К 1436 г. закончился постыдный торг чашников с императором. — Сигизмунд обязался не возвращать в Чехию католических священников и монахов, не назначать иноземцев на высшие должности, не преследовать участников гуситского движения. В августе 1436 г. император въехал в Прагу.
Вскоре все убедились, что лживый и коварный Сигизмунд не собирался выполнять принятые на себя обязательства. Вслед за ним в Прагу стали съезжаться католические епископы, попы и монахи. Одновременно начались жестокие проследования героев многолетней борьбы с иноземными полчищами. Вскоре и изменники народному делу из числа феодалов и бюргеров почувствовали на себе тяжелую руку нового короля. Сигизмунд расхищал богатства страны, раздавал земли и должности своим иностранным приспешникам. В конечном счете в ходе всей борьбы выиграли лишь паны, все более оттеснявшие земанов и бюргеров.
Хотя на Липанском поле сложили свои головы лучшие борцы за свободу народа, отдельные вооруженные отряды таборитов и «сирот» продолжали борьбу. Главными их оплотами и центрами, вокруг которых группировались силы сопротивления, были Градец Кралёвый и крепость Сион. Гарнизоны таборитов оставались и в словацких городах — Трнаве, Ликаве, Тополчанах, где Федор Острожский и Блажек из Боротина сопротивлялись до конца 1435 г., а затем ушли па территорию Польши.
В Градце Кралёвом власть находилась в руках городского плебса, во главе которого стояли старый сподвижник Яна Жижки священник Амброж и верный друг Яна Желивскогог Якуб Влк. Народным вождям, опиравшимся на поддержку городских низов, удалось организовать оборону города. Неоднократные нападения и даже длительная осада, предпринятая войсками панского союза, окончились неудачей. Император бросил под Градец значительные силы, но осаждавшие не смогли взять город, были разбиты и обращены в бегство.
Однако дни осажденных были уже сочтены. В самом Градце свила себе гнездо черная измена. В ночь с 3 на 4 марта 1437 г. богатые горожане Градца, еще ранее вступившие в тайные переговоры с Сигизмундом, подняли мятеж. Сторонники Амброжа были вынуждены бежать. Во время бегства Амброж неудачно прыгнул с городской стены, сломал руку и ногу и был взят в плен вместе с нежелавшими оставить его товарищами, среди которых находился и Якуб Влк. Вскоре Амброж был казнен. Градецкие бюргеры признали власть Сигизмунда.
Последним оплотом чешских повстанцев оставалась крепость Сион, сооруженная на крутой горе неподалеку от Малешова — места славной победы Яна Жижки. Здесь укрепился его сподвижник гетман Ян Рогач, который прошел с народом весь его боевой героический путь, деля с ним и радости побед и горести поражений. В Сионе с Яном Рогачем находились лучшие сыны чешского народа, стойкие и мужественные борцы за свободу, предпочитавшие смерть измене знамени с красной чашей, под которым они боролись за счастье своего народа. Здесь же был небольшой польский отряд во главе которого стоял Вышек Рачицкий.
Защитников Сиона было мало, но Сигизмунд боялся их. Он придавал взятию этой крепости особое значение. Призрак новой народной войны вставал перед его глазами при одной мысли о том, что есть еще в Чехии уголок, где гордо реет овеянный победами стяг таборитов. Он боялся, что неприступный Сион станет тем очагом, искры которого разожгут новое революционное движение.
В апреле 1437 г. отряд императорских войск подошел к Сиону. Но наемникам Сигизмунда не удалось добиться успеха, и только в июне императорским отрядам, которыми командовал один из панов-чашников, удалось окружить Сионскую крепость со всех сторон. Началась осада. Осажденные проявили в этой последней борьбе неиссякаемое мужество, отвагу и воинское искусство. Особенно отличился пушкарь Зеленый, меткий огонь которого наносил врагам большие потери и не давал им возможности переправиться через окружавший крепость ров. Но силы были слишком неравны. В сентябре 1437 г. после долгой и упорной обороны крепость была взята. Осаждавшие, несмотря на многократное превосходство, не решились на штурм. Они произвели подкоп, проникли за городские стены, и здесь завязался неравный бой.
Немногие защитники Сиона попали живыми в руки врага. И Сигизмунд хотел во что бы то не стало добиться покорности хотя бы от этих израненных, истощенных длительной осадой соратников Жижки. Но когда их привели к императору, Ян Рогач гордо сказал деспоту: «Лучше б я ослеп, чем видеть тебя, рыжая тварь!» Тогда за пленников взялись палачи. Но никакие пытки не могли сломить стойкости и мужества народных героев, даже под угрозой смерти отказавшихся признать Сигизмунда королем Чехии. 9 сентября все они были казнены в Праге. И на самом верху огромной виселицы, сооруженной по специальному приказу императора, среди пятидесяти двух боевых друзей на золотой цепи был повешен последний гетман народного войска — мужественный Ян Рогач.