В 13 ч. 00 мин. десантный отряд и отряд прикрытия вышли на выполнение задания. От места посадки до нижнего венского моста катера шли строем кильватера. В голове шел десантный отряд, а за ним отряд прикрытия. В это время наши самолеты интенсивно бомбили позиции противника как на побережье, так и в глубине его обороны, а отряд прикрытия и артиллерия Берегового отряда сопровождения обстреливали неприятельские огневые точки. Артиллерия 80-й гвардейской стрелковой дивизии вела огонь, поддерживая наступление своих частей в районе второго венского моста.
Пройдя нижний мост, бронекатера встретили сильный артиллерийско-минометный и пулеметный огонь. Тогда артиллерия Берегового отряда сопровождения и 80-й гвардейской стрелковой дивизии, а также катера поддержки усилили обстрел огневых точек противника. В это время части дивизии неоднократно пытались прорваться ко второму венскому мосту, но успеха не имели.
В 13 ч. 55 мин. бронекатера с десантом подошли к месту высадки. Бронекатер № 234 первым подошел к левому берегу Дуная в 50—60 м ниже второго венского моста и высадил свой десант. Бронекатер № 233 подошел к правому берегу в 70 м ниже моста и там высадил свой десант. В это время отряд прикрытия подошел к мосту и, не прекращая артиллерийского огня по правому и левому берегам реки, открыл пулеметный огонь по мосту. Движение противника по нему прекратилось.
Высадив десант, наши бронекатера в 14 ч. 06 мин. начали отходить под огнем противника. В бронекатер № 3 попало два 88-мм и два 20-мм снаряда, был ранен один матрос, катер получил несколько пробоин, но ход не потерял. На катере были подожжены дымовые шашки, и он продолжал вести бой. В 14 ч. 11 мин. в левый борт бронекатера № 233 попал 88-мм снаряд. Катер потерял ход, так как был разбит мотор. Возникший пожар был ликвидирован личным составом. Бронекатер № 232 подошел на помощь подбитому катеру и на буксире вывел его из-под огня.
Высадившись на берег, десант занял оборону на правом и левом берегах Дуная. Мост был захвачен и разминирован.
Потери личного состава на катерах составили: один человек убит, ранено семь. Катера израсходовали 76-мм снарядов — 362, патронов ДШК — 5400, винтовочных патронов — 1500.
12 апреля на венском направлении корабли флотилии, действуя с огневых позиций у правого и левого берега реки, артиллерийским огнем поддерживали действия десанта, высаженного у второго венского моста, и содействовали наступлению приречных частей армии. Бронекатера израсходовали 1132 снаряда, а минные катера — 285 мин (реактивных снарядов). Одновременно с кораблями огневую поддержку десанту и наступавшим частям армии оказывала артиллерия Берегового отряда сопровождения флотилии. Были подавлены две батареи противника, девять пулеметных точек, разбиты два орудия, подбито самоходное орудие, взорван склад боеприпасов, отбиты две контратаки, рассеяно и частично уничтожено до батальона пехоты противника.
Наши корабли и батареи были обстреляны артиллерийским и минометным огнем противника. Корабли потерь и повреждений не имели. На 492-й подвижной батарее Берегового отряда сопровождения, находившейся юго-восточнее второго венского моста, артиллерийским огнем противника было подбито одно 76-мм самоходное орудие, из личного состава батареи убит командир орудия и ранены пять человек.
13 апреля войска 3-го Украинского фронта при содействии войск 2-го Украинского фронта после упорных уличных боев овладели столицей Австрии городом Вена — стратегически важным узлом обороны немцев, прикрывавшим пути к южным районам Германии.
За отличные боевые действия при овладении Веной Верховный Главнокомандующий в приказе № 334 объявил благодарность кораблям и частям Дунайской флотилии контр-адмирала Холостякова, капитан-лейтенанта Барботько, капитан-лейтенанта Великого.
По приказу Ставки Верховного Главнокомандования за № 11067 Дунайская флотилия с 0 ч. 00 мин. 17 апреля перешла в оперативное подчинение командующему 3-м Украинским фронтом.
В течение дня 13 апреля корабли флотилии и батареи Берегового отряда сопровождения артиллерийским огнем содействовали наступлению войск 2-го и 3-го Украинских фронтов. Для предотвращения возможного противодействия со стороны вражеских кораблей наши бронекатера №№ 71, 221, 322, 339, 422 и 423 (2-й Сулинской бригады) несли дозор на 2019 км Дуная. Содействуя наступлению сухопутных войск, корабли флотилии израсходовали 850 снарядов, а батареи флотилии — 317 снарядов.