Капитан 1 ранга Свердлов доложил маршалу Толбухину: «Корабли флотилии к смотру готовы!»
В сопровождении вице-адмирала Холостякова и других моряков маршал поднялся на бронекатер гвардии старшего лейтенанта Ващенко. Горнист возвестил о начале торжественного смотра. Катер начал медленно проходить вдоль строя кораблей. Маршал Толбухин, обращаясь к замершим на палубах в стройных шеренгах матросам, старшинам и офицерам, поздравил их с Днем Победы. Поздравление было встречено громовым матросским «ура», которое волнами перекатывалось по всему Венскому затону.
17 мая 1945 г. флотилия была награждена орденом Кутузова II степени.
В последние 8 месяцев войны Дунайская флотилия оказала неоценимую помощь Красной армии в освобождении Румынии, Болгарии, Югославии, Венгрии, Чехословакии и восточной части Австрии. Тысячи танков, самоходных и буксируемых орудий были перевезены флотилией как с одного берега на другой, так и на десятки километров вверх по Дунаю. Огромную роль сыграл огонь пушек и реактивных установок судов флотилии в поддержке наших частей.
Наконец, о чем не всегда вспоминают наши историки, Дунайская флотилия охраняла тыл Красной армии на протяжении почти двух тысяч километров Дуная. Пушки наших мониторов и бронекатеров оказывали очень большое психологической действие на население придунайских стран, в которых после освобождения их Красной армией была крайне сложная политическая обстановка. Дело в том, что определенная часть населения этих стран не была заинтересована в нахождении Красной армии на их территории, а правящие круги Англии и США строили планы создания так называемой «Дунайской конфедерации». Главой конфедерации должен был стать принц Отто Габсбург (Отто фон Эстеррейх, проживавший с 1944 г. в США). Людовик XIII как-то сказал, что «пушки — последний довод королей». В придунайских странах танки Красной армии и корабли Дунайской флотилии были последним доводом товарища Сталина в пользу изменения политического и экономического строя этих государств.
После 9 мая 1945 г. объем боевого траления Дунайской флотилии не уменьшился, и война для советских моряков еще продолжалась. Во второй половине 1945 г. в наиболее опасных от мин районах территориальных вод Болгарии, Югославии, Венгрии, Чехословакии и Австрии, на участках общей протяженностью в 915 км, судовой ход был расширен до 170—200 м. За этот период тральщики прошли с тралами свыше 600 тыс. км, уничтожили более 30 мин.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 6 июля 1945 г. 1-я бригада траления была награждена орденом Красного Знамени.
В конце 1945 г. тральные силы флотилии были снова сведены в одну бригаду, югославские и болгарские тральщики действовали в своих территориальных водах совместно с тральными силами нашей Дунайской флотилии. В 1946—1947 гг. Бригада траления продолжала расширение фарватеров на Дунае и уничтожение минных заграждений. Планы боевого траления составлялись штабом флотилии на каждую кампанию с учетом заявок придунайских стран. За каждым дивизионом тральщиков закреплялись определенные боевые участки, в границах которых они производили тральные работы и отвечали за безопасность плавания судов. Для навигационно-гидрографического обеспечения тральных работ и плавания со второй половины 1945 г. было организовано три гидрографических района.
Режим судоходства на Дунае регламентировался и поддерживался Дунайской флотилией. Характерно, что на протраленных флотилией фарватерах за эти два года не подорвалось ни одно судно. В 1947 г. подорвались четыре судна, но случилось это потому, что их капитаны нарушили режим судоходства и вели свои суда за пределами протраленных фарватеров.
Придавая большое значение безопасности плавания на Дунае, Совет Министров СССР 20 октября 1947 г. вынес специальное постановление, которым обязал Военно-Морские Силы СССР к ноябрю 1948 г. завершить здесь полную ликвидацию минных заграждений. В кампанию 1948 г. флотилия выполнила большой объем тральных работ. Так как в 1946—1947 гг. не было случаев подрыва судов на минах в границах протраленных фарватеров, в 1948 г. продолжались расширение судового хода и полная ликвидация мин на всем русле Дуная. К сентябрю 1948 г. протраленная кораблями Дунайской флотилии площадь (за четыре года военного и послевоенного траления) составляла 950 кв. км. Воды Дуная — важнейшая артерия экономической связи между придунайскими странами — стали безопасными от мин.