Наро-Исменская зона представляет из себя район западнее и восточнее Наро-Фоминска с холмисто-волнистым рельефом местности, с отложениями в виде покровных суглинков мощностью до трех метров; реже встречаются водно-ледниковые суглинки и пески; почвы дерново-подзолистые, реже — болотные; леса — еловые и мелколиственные. Экзоген также характерен заболачиваемостью почв и эрозией. Суглинки Деснинского физико-географического района мало отличаются от почв двух названных зон. В Деснинской зоне леса значительно лучше. Среди мелколиственных пород и березы чаще встретишь дубовые, сосновые и еловые рощи. В целом лесами занято больше 50 процентов территории района. По данным за 1992 год рекреакционная нагрузка на почвы колеблется от 33 до 41 процента. Между тем как в Можайской зоне в тот год вносилось лишь до восьми с половиной тонн органики на гектар, в Деснинской — до 15,4. Содержание гумуса в 20-сантиметровом слое почвы составляет в среднем 2,3 процента.
Техногенное загрязнение атмосферы по суммарным выбросам пыли и газов в 1992 году равнялось: 25–50 тонн в сутки по Наро-Фоминску, 50-100 тонн по Апрелевке.
Учитывая, что расположенные в этих двух городах предприятия практически остались без настоящего дела, а автотранспортные потоки возросли в несколько раз, спустя десяток лет воздух в дачном Наро-Фоминском районе чище не стал.
Количество сточных вод по Наро-Фоминску в пределах 12–25 тысяч кубометров сутки, по Апрелевке — 6-12 тысяч. Параметры включают в себя не только временные, но и сезонные смещения, изменения. Но эта нагрузка мизерная по сравнению с другими районами области.
Наро-Фоминский район не лишен полезных ископаемых. Широко распространены красные глины; вблизи села Каменского есть фосфориты высокого качества, есть залежи булыжного камня, небольшие запасы торфа. По данным географического словаря Московской области в нашем районе в бассейнах рек Нары, Пахры и Протвы имеются крупные залежи известняка, доломитов, мергелей, известковых туфов, много месторождений гравия и песков.
О климате можно сказать то же, что и о климате всего Подмосковья. Единственное отличие касается самого города Наро-Фоминска: до недавнего времени его считали своеобразным полюсом холода в Московской области.
О реках, протекающих по территории района, уже упоминалось. За исключением состояния и чистоты их вод. Единственной относительно чистой рекой в районе пока остается Протва. На ее берегах расположены самые древние населенные пункты — Верея, Вышгород и многие другие. Среднее течение Протвы проходит по землям Калужской области, а впадает она в Оку неподалеку от города Серпухова.
Конечно, в древности реки района использовались в качестве путей сообщения, чаще всего именно на живописных берегах прозрачных голубых артерий селились человеческие сообщества. Время не всегда всесильно и во многих случаях оно пощадило следы пребывания на землях района людей из неолита. На протяжении XX века многие археологи и другие ученые занимались раскопками и изучением этих следов в Подмосковье, в том числе в Наро-Фоминском районе. В 90-х годах Институт археологии Российской академии наук и комитет по культуре и туризму Московской области провели своеобразную инвентаризацию объектов археологического наследия, обобщили материалы по Подмосковью и издали любопытный энциклопедический справочник под названием "Археологическая карта России". Свыше сорока различных по полноте исследований объектов археологии нашего района включены в справочные научные издания, посвященные Московской области.
Все типы археологических памятников имеют свои названия: стоянки, поселения, селища, городища, могильники — курганные и грунтовые, оборонительные сооружения, исторический культурный слой… Наконец, археологические находки, сделанные отдельно, вне связи с конкретным культурным слоем, именуются коротко и просто — местонахождением. Для более уверенной ориентировки в последующем материале скажу, что, например термин "селище" обозначает неукрепленное поселение раннего железного века и средневековья, а термин "городище" принят для укрепленных. Разумеется, для городов, ныне существующих, эти термины не применяются.