Подавление оказалось очень своевременным, оно произошло на фоне растущего недовольства инфляцией и коррупцией, вызванных экономическими реформами Дэнга. Во время протестов на площади Тяньаньмэнь в 1989 году, которые вдохновили подобные демонстрации по всему Китаю, в том числе и в Фуцзяни, Си осторожно проводил линию между смягчением общественного гнева и защитой партии. Выступая перед местными чиновниками в мае 1989 года, как раз когда протестное движение достигло кульминации, Си признал гнев по поводу коррупции в правительстве, но предостерег от того, что он назвал ошибочными решениями, такими как неограниченная демократия. Он привел Культурную революцию в качестве примера, когда демократические страсти, смешанные с суеверием и глупостью, привели к хаосу. "Можно ли допустить повторения этих дней?" - сказал он. «Без стабильности и единства ничто другое не имеет значения!»
Неясно, что Си думал о кровопролитии, которое положило конец протестам. Некоторые партийные инсайдеры говорили, что Си Чжунсунь, занимавший в то время высокий пост в законодательном органе, в частном порядке выступал против применения силы и в результате снова оказался в стороне, хотя историки не нашли никаких свидетельств того, что он предпринимал активные действия для предотвращения разгона. Так или иначе, старший Си вскоре ушел на пенсию, проведя большую часть своих последних лет в Шэньчжэне, а затем скончался в пекинской больнице в 2002 году в возрасте восьмидесяти восьми лет.
Си Цзиньпин всегда оставался сыном, проявляя глубокое уважение к характеру и наследию своего отца. Когда в 2001 году патриарх отмечал свой восемьдесят восьмой день рождения, младший Си был слишком занят, чтобы присутствовать на празднике, и вместо этого написал ему письмо. "С того времени, когда люди на улицах называли нас "сукиными детьми", я уже твердо верил, что мой отец - большой герой и отец, заслуживающий нашей гордости", - написал сын. «Отец непоколебимо верит в коммунизм и считает, что наша партия великая, славная и правильная; твои слова и дела показали нам правильный путь вперед».
В 1990 году Си получил назначение в столицу провинции Фучжоу, где он пробыл двенадцать лет, сначала в качестве муниципального партийного босса, а затем поднялся до губернатора Фуцзянь, второго номера провинции. Как и прежде, Си старался произвести быстрое впечатление, отправившись в турне по низовым районам через несколько дней после прибытия и заискивая перед начальством и иностранными дипломатами. Он требовал срочности от своих подчиненных, говоря им, чтобы они работали в духе mashang jiuban, или "делай это немедленно" - лозунг, который до сих пор висит в партийном штабе Фучжоу. В начале 1991 года администрация Си предложила построить большой аэропорт для обслуживания Фучжоу, утверждая, что нехватка воздушного сообщения препятствует росту города. Проект аэропорта Чангле получил быстрое одобрение, и строительство началось в 1993 году.
После "южного турне" Дэн Сяопина 1992 года, направленного на оживление экономических реформ, которые застопорились после разгона на площади Тяньаньмэнь, Си принял это послание, отправившись в такие места, как британский Гонконг, Сингапур и США, чтобы привлечь инвестиции и наладить коммерческие связи. Он обхаживал этнических китайских предпринимателей на Тайване и в Юго-Восточной Азии, расхваливая низкую стоимость рабочей силы в Фуцзяни и апеллируя к чувству родства среди тех, у кого есть родовые корни в провинции. Си совершил переворот, пригласив гонконгского магната Ли Ка-шинга для реконструкции исторического района Фучжоу Санфанг Цицян, или "Три переулка, семь переулков", в роскошную жилую и коммерческую зону, что было отмечено грандиозной церемонией закладки фундамента, которую Си организовал для Ли в 1993 году.
Некоторые из этих "престижных проектов" впоследствии были омрачены противоречиями. Аэропорт Чангле в Фучжоу после открытия в 1997 году не оправдал прогнозов по использованию, понес значительные убытки и набрал большой долг. Правительственный аудит обвинил "ненаучную" разработку политики и плохое управление, и аэропорт подвергся реструктуризации, прежде чем получил первую годовую прибыль в 2005 году. В середине 2000-х годов муниципальные власти приостановили и пересмотрели проект развития Санфан Цисянь из-за задержек и возмущения общественности по поводу разрушения исторических зданий. Масштаб этих проблем стал очевиден только после того, как Си покинул пост главы партии Фучжоу в 1996 году, и негативная пресса оставила его невредимым. После прихода Си к власти в качестве верховного лидера государственные СМИ реабилитировали оба проекта как примеры дальновидного руководства.