Тем временем из Остряково под Симферополем один за другим уходили поезда в глубь страны. За сутки до этого оттуда выбили сепаратистов бойцы донецкого полка спецподразделения “Беркут”, который был спешно переброшен траспортной авиацией из Борисполя. Потому что они участвовали в майдановских событиях и еще не успели вернуться домой. Началась эвакуация мирного населения со всей территории Крыма кроме Севастополя. В Крыму стояла сплошная паника. Все дороги были забиты различного рода транспортом. Железнодорожное полотно охранялось милицейскими автопатрулями почти на все протяженности до выезда из Крыма. Части Внутренних войск и милиции вели уже полномасштабные уличные бои с татарвой во всех крупных городах Крыма, кроме Севастополя. Чонгарский перешеек и остальные сухопутные дороги из Крыма были перекрыты частями 32 армейского корпуса. Также некоторые подразделения МО участвовали в уличных боях в столице Крыма. Через пару дней Симферополь был полностью под контролем сепаратистов. Янукович снял нынешнего Премьер-министра автономии Сергея Куницына и передал его полномочия Комнадующему ВМСУ Игорю Князю, с подчинением ему всех сил территориальной обороны на полуострове.
Операция по захвату и восстановления порядка в Симферополе разрабатывали наспех. В Крыму создали объединенную оперативную группировку из частей 32 армейского корпуса, Крымского Территориального командования ВВ МВД, частей ВМС Украины и остатков милицейских подразделений. В Севастополе спешно формировались новые части за счет прибывающего пополнения по мобилизации. Не хватало оружия, обмундирования и техники. Командование Черноморским флотом объявила об оказании помощи крымчанам в эвакуации, а также подразделения российской морской пехоты сменили украинские подразделения на блок-постах в окрестностях Севастополя «с целью обеспечения безопасности граждан России, проживающих в Крыму и Севастополе».
Основной замысел операции заключался в постепенном выдавливании боевиков из города в степной Крым и отрезании от горных районов. Для этого по трем сходящимся направлениям (Севастопольское, Ялтинское и Феодоссийское) наступали смешанные группировки правительственных войск. Из Севастополя наступали части ВМС, 41 полк оперативного назначения ВВ МВД, отдельный батальон ППС и рота подразделения «Беркут». С Ялтинского направления: танковый полк 32 АК, оперативная группа ВВ из частей Симферопольского гарнизона и сводный милицейский батальон. С Феодоссийского направления: механизированная бригада и аэромобильный полк 32 АК, два батальона полка спецназа ВВ «Тигр» и сводный милицейский батальон.
Севастопольская группировка завязла в окрестностях Бахчисарая. Татарские женщины и дети перекрыли дороги и не пропускали колоны в районе с. Железнодорожное. Такие же случаи были на остальных направлениях в районе Зуи, Вишневое и Пионерское. После двухчасовых переговоров, которые ни к чему не привели – рота «Беркута» растолкала толпу на дороге и удерживали ее до тех пор, пока колона полностью не прошла. С боем захватили Бахчисарай и сняли осаду с территории местного инженерного батальона ВМС. Оставшиеся боевики были блокированы на территории Бахчисарайского цементного завода или ушли в горы. Оставили в городе роту моряков в дополнение к остаткам милиции и инжбата для поддержания порядка. Основные силы группировки двинулись дальше, преодолевая незначительное сопротивление сепаратистов. В районе Приятного свидания авангард остановился. Ждали занятия господствующих высот ВВшниками. По высотам перед этим «работала» артиллерия. Через четыре часа группировка разделилась: один батальон ВВ ушел на соединение с Ялтинской группировкой, моряки двинулись вдоль железнодорожного полотна, а остатки полка ВВ и остальные милицейские подразделения входили в город по Севастопольской трассе. На удивление в городе было тихо. И основная колона Севастопольской группировки беспрепятственно дошла до перекрестка с улицей Ивана Козлова. По улице было много сгоревших автомобилей, которые были нагромаждены так, что мешали маневру брони. Неожиданно загорелся передний БТР и с него быстро попрыгали солдаты. Из окон рядом стоящих домов велся шквальный огонь. Через минуту загорелась замыкающая БМП и перегородила путь к отступлению. Командование группировкой растерялось и дезориентировалось – татары перед приходом войск поснимали со всех домов таблички с названиями улиц. В районе аэропорта Заводское зажали и колону моряков. На помощь севастопольцам пробивались остальные группировки, командиры которых были знакомы с городом. Артиллерия с Петропавловки по «предположительным скоплениям боевиков» – несколько раз накрывала своих соседей из Феодоссийской группировки. Боевики граммотно организовывали сдерживающие засады по пути следования колон и избегали открытого контакта. Потери правительственных группировок по бронетехнике и личному составу все больше увеличивались. Большей части сепаратистов удалось просочиться в горы. Мустафа Джемилев обратился к Виктору Ющенко, а также к мировой общественности за помощью в борьбе за Крымско-татарскую автономию.
