В этих боях со стороны флотилии участвовали 35 кораблей (из них 22 бронекатера и 13 минных катеров), две подвижные батареи и рота автоматчиков Берегового отряда сопровождения, а также оперативно приданная флотилии 83-я отдельная бригада морской пехоты.
14 апреля войска 2-го Украинского фронта продолжали вести наступательные бои по левому берегу Дуная на территории Австрии и одновременно вели наступление на территории Чехии и Словакии.
Войска 3-го Украинского фронта, продолжая наступление вдоль правого берега Дуная, форсировали реку Трайзен (приток Дуная) и заняли город Герцогенбург.
Контр-адмирал Холостяков приказал 14 апреля: а) всем кораблям, находившимся в районе Вены, сосредоточиться в ее предместье Пуссдорф для содействия нашим войскам; б) Береговому отряду сопровождения к исходу 16 апреля перейти на новые огневые позиции — в район Тулльн.
Бронекатера №№ 32, 75, 121, 215 и 314 1-й Керченской бригады артиллерийским огнем поддерживали наступление 223-й стрелковой дивизии 75-го стрелкового корпуса по левому берегу Дуная на населенные пункты Аспери и Штадлау, израсходовав 225 снарядов.
С 21 ч. 15 мин. до 21 ч. 45 мин. минные катера № 18 и №30 2-й Сулинской бригады вели минометный огонь по отступавшему противнику в районе западнее Штадлау, израсходовав 26 мин.
В период боев за Вену с 6 по 14 апреля корабли Дунайской флотилии и Береговой отряд сопровождения нанесли противнику следующие потери: рассеяно и частично уничтожено до четырех полков пехоты, взорвано пять складов с военным имуществом и боезапасом, разбито 13 танков, два самоходных орудия, 35 автомашин, 51 повозка, уничтожено 90 огневых точек, подавлено восемь батарей и 35 других огневых точек, отбито до 15 контратак пехоты и танков. Батареи израсходовали 122-мм снарядов — 749, 75-мм снарядов — 1004,
15 апреля войска 2-го Украинского фронта, продолжая наступление, подошли к району Корнейбург. В этот же район вышли войска 3-го Украинского фронта, форсировавшие Дунай.
Указом Президиума Верховного Совета СССР 3-й дивизион бронекатеров 1-й Керченской Краснознаменной бригады речных кораблей Дунайской флотилии за отличные боевые действия 15 апреля был награжден орденом Александра Невского.
Командующий флотилией приказал командиру 2-й Сулинской бригады речных кораблей произвести разведку правого берега Дуная в районе Корнейбург — Штоккерау. В задачу разведки входило выяснить возможности прохода кораблей в район подорванных венских мостов, выяснить минную обстановку и возможности для высадки десанта в разведываемом районе. Высадка десанта была намечена в ночь на 16 апреля. Разведке было приказано также установить связь с частями 46-й армии для взаимодействия с ними при продвижении их вверх по реке.
Корабли 2-й Сулинской бригады и оперативно подчиненные ей корабли 1-й Керченской бригады к исходу дня 15 апреля сосредоточились в предместье Вены в районе Пуссдорф для предстоявших боевых действий. Здесь в 500 м ниже первого венского моста находились бронекатера №№ 3, 6, 32, 33, 71, 75, 121, 132, 154, 162, 164, 215, 234, 243, 314, 331 и минные катера № 17, 18, 21, 22, 23, 24, 25, 29, 30, 31.
17 апреля разведчики флотилии выяснили, что район взорванных венских мостов для кораблей флотилии проходим. Для ограждения фарватера на всех мостах были выставлены отличительные знаки (прямоугольные щиты, окрашенные по диагонали в белый и красный цвета). Тулльнский мост тоже был взорван противником, и проход здесь был возможен лишь у правого берега, где сохранилась ферма моста. Ширина этого прохода была 10—15 м при глубинах 3—5 м.
В затоне Кюхелау (в районе Вены) противник при отступлении оставил югославский пароход «Задар», итальянский буксир «Пьемонте», шесть катеров, двенадцать барж, груженых строительными материалами и продовольствием, один перегружатель и одну землечерпалку. Все суда были в исправном состоянии. В том же затоне были затоплены до 20 судов.
20 апреля войска 2-го и 3-го Украинских фронтов, преодолевая сопротивление противника, продолжали наступательные бои в районе Штоккерау.
В районе Креме — Йббе два монитора противника[26] прикрывали до 300 различных судов, отходивших вверх по реке. Одиночные немецкие самолеты вели разведку боевых порядков, тылов и переправ наших войск.
Нарком ВМФ приказал Дунайской флотилии обеспечить судоходство в верховьях Дуная и поставил как первоочередную задачу перед флотилией к 1 мая 1945 г. произвести траление реки и открыть фарватер в районе Новисад — Вена для нормального судоходства.