6 июня на совещании командного и политического состава партизанских отрядов И. И. Алешин объявил решение бюро ЦК КП(б) Молдавии о создании соединения и задачах, стоящих перед ним. В этот же день приступил к исполнению обязанностей командира Молдавского соединения партизанских отрядов полковник В. А. Андреев. 8 июня в обязанности комиссара соединения вступает секретарь ЦК КП(б) Молдавии И. И. Алешин. Приказом по соединению назначаются заместители командира и комиссара соединения, состав штаба, политаппарат, особый отдел, радиоузел, санитарная и хозяйственная части.
В состав соединения фактически вошли не четыре отряда, как предполагалось, а два — имени Котовского, «За освобождение Советской Молдавии» и орггруппа М. В. Чабанова, которая к 16 июня выросла в отряд, получивший имя М. В. Фрунзе. Отряды имени Ворошилова и имени Буденного, находившиеся в это время в рейде из Злынковских лесов в междуречье Днепра и Припяти, действовали самостоятельно до создания Второго Молдавского соединения партизанских отрядов.
Командование и работники штаба соединения, знакомясь с состоянием отрядов имени Котовского и «За освобождение Советской Молдавии», провели ряд учебных тревог, мелких операций. Изучение показало, что отряды еще не готовы к выполнению поставленной перед соединением задачи — выхода для боевых действий на территорию Молдавии. Как бы соревнуясь со старыми крупными соединениями, такими как соединения Героев Советского Союза С. А. Ковпака, А. Н. Сабурова, М. И. Наумова, организаторы увлеклись лишь количественной стороной комплектования отрядов. Так, группа Д. Е. Бабича за 15 дней, прошедших после выброски в тыл противника, уже имела свыше 300 человек. Организаторы не учли и то обстоятельство, что отбор добровольцев в отряды, которые имеют задачу после формирования совершить рейд из Белоруссии в Молдавию, то есть пройти по тылам противника не одну тысячу километров, должен проводиться особенно тщательно и осторожно, так как не каждый доброволец понимал необходимость идти куда-то в незнакомую многим из них Молдавию, в то время как его семья и дом гибнут на глазах. Часть добровольцев шла в отряд для того, чтобы бить гитлеровцев на месте, защищая одновременно свои семьи и домашние очаги. Кроме того, для рейда были необходимы командиры и бойцы, подготовленные в военном отношении, имеющие определенный боевой опыт. Отряды же комплектовались главным образом за счет местной молодежи непризывного возраста, не подготовленной в военном отношении. За время формирования отряды, кроме случайных стычек, боевой деятельности не вели. 4 июня И. И. Алешин, ознакомившись с отрядами, сделал в дневнике следующую запись: «Весь день занимался отрядами. Из докладов командиров и политработников ясно: состав людей надо отсеивать. Нужны оружие, боеприпасы».
В отрядах имени Котовского, «За освобождение Советской Молдавии» находилось до 40 процентов невооруженных бойцов. Необходимо было или дополучить оружие с Большой земли, или задержаться с выходом в рейд и развернуть боевые действия здесь для того, чтобы довооружиться за счет противника.
В это время в тылу противника находились секретарь ЦК КП(б) Украины Д. С. Коротченко и начальник Украинского штаба партизанского движения Т. А. Строкач, руководившие реализацией весенне-летнего плана боевых действий партизан Украины. 17 июня Д. С. Коротченко и Т. А. Строкач прибыли в соединение. Они провели совещание командного состава, ознакомили с обстановкой тех областей, через которые соединению предстояло идти, сообщили о концентрации войск противника на границах партизанского края. По данным разведки украинских соединений к 15 июня 1943 года на границах партизанского края противник сосредоточил около 40 000 войск.
В такой обстановке командование соединения приступает к выполнению поставленной задачи. Разрабатывает программу обучения командного и рядового состава отрядов, проводит несколько операций по разгрому мелких гарнизонов противника в Петриковском и Туровском районах, опрашивает личный состав. В результате опроса только из отряда «За освобождение Советской Молдавии» было отсеяно 152 человека, не желающих уходить с отрядом из своих районов. В разведку пути на юг направляются две группы разведчиков, а 18 июня 1943 года — отряд имени Фрунзе (командир отряда М. В. Чабанов, представитель штаба соединения В. В. Сваричевский), который к 5 июля 1943 года достиг Городницкого района Житомирской области. Для обеспечения разведки во время рейда 19 июня 1943 года создается конный партизанский отряд имени Ворошилова (второй молдавский отряд имени Ворошилова) из военнослужащих, попавших в окружение. Командиром отряда назначается П. А. Сергий, имеющий опыт партизанской борьбы с 1941 года, комиссаром — депутат Верховного Совета МССР В. Н. Дамаскин. Большую работу по подготовке к рейду провели партийные организации и политаппарат под руководством секретаря ЦК КП(б) Молдавии И. И. Алешина.