Путь домой тоже не был легким. 7 июня на минах погиб охотник «МО-102» из состава эскорта. Получил повреждения второй охотник «МО-123». В ночь на 8 июня «Щ-303» прибыла на Лавенсари, 11 июня — в Кронштадт, выдержав в пути налет финской авиации. Учитывая то, что из пяти подводных лодок КБФ, пытавшихся преодолеть противолодочный рубеж противника в 1943 году, на базу вернулась одна «Щ-303», возвращение подводной лодки явилось счастливой звездой для ее экипажа.
Во второй половине 1943 года «Щ-303» встала на капремонт, в ходе которого на подводной лодке установили ГАС «Дракон». За это время на субмарине произошли кадровые изменения: вместо капитана 3-го ранга Травкина, назначенного командиром на «К-52», 9 марта 1944 года в командование «Щ-303» вступил капитан 3-го ранга Ветчинкин Павел Петрович. Летом 1944 года ремонт был завершен. Подводная лодка приступила к отработке курса боевой подготовки. 3 октября при проходе ворот Купеческой гавани в Кронштадте «Щ-303» ударилась о стенку, погнув кронштейн и правый гребной вал, ограждение и баллер кормовых горизонтальных рулей. Устранение повреждений заняло 42 суток. За это время на субмарине вновь сменился командир. 13 ноября им стал капитан 3-го ранга Филов Николай Александрович. Закончив докование, «Щ-303» в начале декабря перешла в Турку, где после выхода Финляндии из войны базировались наши подлодки. 13 декабря в командование «Щ-303» вступил капитан-лейтенант Игнатьев Евгений Александрович.
Утром 17 декабря 1944 года «Щ-303» вновь вышла в боевой поход (сектор № 1 в районе Либавы). 20 декабря подводная лодка была в указанном районе. Слабая подготовка нового командира привела к тому, что при попытке лечь на грунт субмарина несколько раз ударялась о дно. 29 декабря «Щ-303» попыталась атаковать конвой противника, но была обнаружена и подверглась преследованию противолодочных кораблей. 1 января 1945 года силы ПЛО противника вновь бомбили лодку, причем при срочном погружении она снова сильно ударилась о грунт, повредив руль, киль и корпус. Через носовые топливные цистерны начала поступать вода, и субмарина вынуждена была покинуть позицию. 4 января «Щ-303» прибыла в Турку, где встала в док для ремонта, который продлился до 22 февраля.
24 февраля «Ёрш» вновь выходит на позицию. На этот раз в качестве обеспечивающего на борту субмарины в море вышел командир 3-го дивизиона ПЛ капитан 2-го ранга Г. А. Гольдберг. 5 марта «Щ-303» была в указанном районе (позиция № 1 у Либавы). Техническое состояние подводной лодки было достаточно низкое. Шумность механизмов и биение правого вала приводили к частым обнаружениям подводной лодки вражескими кораблями ПЛО. Все же «Щ-303» сумела два раза атаковать. 5 марта торпеды, выпущенные по транспорту из состава конвоя, прошли мимо цели. 8 марта на подводной лодке наблюдали взрыв торпеды, но зарубежные источники эту атаку не комментируют. По советским данным, жертвой этой атаки стал немецкий ТР «Борбек» (6002 брт.), но он был потоплен ВВС КБФ северо-восточнее косы Хель 11 марта 1945 года. Смена позиции ни к чему не привела. В районе Данцигской бухты противолодочная оборона противника была также плотной. 22 марта обнаружившие «Щ-303» немецкие сторожевики преследовали лодку до южной оконечности Готланда. 24 марта комдив принял решение возвращаться на базу. На следующий день субмарина прибыла в Турку, где простояла в ремонте до конца войны.
12 сентября 1945 года «Щ-303» выведена из боевого состава и переквалифицирована в учебную подводную лодку. 9 июня 1949-го она получила обозначение «С-303». 11 сентября 1954 года субмарина разоружена, исключена из состава ВМФ и сдана на слом. В 1961 году разобрана в Ленинграде.
5 боевых походов:
04.07.1942-09.08.1942.
01.10,1942-13.11.1942.
06.05.1943-08.06.1943.
17.12.1944-04.01.1945.
24.02.1945-25.03.1945.
Произвела 9 торпедных атак с выпуском 20 торпед. В результате 20.07.1942 поврежден ТР «Альдебаран» (7891 брт.).
Щ-304 «КОМСОМОЛЕЦ» III СЕРИЯ