В Севастополе около недели совещались все структуры города о том, как недопустить распространения конфликта непосредственно в город. Было решено окружить город сетью блок-постов на всех дорогах. Администрация города обратилась за помощью к Командующему Черноморским флотом. Президент РФ выступил с заявлением, об оказании помощи в эвакуации граждан России и Украины из Крыма. Через сутки, руководство города решила провести частичную эвакуацию населения. Но поступила команда из Киева о полной эвакуации в районы Одессы, Николаева и Херсона. Опять совещания-заседания всех структур. Было решено перевозить людей морем. 27-го июля в 07.00 сотрудники милиции и бойцы частей морской пехоты КЧФ оцепили сначала район Камыши. Бойцы Управления МЧС в г. Севастополе (бывшие пожарники) проводили оповещение населения. Население выходило из домов и шло по коридору оцепления к конечной остановке Камышей, где их после регистрации в эвакопункте садили на троллейбусы и автобусы и везли на Морской вокзал и Арт-бухту. Там их ожидали пришвартованные теплоходы “Маршал Кошевой” и “Маршал Рыбалко”. В открытом море были видны корабли ВМС Украины и Черноморского флота. А также суда вспомогательного флота, которые предполагалось использовать тоже для эвакуации. Те жители, которые не могли самостоятельно передвигаться забирали машины скорой помощи, которые вызывались по рации. И так район за районом.
В управлении по чрезвычайным ситуациям городской администрации, где развернули штаб проведения эвакуации, стоял непрекращающийся людской гомон, звук бесконечных звонков телефонов и шум радиостанций. Михаил Иваненков – начальник информационно-аналитического отдела штаба, еле успевал фиксировать поступающие донесения и вводные в оперативную тетрадь. Уже вторые сутки на ногах. Он уже забыл когда последний раз ел. Правая рука уже отваливалась от писанины. В штабе присутствовали представители всех городских структур, каждый либо что-то писал, либо с кем-то разговаривал по телефону или рации. Как всегда из динамиков радиостанции пожарников вырывалась сплошная ругань в эфире – это полковник внутренней службы Яковца – начальник пожарки разносил всех подряд. Вообще Миша считал все это управление МЧС (бывшее управление пожарной безопасности), а точнее работу в нем "днем открытых дверей в дурдоме". начальник этого “дурдома” – что называется геморрой воплоти. Во время эвакуации столкнулись с проблемой мародерства. Сознательные граждане (были еще и такие) спокойно выходили в указанный район и все было нормально. Но обратно этому течению повалило другое – бомжи и наркоманы, жаждавшие легкой наживы. Их быстро повязали менты и, после вывоза за город на мыс Фиолент, их расстреливали и выкидывали в море. Тем временем люди начали приходить на эвакопункты, что развернулись почти во всех крупных жилых массивах. Народ проходил регистрацию и отправлялся на вокзал или в Камышовский порт.