В третий боевой поход подводная лодка Миттельштадта вышла 28 июля. Субмарина снова направилась к мысу Ристна, где снова имела несколько возможностей пополнить свой победный список за счет советских подводных лодок, но все вышло наоборот. Вечером 10 августа в 20 милях западнее мыса Ристна немка стала жертвой торпеды «Щ-307».
Второй немецкой подводной лодкой, отличившейся в «Восточном походе», стала «U-149» под командованием капитан-лейтенанта Хорста Хёлтринга. Ее карьера на Балтике была достаточно короткой. За два дня до начала войны подводная лодка заняла район в устье Финского залива, южная граница которого ограничивалась параллелью мыса Ристна. Очень скоро субмарина открыла боевой счет. Разные источники приводят разные даты атаки «U-149» — 26, 27 и даже 28 июня, но в результате сомнений нет. Потоплена «М-99». 11 июля «U-149» прибыла в Готенхафен, где встала на ремонт. Очевидно, причиной повреждений «челнока» стала атака на лодку пары «МБР-2» из 81-й отдельной морской разведывательной авиаэскадрильи 9 июля в 13 милях юго-западнее Ханко. Самолеты сбросили на субмарину четыре 50-кг бомбы и, хотя не добились прямого попадания, наблюдали взрывы вблизи борта цели. На этом участие в войне на востоке для «U-149» закончилось. В середине июля вместо нее против советского флота на Балтике действовала «U-139».
Третья победа немецких подводников на Балтике произошла спустя почти месяц после нападения Германии на СССР. На этот раз отличилась «U-140» (командир капитан-лейтенант Ганс Юрген Хейльригель). В первые дни войны она находилась на позиции у побережья Курляндии между Либавой и Мемелем. Единственный контакт с советским кораблем состоялся 24 июня, когда немцы неудачно двумя торпедами атаковали «С-10». Фронт стремительно откатывался на восток, и вскоре присутствие субмарины в этом районе теряло всякий смысл. 30 июня она была отозвана на базу, но спустя неделю вновь вышла в море. На этот раз подводной лодке предстояло действовать на западных подходах к Ирбенскому проливу. Обнаружив там отсутствие целей, субмарина вскоре была переразвернута на подходах к Соэлавяйну. Здесь немецким подводникам скучать не пришлось, но первые контакты с советскими подлодками удачи не принесли. Атаковать цель так и не удалось. Только вечером 20 июля «U-140» выпустила две торпеды по возвращающейся из похода «С-9». Первая торпеда взорвалась от удара о берег, от второй, выпущенной спустя 11 минут, советская подводная лодка сумела уклониться. Утром 21 июля немцам сопутствовал успех. Торпеда «U-140» поразила «М-94». К счастью для части советского экипажа, подводная лодка затонула не сразу и 11 моряков сумели спастись. Шедшая в паре с «М-94» «М-98» счастливо избежала гибели. Вторая торпеда, выпущенная с «U-140», прошла мимо. Спустя сутки немецкая подводная лодка была перенацелена для действий в районе острова Готска-Санден, где в ночь на 23 июля немцы имели контакт с подводной лодкой типа «Щ». (Вероятно, «Щ-322» либо «Щ-308».) Последняя выпущенная торпеда прошла мимо цели. Израсходовав боезапас, «U-140» 25 июля прибыла в Готенхафен, где вскоре вернулась к выполнению учебных задач.
Действия других немецких подводников на Балтике в 1941 году вполне сравнимы с действиями большинства их советских коллег. «U-139» (командир обер-лейтенант Хорст Эльфе) за два похода (первый — с 16 по 25 июля у пролива Соэлавяйн, второй — с 29 июля по 18 августа предположительно у острова Готска-Санден) контактов с противником не имела вовсе.
«U-142» к началу войны заняла район южнее острова Готланд, где находилась до 11 июля. Противник не был обнаружен. Патрулирование района западнее Моонзундских островов в конце июля — начале августа также не принесло немцам успеха, хотя 28 и 30 июля подводная лодка имела возможность атаковать «Щ-322» и «Л-3», а утром 6 августа «U-142» безрезультатно выпустила одну торпеду по подводной лодке типа «С».
«U-145» (командир капитан-лейтенант Рудольф Франциус) с 20 июня находилась в районе западнее Моонзундских островов и имела два контакта с советскими субмаринами. В первый раз в ночь на 25 июня была обнаружена «Щ-311». Командиры как немецкой, так и советской подводных лодок посчитали себя атакованными и предпочли уклониться погружением. Второй раз «челнок» атаковал одной торпедой «Л-3». Это случилось 3 июля северо-западнее бухты Кихелькона. Торпеда прошла мимо, а советские подводники даже не заметили атаки. Второй выход в море продолжался с 14 по 29 июля. Подводная лодка патрулировала район в устье Финского залива. В это время через район действий «челнока» безнаказанно прошли несколько советских подводных лодок. Немцам пришлось возвращаться на базу ни с чем. С 9 по 28 августа «U-145» находилась в море с задачей патрулирования района севернее мыса Ристна, но снова успеха добиться не смогла.