Японцы требовали контрибуции, но Николай II гордо заявил, что не даст ни копейки и что Россия никогда и никому ещё не платила контрибуции. Этот вопрос замяли на чисто азиатский манер — царское правительство выплатило 46 млн руб. золотом… за содержание русских пленных в Японии.
За «безголовость» наших генералов и адмиралов пришлось платить и китайцам. Цинское правительство признало все постановления Портсмутского договора, включая переход к Японии аренды Ляодунского полуострова с Порт-Артуром и Южно-Маньчжурской железной дороги. Правительство сделало это по договору с Японией от 22 декабря 1905 г. По дополнительному соглашению, подписанному в тот же день, цинское правительство соглашалось на постройку Японией железной дороги от устья реки Ялу до Мукдена. Оно обязывалось открыть в Маньчжурии 16 городов для международной (японской!) торговли, включая Гирин, Харбин, Хайлар и Айнун.
По возвращении в Петербург С.Ю. Витте был возведён Николаем II в графское достоинство. Новоиспечённый граф упал на колени и, плача, стал целовать руки царя. Но уже через несколько дней в питерских салонах Сергей Юльевич услышал ехидный смешок: «Прибыл граф Полусахалинский».
Генерал-адмирал великий князь Алексей Александрович попросился в отставку, тем более что мадмуазель Балетта предусмотрительно драпанула за границу. Запись в дневнике царя от 30 мая 1905 г.: «Сегодня после доклада дядя Алексей объявил, что он желает уйти теперь же. Ввиду серьёзности доводов, высказанных им, я согласился. Больно и тяжело за него, бедного! Был занят почти до 4 час. Гулял. Погода стояла отличная. Обедал Петя. Покатались втроём» [24. С. 263].
2 июля великий князь Алексей Александрович был уволен с должности главного начальника флота и Морского ведомства с оставлением в звании генерал-адмирала. Ну куда податься генерал-адмиралу флота Российского? Вестимо — в Париж. Там его высочество и тихо почило 1 ноября 1908 г. Его соперник в делах управления флотом и одновременно подельщик в маньчжурских финансовых авантюрах великий князь Александр Михайлович на несколько лет тоже подался на Лазурный берег, где и прославился многочисленными романами.
Николай II ни себя, ни «бедного» дядю Алексея с компанией не считал виновниками поражения в войне. Но без козлов отпущения обойтись было нельзя.
12 августа 1906 г. Николай II повелел отдать под суд начальника Квантунского укреплённого района генерал-лейтенанта Стесселя, коменданта крепости Порт-Артур генерал-лейтенанта Смирнова, начальника сухопутной обороны генерал-лейтенанта Фока и начальника штаба Квантунского укреплённого района генерал-майора Рейса, вице-адмирала Старка, контр-адмиралов Лощинского, Григоровича, Вирена и Щенсновича.
13 марта 1905 г. последовало Высочайшее повеление военному министру генерал-адъютанту Сахарову согласно 64-й статье положения об управлении крепостями «образовать для рассмотрения дела о сдаче крепости Порт-Артур японским войскам следственную комиссию» [15. Т. XVIII. С. 641].
Председателем этой комиссии Николай II назначил члена Государственного совета генерала от инфантерии Х.Х. Роопа. В состав комиссии входили: член Государственного и Военного советов инженер-генерал П.Ф. Рерберг, члены Военного совета генерал от инфантерии К.В. Комаров, генерал от артиллерии Н.А. Демьяненков, генерал от артиллерии П.А. Крыжановский и генерал-лейтенант Я.А. Гребенщиков, комендант Новогеоргиевской крепости генерал-лейтенант Н.В. Богаевский, председатель Виленского военно-окружного суда генерал-лейтенант В.С. Митрофанов, начальник Александровской военно-юридической академии генерал-лейтенант Ф.Н. Платонов, член адмиралтейств-совета вице-адмирал И.М. Диков, председатель морского технического комитета вице-адмирал Ф.В. Дубасов и главный командир флота и портов Балтийского моря вице-адмирал А.А. Бирилев. Заведование делопроизводством комиссии было возложено на генерал-лейтенанта Ф.Н. Платонова, в помощь которому были командированы чины Главного военно-судного управления подполковники В.А. Апушкин и Н.П. Вишняков.
Комиссия начала свою деятельность 1 апреля 1905 г. и закончила работу 14 июля 1906 г. составлением заключения, в котором изложила, что сдача Порт-Артура не может быть оправдана ни тогдашним положением атакованных фронтов, ни недостаточной численностью гарнизона, ни состоянием здоровья и духа людей, ни недостатком боевых и производственных запасов. Условия же капитуляции и их выполнение явились крайне тягостными и оскорбительными для чести армии и достоинства России.