Примером типичных андалузских пиратов служат братья Мартин Алонсо и Висенте Янес Пинсоны, моряки из Палос-де-Могер (Уэльва), расположенного рядом с устьем реки Тинто, которые занимались морским разбоем у каталонских берегов. Мартин добирался в своих плаваниях даже до Ла-Манша и Азорских островов, где мог познакомиться с Христофором Колумбом, который плавал приблизительно там же. Вероятно, один из них — либо Колумб, либо Пинсон — был тамплиером и посвятил другого в секреты ордена, но возможно, что они оба принадлежали к ордену и их встреча не была случайной. Известно лишь, что впоследствии оба брата Пинеона вошли в состав первой экспедиции Колумба. Некоторые исследователи полагают, что так их наказали за бесчинства католические короли (Фердинанд и Изабелла), по мнению других, действовавший в подполье Орден Храма поручил им «открыть» Америку, о чем более подробно пойдет речь ниже.
В конце XV века католические короли решили запретить плавания корсаров под своими знаменами. Известно, что Фердинанд и Изабелла беспрекословно выполняли волю Папы, всегда очень холодно относившегося к пиратам, многие из которых были так или иначе связаны с подпольным Орденом тамплиеров. Какой бы ни была причина запрета на занятие корсарством, в результате Средиземное море оказалось во власти пиратов-берберов, служивших Османской империи. Турецкий пират греческого происхождения Хайр ад-дин, которого итальянцы за его косматую рыжеватую бороду прозвали Барбаросса, вместе со своим братом Аруджем, состоявшим на службе у могущественного султана Сулеймана Великолепного, заложил новые основы пиратского дела. Рыжебородым пришла в голову блестящая идея нанять на берегах Магриба мелких мусульманских пиратов, которые работали на себя, и многочисленных бывших корсаров из Европы, оставшихся без работы после указа католических королей, чтобы сформировать огромный пиратский флот, который отправится на пиратский промысел под знаменами Османской империи. Его первой успешной кампанией было изгнание испанцев с алжирского острова Пеньон, после чего Хайр ад-дин получил в награду звание паши Алжира. Он немедленно перестроил и расширил алжирский порт, превратив его в центральную базу магрибских пиратов в Средиземноморье. Алжир при Хайр ад-дине достиг расцвета и содержал многочисленный эффективный флот, который участвовал в кровопролитных сражениях и заключал временные союзы с сицилийскими пиратами-тамплиерами. Покровительство, оказываемое пиратам турецкими султанами, достигло таких высот, что в 1534 году Барбаросса был назначен главным адмиралом Османской империи и получил в свое распоряжение огромный флот, с которым он завершил завоевание Туниса.
Тем временем Сулейман отвоевывал все новые европейские территории и на суше, захватил Белград и разгромил венгерского короля Людовика II, обойдя Вену по берегу Дуная. Войскам императора Карла V (носившего имя Карла I в Испании) удалось отбить это наступление и не допустить падения австрийской столицы. Но отступление Сулеймана не означало, что он прекратил угрожать Европе, и тем более не означало утраты пиратом Барбароссой, в то время уже адмиралом имперского флота, абсолютного господства в Средиземном море.
Другим тяжелым ударом для турецких пиратов было поражение в битве при Лепанто 7 октября 1571 года. В Эгейском море 280 кораблей Священной Лиги, образованной Испанией, Венецией и Ватиканом, выступили против 300 османских кораблей. Коалиционный флот навязал своим противникам тактику абордажей и рукопашного боя (что, кстати, стоило руки дону Мигелю де Сервантесу). Воодушевленный этим триумфом, Филипп II посоветовал своему сводному брату Хуану Австрийскому, чтобы тот напал на укрепления пиратов в Северной Африке. «Великий капитан» последовал совету и в 1575 году взял город Тунис и ключевой форт Лa-Голета, правда, турки вскоре их отвоевали и снова стали претендовать на гегемонию в Средиземном море.
Неудавшаяся месть тамплиеров
Те, кто верят в существование тайного союза между Сулейманом и тамплиерами, приводят в качестве аргумента нападение турецкого флота под командованием адмирала Драгута, наследника Хайр ад-дина, на остров Мальта в 1565 году, в котором приняли участие 200 боевых кораблей и 5000 лучших солдат. Известно, что рыцари-госпитальеры, вечные враги Ордена тамплиеров, после провала крестовых походов бежали на этот остров, где их орден получил имя мальтийского. Возможно, что три века спустя тамплиеры пожелали отомстить за ватиканские интриги госпитальеров, подговорив Сулеймана захватить остров, который служил им базой. Но к удивлению турок, мальтийцам под командованием их Великого магистра Ла-Валетта удалось отразить удар.