До этого времени еще не был решен вопрос о том, как придется сбрасывать торпеды в высокие волны Перл-Харбора. Рапорты от офицеров, посетивших Трент, позволили начать работы в этом направлении. Арсенал в Йокосуке приступил к модернизации имеющихся торпед. Однако пробные сбросы торпед не принесли ожидаемых результатов. Торпеды зарывались слишком глубоко, и требовалось не менее 200 метров, чтобы торпеда вышла на боевую глубину. Таким образом, применять торпеды при налете на Перл-Харбор не было никакой возможности. Кроме того, американцы обычно швартовали корабли парами. Снаружи линкоры прикрывались менее крупными кораблями, поэтому были хорошо защищены от торпед. Единственной возможностью поразить линкор было использовать бронебойные бомбы. Из имевшихся в арсенале японской авиации бомб ни одна не могла подойти на эту роль.
Пробные метания бомб массой 250 кг прошли успешно, но по расчетам бомбы не пробивали броню американских линкоров. Было решено использовать в качестве бомб 409 мм снаряды главного калибра линкоров «Нагато» и «Муцу». На снаряд наваривалось хвостовое оперение, и получалась авиабомба массой 800 кг. Такая бомба по расчетам уже могла пробить самую толстую броню линкора класса «Maryland», и разорваться внутри корпуса корабля, причинив ему тяжелые повреждения. Импровизированную бомбу приняли на вооружение как Тип 99 номер 80 модификация 5. Очень быстро были готовы несколько бомб, которых использовали в опытном бомбометании по макету линкора «West Virginia». Однако все бомбы, сброшенные самолетами морского авиационного корпуса из Йокосуки, легли мимо цели. Вскоре к испытаниям привлекли пилотов 1-го воздушного флота Мицуо Фучиды. Новая серия испытаний также закончилась неудачно. Макет удалось поразить лишь спустя несколько дней. Было решено, что бомбометание будет проводиться с высоты 3000 метров, опускаться ниже было невозможно из-за зенитного огня.
25 августа подполковник Мицуо Фучида (15 октября произведенный в полковники) прибыл на борт авианосца «Акаги» в качестве командующего всех частей 1-го воздушного флота.
Вместе с Минору Генда он проводил в заливе Кагосима подготовку пилотов, которые должны были участвовать в налете на Перл-Харбор. В ходе учений снова обнаружилась проблема с торпедами. Пилотам не удавалось сбросить торпеды при глубинах менее 12 метров, несмотря на то, что торпеды оснащались деревянными стабилизаторами. Учения продолжались весь сентябрь, но так и не дали ожидаемых результатов.
В конце сентября группа японских специалистов из Йокосуки, проводившие эксперименты над торпедными стабилизаторами, удалось добиться первых успехов. Работая над торпедой Модель 2, они сумели добиться уверенного сброса торпеды при глубинах до 13 м.
В октябре новая торпеда была принята на вооружение как Тип 91 Модификация 2. В конструкцию торпеды по сравнению с базовой моделью внесли ряд изменений, которые, к сожалению, привели к росту массы торпеды. Торпеда оснащалась стабилизаторами, установленными в хвостовой части. Эти стабилизаторы не давали торпеде глубоко зарываться в воду, а также обеспечивали ей быстрый выход на боевую глубину. Торпеду следовало сбрасывать с высоты 10 м (или 20 м для усовершенствованных образцов). Минимальная дальность сброса 200 м. Это расстояние требовалось для активизации запала торпеды. Скорость самолета в момент сброса ограничивалась 160 узлами. Механизм глубины стоял на всех торпедах и позволял торпеде после погружения выходить на глубину атаки 2 метра.