Прежде всего следовало разработать проект их восстановления. С этой целью участникам экспертизы были выданы обмерные чертежи собора, еще несколько лет тому назад составленные И. Слядневым и его помощниками. Архитекторам было предложено разработать проекты и сметы «по прежнему фасаду и профилю», но с двумя вариантами конструкций - деревянными и огнестойкими. В начале июня архитекторы и мастера представили свои соображения. Лучшим был признан проект конторы Невского монастыря, которой и были поручены все восстановительные работы.
Возведение на чердаке кирпичных арок вместо сгоревших деревянных стропил и перекладка в кирпиче купола закончены были летом 1757 года. На восстановление собора без колокольни потребовалось полтора года.
Несмотря на повторные указы о восстановлении колокольни дело не двигалось. Только через три года приступили к усилению ее основания, разобрали колокольню до нижних окон. Вот как описывает работы их участник архитектор С. Волков: «Внутри колокольни вновь побиты сваи и сделан фундамент в прибавок к старому. И на оном изнутри вновь же каменные стены с. перемычками, толщиной трех аршин и три четверти, а вышиною до кровли на десять сажен» 1. [1 ЦГАДА, ф. 250, д. 3618, 1761 г., л. 64.]
В 1762 году работы были приостановлены, а спустя два года Екатерина II распорядилась «для строения колокольни Петропавловской сочинить новый проект» 1. [1 ЦГИА СССР, ф. 19, оп. 119, 1764 г., д. 53, лл. 3 - 4.]
В кругах архитекторов к внешнему виду собора относились критически. Так, например, С. И. Чевакин-ский в записке к проекту восстановления собора писал, что барабан под куполом «по препорции сделан весьма мал и по тонкости своей много скрывается кровлею и поэтому представляет неприятный и беспропорциональный вид, а прежде бывшая колокольня со спицем по препорции своей вышины весьма была тонка2. Итак, надо было снова вернуться к разработке проекта колокольни. В связи с этим 12 октября 1764 года были вновь созваны крупнейшие архитекторы Петербурга; им предложили заняться проектированием колокольни. В апреле 1765 года подали проекты С. Волков, В. Деламот, Ю. Фельтен и А. Ринальди, а через год - А. Вист, К. Кнобель и С. Чевакинский. [2 ЦГИА СССР, ф. 19, оп. 119, 1766 г., д. 52, лл. 12 - 13.]
Многие чертежи этих проектов сохранились, среди них лист обмерного чертежа, сделанный в 1748 году и подписанный И. Слядневым. Этот чертеж в последующих архивных документах упоминается как «старый чертеж». Сохранились также четыре неподписанных проекта 1756 года, в том числе и проект конторы Невского монастыря. Сохранились, наконец, и проекты восстановления всего собора - проекты А. Виста, С. Чева-кинского, А. Ринальди, Ю. Фельтена и С. Волкова.
В августе 1766 года «старый чертеж» и все проекты были представлены на рассмотрение Екатерины II, решение которой было неожиданным: «Рассматривая чертежи Санкт-Петербургской Петропавловской колокольни, повелеваем делать оную точно так, какова прежняя была, понеже все прочие планы не столь красивы» 1. [1 ЦГАДА, ф. 259, д. 3618, 1768 г., л. 127.]
Вслед за этим была составлена новая смета и исполнены чертежи собора и для выбора несколько вариантов чертежей колокольни2. Для возведения колокольни была утверждена специальная контора во главе с инженером А. Дьяковым, архитектором С. Волковым, а позднее П. Патоном. [2 ЦГИА СССР, ф. 485, оп. 2, ед. хр. 1107, 1109.]
И на этот раз трудность заключалась в поисках специалиста для возведения шпиля. В 1771 году был приглашен опытный мастер Б. Брауэр, который занимался укреплением деревянных шпилей в Риге, а затем работал в Петербурге. Он разработал проект деревянного шпиля Петропавловского собора, который «срубила» на земле артель крестьян-плотников из 8 человек; среди них были А. Еремеев, М. Волков и Г. Петров. В октябре 1772 года они подняли шпиль, укрепили и затем обшили досками под медное окрытие. Изготовлением медных листов и их золочением «через огонь» занимались мастера К. Форшман и Я. Тум. За работами наблюдал директор Монетного двора.
Фигура летящего ангела на вершине шпиля была исполнена по образцу прежнего.
На позолоту шпиля пошло 2814 червонцев, или около 9 килограммов чистого золота.
В основном постройка колокольни была завершена в 1775 году. Позднее производились работы внутри собора.
Шпиль в 1777 году был снабжен «электрическим отводом к отвращению удара и паления от молнии происходящего»; его разработали академики В. Румовский, В. Крафт и И. Эйлер. На башне в 1776 году были установлены новые часы с курантами, которые отбивали полчетверти часа, четверти, полчаса и час, а в 12 часов исполнялась мелодия.