CCDI был восстановлен в 1978 году, примерно через два года после смерти Мао. Его первыми приоритетами были чистка маоистских радикалов и обеспечение соблюдения партийных правил, хотя борьба с коррупцией приобрела большее значение, поскольку экономические реформы в Китае открыли возможности для подкупа. Однако в 1980-е годы ведомство оставалось относительно слабым, поскольку либерально настроенные лидеры, такие как Ху Яобан и Чжао Цзыян, пытались установить более четкие границы между партией и государством. В 1986 году было возрождено отдельное Министерство надзора для контроля за государственными служащими, что неявно вывело их за пределы сферы деятельности партийных инспекторов. Руководство также урезало полномочия ККДИ, понизив партийный ранг главы комиссии и распустив многие партийные дисциплинарные группы, которые были встроены в государственные учреждения.
Протесты на площади Тяньаньмэнь в 1989 году остановили эти реформы. Дэн Сяопин решил восстановить власть партии над государственными органами, и вскоре CCDI вернула себе полномочия надзирателя за государственными органами. В 1993 году комиссия поглотила министерство надзора в рамках соглашения, известного как "один набор персонала с двумя вывесками", согласно которому чиновники могли переключаться между партийной и государственной принадлежностью в зависимости от обстоятельств, хотя партийные титулы оставались более весомыми. Во время реструктуризации после 1989 года ККДИ также приобрела свой самый известный инструмент расследования - секретный процесс бессрочного содержания под стражей и допросов, известный как "шуангуй", где следователи часто безнаказанно подвергали подозреваемых физическому и психическому насилию.
В 1990-х и 2000-х годах, когда экономика Китая переживала подъем, партия определила борьбу с коррупцией в качестве ключевой официальной задачи. Соответственно, CCDI переключила свое внимание на расследование должностных преступлений, а не политических проступков и идеологических отклонений. Коррупция может быть вечным злом, но Китай после Мао создал благодатную почву для корыстных чиновников и кумовьев. Прорыночные реформы и инвестиционный рост привели к огромному богатству и дали чиновникам широкие возможности манипулировать распределением земли, капитала и других ресурсов в обмен на взятки и услуги. Правительственная карьера обещала не только надежную работу, известную как пресловутая "железная рисовая чаша", но и льготы, которые превосходили скудные зарплаты чиновников. В докладе, опубликованном центральным банком Китая в 2008 году, приводятся оценки, согласно которым с середины 1990-х годов за границу или исчезли до восемнадцати тысяч коррумпированных чиновников и руководителей государственного бизнеса, которые скрылись с активами на сумму около 800 миллиардов юаней, что эквивалентно примерно 120 миллиардам долларов США и 2,7 процента валового внутреннего продукта Китая в том году.
Антикоррупционные репрессии, проводимые преемниками Дэнга, Цзян Цзэминем и Ху Цзиньтао, часто сходили на нет после первоначального пыла. Они длились достаточно долго, чтобы устранить конкурентов, не причиняя слишком большой боли политической и деловой элите, которая привыкла к тому, что для обхода бюрократии и получения государственной помощи необходимо подмазывать ладони. Несколько тигров будут убиты, а некоторые мухи прихлопнуты, но руководство в итоге воздержится от более широкой чистки. Одно из опасений заключалось в том, что китайская экономика может заглохнуть без того, что некоторые считают смазывающим эффектом коррупции, особенно в форме "денег доступа", или того, что политолог Юэнь Юэнь Анг из Мичиганского университета называет "стероидами капитализма", когда бизнес предлагает чиновникам вознаграждение «не только за скорость, но и за доступ к эксклюзивным, ценным привилегиям».
CCDI занималась в основном борьбой с коррупцией на среднем уровне и мало что могла сделать для того, чтобы остановить более широкие экономические силы, которые подпитывали жадность в правительственных кругах. Один научный анализ коррупционных дел, раскрытых с 1993 по 2010 год, показал, что коррупция, совершенная чиновниками более высокого ранга, с меньшей вероятностью будет обнаружена и расследована, чем коррупция, совершенная чиновниками младшего звена. В другом исследовании профессор Университета штата Джорджия Эндрю Ведеман представил данные, свидетельствующие о том, что в середине 2000-х годов коррупционеры сталкивались с гораздо меньшим риском быть пойманными, чем десятилетием ранее. Такое неравномерное правоприменение "позволило коррумпированным чиновникам низшего звена подняться по карьерной лестнице и войти в высший эшелон власти", - пишет Ведеман. «Таким образом, мухи превратились в крыс, крысы - в волков, а волки - в тигров».