Из семи детей Николая Емельяновича оставалось в живых четверо (3 сына и дочь), и всевм им Ложечников старался дать основательное образование. Человек высоконравственный и честный, он имел суровый, необщительный характер и к детям своим относился чрезвычайно строго, но несмотря на это, дети его до сих пор сохранили чувство благоговения к его памяти, и обаяние его личности осталось в семье до сего времени. В воспитании религия играла выдающуюся роль, так как Ложечников был глубоко и искренно религиозен. Несомненно, что эта последняя черта по преимуществу послужила звеном к сближению Ложечникова с священником миссионером Вениаминовым, впоследствии архиепископом Иннокентием. Сближение это началось в 1839 году, когда о. Вениаминов (Иннокентий) проездом в Петербург, ради издания молитв и священных книг в своем переводе на Алеутское наречие и доклада Св. Синоду о своей миссионерской деятельности, останавливался в Москве в том же доме, где жила семья Ложечникова. В ежедневных, длинных беседах о. Вениаминов (Иннокентий) и Ложечников успели оценить друг друга и положить начало тем отношениям взаимного уважения и дружбы, которые никогда затем не прерывались и ничем не омрачались. На возвратном пути из Петербурга о. Вениаминов, в сане уже епископа, наименованный Иннокентием, имея пребывание в Чудовом монастыре, ежедневно посещал семью Ложечникова, и это послужило к еще большему взаимному их сближению. С этого времени начинается их взаимная переписка, не прекращавшаяся вплоть до третьего приезда преосвященного Иннокентия в Москву в 1856 г. на коронацию Императора Александра II. Не было интереса, начиная от самого высокого общественного и кончая мелкими житейскими вопросами, который не затрогивался бы в этой переписке. Говоря о делах Компании, о своей миссионерской деятельности, касаясь интересов своих детей, в делах которых семья Ложечникова принимала живое родственное участие, преосвященный Иннокентий просил между прочим исполнять и разныя поручения, делать разныя покупки от митры до шерстяных чулок и от золоченой ризы до медных крестиков для диких обитателей Камчатки. Заботы эти падали на долю жены Ложечникова (Александры Никитишны. Ее преосвященный Иннокентий называл обыкновенно «Сестрица») и сестры ее и, конечно, исполнялись с готовностью и радостью. К сожалению, из этой переписки, длившейся свыше 15 лет, сохранились у наследников Ложечниковых только семнадцать писем, которыя и помещаются в нашем собрании.
Последняя встреча Ложечникова с преосвященным Иннокентием была в 1856 году, и эта встреча была проникнута прежними взаимными чувствами. 10 декабря 1857 г. Ложечников скончался, оставив в единственное наследие семье своей доброе, честное имя. Александра Никитишна Ложечникова жила до 1882 г., и скончалась 14 марта.
Из семьи Николая Емельяновича находятся в живых: дочь Александра и два сына: Петр — бывший товарищ председателя Одесского Окружного Суда — ныне в отставке, и Сергей Николаевич, известный окулист, старший ординатор Московской Глазной Больницы, консультант по глазньм болезням городских больниц для чернорабочих и совещательный член Московского Врачебного Управления, которому и приносим глубокую признательность за просвещенное внимаие его к нашему труду, выраженное в доставлении писем и некоторых биографических сведений о своем отце. (Добавление к примеч. стр. 44, письмо 13).